[發明專利]鐵死亡模型構建方法與應用

在審

• 申請號: 202111101096.7
• 申請日: 2021-09-18
• 公開（公告）號: CN113782090A
• 公開（公告）日: 2021-12-10
• 發明（設計）人: 王芬;肖士郎;劉曉明;袁玲芝
• 申請（專利權）人: 中南大學湘雅三醫院
• 主分類號: G16B20/20
• 分類號: G16B20/20;G16H50/30;G16H50/70
• 代理公司: 長沙軒榮專利代理有限公司 43235
• 代理人: 李崇章

1.一種鐵死亡模型構建方法，其特征在于，所述構建方法具體包括：

獲取多個胃癌隊列的基因表達芯片數據并進行預處理后進行合并，獲得合并隊列數據；并從所述合并隊列數據中篩選出多個表達水平變化大的鐵死亡調控分子；

根據篩選出來的鐵死亡調控分子的表達量，采用共識聚類方法將胃癌隊列分成3種胃癌亞型；

將胃癌隊列中的胃癌亞型之間進行基因表達差異分析，獲得差異表達基因；

采用單基因Cox回歸分析從所述差異表達基因中篩選出生存預后相關差異基因數據庫，所述生存預后相關差異基因數據庫包括生存預后相關差異基因及其回歸系數；

獲取待分析患者的生存相關差異基因i，統計所述生存相關差異基因i的表達量Exp_i，并根據所述生存預后相關差異基因數據庫中生存相關差異基因i對應的回歸系數beta_i，構建鐵死亡模型為：

鐵死亡分數＝∑_ibeta_i*Exp_i。

2.根據權利要求1所述的鐵死亡模型構建方法，其特征在于，所述獲取多個胃癌隊列的基因表達芯片數據并進行預處理后進行合并步驟中的預處理具體包括：

將獲取的多個胃癌隊列基因表達芯片數據利用“affy”(R包)的背景調整及分數歸一化進行數據標準化，并通過“sva”(R包)的“combat”算法去除隊列之間的批次效應。

3.根據權利要求1所述的鐵死亡模型構建方法，其特征在于，所述從所述合并隊列數據中篩選出多個表達水平變化大的鐵死亡調控分子步驟具體包括：

獲取已報道的鐵死亡調控分子，以絕對中位差≥1為界限，篩選出多個在合并隊列數據中表達水平變化大的鐵死亡調控分子。

4.權利要求1-3任意所述的鐵死亡模型在預測生存預后中的應用。

5.權利要求1-3任意所述的鐵死亡模型在預測胃癌患者藥物敏感性及免疫治療效果中的應用。