[發明專利]一種指導卵巢癌鉑耐藥患者用藥及療效評估的標志物、檢測試劑盒及檢測方法

在審

• 申請號: 202111137834.3
• 申請日: 2021-09-27
• 公開（公告）號: CN113718034A
• 公開（公告）日: 2021-11-30
• 發明（設計）人: 吳令英;程海霞;梁磊磊
• 申請（專利權）人: 中國醫學科學院腫瘤醫院
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12N15/11
• 代理公司: 北京睿智保誠專利代理事務所(普通合伙) 11732
• 代理人: 周新楣

1.一種指導卵巢癌鉑耐藥患者用藥及療效評估的標志物，其特征在于，所述標志物包括ctDNA的突變頻率。

2.根據權利要求1所述的標志物，其特征在于，通過Raceseq測序檢測ctDNA的突變頻率。

3.一種用于指導卵巢癌鉑耐藥患者用藥及療效評估的標志物的試劑盒，其特征在于，包括檢測血漿樣本中的ctDNA的突變頻率的試劑。

4.一種檢測ctDNA的突變頻率的方法，其特征在于，包括如下步驟：

(1)對腫瘤組織進行外顯子測序，獲得腫瘤組織標本中突變基因的信息；

(2)選取突變位點，對每個突變位點設計相應引物；

(3)提取血漿的cfDNA，進行甲基化建庫，然后利用步驟(2)得到的引物進行Raceseq測序；

(4)分析Raceseq測序的測序結果獲得ctDNA的突變頻率。

5.根據權利要求4所述的一種檢測ctDNA的突變頻率的方法，其特征在于，所述Raceseq測序的測序結果的分析方法為：將DNA插入片段長度相同、DNA插入片段兩端斷點、兩端的錨定序列均相同的初始DNA單鏈測序數據回溯到一個分子簇；將插入片段長度一致并且除突變點外的序列一致、分子簇兩端的錨定序列相同但位置相反的同一個起始DNA雙鏈的分子簇標記為一對duplex分子簇；對某一突變來說，若至少有一對duplex分子簇支持，即判斷為真，若無duplex分子簇支持，那么至少有4個分子簇支持，即判斷為真。

6.根據權利要求5所述的一種檢測ctDNA的突變頻率的方法，其特征在于，若Raceseq測序檢出簇的個數≧4，則判定為真突變，若Raceseq測序檢出簇的個數＜4，則判定為假突變。