[發(fā)明專利]基于KASP技術(shù)開發(fā)的用于茶樹品種鑒定的核心SNP標記

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 202111009742.7
• 申請日: 2021-08-30
• 公開（公告）號: CN113832243B
• 公開（公告）日: 2022-05-17
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 李紅建;吳華玲;方開星;王青;姜曉輝;秦丹丹;倪爾東;王秋霜;潘辰東;李波
• 申請（專利權(quán)）人: 廣東省農(nóng)業(yè)科學院茶葉研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 廣州粵高專利商標代理有限公司 44102
• 代理人: 段卉

1.一種檢測茶樹基因組的30個SNP位點的物質(zhì)在如下任何一種中的應(yīng)用：

茶樹品種進行基因分型；

鑒別或輔助鑒別茶樹品種；

檢測兩個茶樹品種的相似性；

所述30個SNP位點如下：

所述SNP位點1位于茶樹基因組Scaffold30:5540851，其堿基為T或C；

所述SNP位點2位于茶樹基因組Scaffold154:3234153，其堿基為G或A；

所述SNP位點3位于茶樹基因組Scaffold204:616376，其堿基為A或G；

所述SNP位點4位于茶樹基因組Scaffold271:731317，其堿基為T或C；

所述SNP位點5位于茶樹基因組Scaffold447:471126，其堿基為T或C；

所述SNP位點6位于茶樹基因組Scaffold465:113375，其堿基為G或A；

所述SNP位點7位于茶樹基因組Scaffold524:138847，其堿基為C或G；

所述SNP位點8位于茶樹基因組Scaffold712:1923571，其堿基為A或C；

所述SNP位點9位于茶樹基因組Scaffold730:2485125，其堿基為A或G；

所述SNP位點10位于茶樹基因組Scaffold751:785736，其堿基為G或T；

所述SNP位點11位于茶樹基因組Scaffold966:875493，其堿基為G或A；

所述SNP位點12位于茶樹基因組Scaffold968:331490，其堿基為T或C；

所述SNP位點13位于茶樹基因組Scaffold1154:3443945，其堿基為T或C；

所述SNP位點14位于茶樹基因組Scaffold1496:1222981，其堿基為G或A；

所述SNP位點15位于茶樹基因組Scaffold1609:330430，其堿基為C或A；

所述SNP位點16位于茶樹基因組Scaffold1630:523864，其堿基為G或A；

所述SNP位點17位于茶樹基因組Scaffold1749:443540，其堿基為G或T；

所述SNP位點18位于茶樹基因組Scaffold1752:204591，其堿基為A或G；

所述SNP位點19位于茶樹基因組Scaffold2500:575332，其堿基為G或A；

所述SNP位點20位于茶樹基因組Scaffold2547:285704，其堿基為C或T；

所述SNP位點21位于茶樹基因組Scaffold2840:1074974，其堿基為A或C；

所述SNP位點22位于茶樹基因組Scaffold2936:133561，其堿基為A或G；

所述SNP位點23位于茶樹基因組Scaffold3102:1137721，其堿基為G或A；

所述SNP位點24位于茶樹基因組Scaffold3135:796917，其堿基為G或A；

所述SNP位點25位于茶樹基因組Scaffold3315:745861，其堿基為A或G；

所述SNP位點26位于茶樹基因組Scaffold3538:461720，其堿基為C或T；

所述SNP位點27位于茶樹基因組Scaffold4372:528796，其堿基為T或C；

所述SNP位點28位于茶樹基因組Scaffold5112:422952，其堿基為A或G；

所述SNP位點29位于茶樹基因組Scaffold7623:70503，其堿基為C或T；

所述SNP位點30位于茶樹基因組Scaffold21357:219587，其堿基為C或G；

所述茶樹基因組為茶樹基因組數(shù)據(jù)庫的“舒茶早”CSS栽培種茶樹基因組；

所述茶樹品種為白毫早、福建水仙、鴻雁7、單叢2號、鴻雁12號、鴻雁1號、鴻雁11號、嶺頭單叢、碧云、樂昌白毛1號、英紅9號、英紅1號、馬圖茶、湘波綠、楮葉齊、東湖早、上梅州種、南江大葉、蒲坑茶、天竺山茶、五嶺紅、黃葉水仙、黑葉水仙、鐵觀音、八仙茶、福鼎大白茶、福云6號、福云7號、桂紅3號、桂紅4號、龍井43、安吉白茶、本山1號、政和大白茶、斯里蘭卡1號、堯山秀綠、桂綠1號、肯尼亞301/3、鳳園春、桂香18號、福鼎大毫茶、桂香22號、青心烏龍、浙農(nóng)21號、金桂觀音、丹桂、紅芽佛手、黃金桂、九龍袍、紫牡丹、金牡丹、春蘭、早春毫、黃旦、藤茶、碧香早、菊花春、黔湄419、勁峰、龍井長葉、高芽齊、浙農(nóng)12號、錫茶5號、青峰、翠峰、錫茶11號、格魯吉亞6號、黔湄809、臺茶13號、云魂、矮豐和/或苦茶11號。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的應(yīng)用，其特征在于，所述物質(zhì)包含引物組合1～30 ，

所述引物組合1包括核苷酸序列如SEQ ID NO:1～3所示的引物組合；

所述引物組合2包括核苷酸序列如SEQ ID NO:4～6所示的引物組合；

所述引物組合3包括核苷酸序列如SEQ ID NO:7～9所示的引物組合；

所述引物組合4包括核苷酸序列如SEQ ID NO:10～12所示的引物組合；

所述引物組合5包括核苷酸序列如SEQ ID NO:13～15所示的引物組合；

所述引物組合6包括核苷酸序列如SEQ ID NO:16～18所示的引物組合；

所述引物組合7包括核苷酸序列如SEQ ID NO:19～21所示的引物組合；

所述引物組合8包括核苷酸序列如SEQ ID NO:22～24所示的引物組合；

所述引物組合9包括核苷酸序列如SEQ ID NO:25～27所示的引物組合；

所述引物組合10包括核苷酸序列如SEQ ID NO:28～30所示的引物組合；

所述引物組合11包括核苷酸序列如SEQ ID NO:31～33所示的引物組合；

所述引物組合12包括核苷酸序列如SEQ ID NO:34～36所示的引物組合；

所述引物組合13包括核苷酸序列如SEQ ID NO:37～39所示的引物組合；

所述引物組合14包括核苷酸序列如SEQ ID NO:40～42所示的引物組合；

所述引物組合15包括核苷酸序列如SEQ ID NO:43～45所示的引物組合；

所述引物組合16包括核苷酸序列如SEQ ID NO:46～48所示的引物組合；

所述引物組合17包括核苷酸序列如SEQ ID NO:49～51所示的引物組合；

所述引物組合18包括核苷酸序列如SEQ ID NO:52～54所示的引物組合；

所述引物組合19包括核苷酸序列如SEQ ID NO:55～57所示的引物組合；

所述引物組合20包括核苷酸序列如SEQ ID NO:58～60所示的引物組合；

所述引物組合21包括核苷酸序列如SEQ ID NO:61～63所示的引物組合；

所述引物組合22包括核苷酸序列如SEQ ID NO:64～66所示的引物組合；

所述引物組合23包括核苷酸序列如SEQ ID NO:67～69所示的引物組合；

所述引物組合24包括核苷酸序列如SEQ ID NO:70～72所示的引物組合；

所述引物組合25包括核苷酸序列如SEQ ID NO:73～75所示的引物組合；

所述引物組合26包括核苷酸序列如SEQ ID NO:76～78所示的引物組合；

所述引物組合27包括核苷酸序列如SEQ ID NO:79～81所示的引物組合；

所述引物組合28包括核苷酸序列如SEQ ID NO:82～84所示的引物組合；

所述引物組合29包括核苷酸序列如SEQ ID NO:85～87所示的引物組合；

所述引物組合30包括核苷酸序列如SEQ ID NO:88～90所示的引物組合。