[發(fā)明專利]水稻耐旱性調(diào)控基因OsNAC6的分子標記及其應(yīng)用

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 202111007901.X
• 申請日: 2021-08-27
• 公開（公告）號: CN113862387B
• 公開（公告）日: 2023-10-24
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 劉鴻艷;馬孝松;羅利軍;李恩熙
• 申請（專利權(quán)）人: 上海市農(nóng)業(yè)生物基因中心
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

本發(fā)明提供了一種水稻耐旱性調(diào)控基因OsNAC6的分子標記，通過發(fā)明人對于水稻DNA基因組與耐旱性能地深入分析，篩選得到了與耐旱性能相關(guān)地分子標記OsNAC6_InDel_221，并設(shè)計得到合適地擴增序列，用于通過該分子標記篩選耐旱基因型，從而能夠快速判斷水稻的基因型以加快育種進程。該標記通過序列差異設(shè)計不存在遺傳交換，準確性高；直接用于瓊脂糖凝膠電泳檢測，更為簡便；為共顯性標記，可以檢測純合和雜合個體，縮短育種周期，提高育種效率。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于分子遺傳學領(lǐng)域，具體涉及一個水稻耐旱性調(diào)控基因OsNAC6的分子標記及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

水稻是我國最重要的糧食作物。水稻產(chǎn)量對我國糧食安全起著重要的作用。近年來，隨著全球氣候變暖，干旱、高溫等自然災(zāi)害頻發(fā)，對農(nóng)業(yè)生產(chǎn)造成了嚴重的威脅。水稻是用水大戶，水稻生產(chǎn)消耗了我國50％的淡水資源。然而我國是世界13個貧水國之一，我國人均水資源占有量僅2400m³，淡水資源僅為世界人均的1/4。

干旱是影響水稻生長發(fā)育及產(chǎn)量的主要非生物脅迫。目前，中國旱災(zāi)發(fā)生的頻率和范圍在加大，培育耐旱水稻品種是抵御干旱脅迫的一種可行的途徑。但水稻的耐旱性是多基因控制的復(fù)雜性狀，同時還顯著地與環(huán)境互作，更加劇了水稻耐旱機制的復(fù)雜性，我國水稻的生產(chǎn)正面臨著水資源短缺危機。因此，在育種過程中我們需要選育耐旱水稻品種才能保證水稻在遭遇干旱脅迫時的高產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)。

發(fā)明內(nèi)容

基于此，本發(fā)明的目的在于提供一種水稻耐旱性調(diào)控基因OsNAC6的分子標記，具體技術(shù)方案如下：

一種水稻耐旱性調(diào)控基因OsNAC6的分子標記，所述分子標記為OsNAC6_InDel_221，用于擴增所述分子標記的引物的核苷酸序列如下：

OsNAC6_InDel_221F：5’-TAGCTAAATCCCGAAAGCAAATAAG-3’SEQ ID NO.1；

OsNAC6_InDel_221R：5’-CCACCATCGGCTTCCTCT-3’SEQ ID NO.2。

在其中一些實施例中，所述水稻耐旱性調(diào)控基因OsNAC6的分子標記位于1號染色體；優(yōu)選地，由核苷酸序列為SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2的引物對在基因組位置上下游200bp內(nèi)擴增得到。

本發(fā)明還提供了一種分子標記OsNAC6_InDel_221在檢測和/或預(yù)測水稻的耐旱性中的應(yīng)用。

本發(fā)明還提供了一種分子標記OsNAC6_InDel_221在水稻育種中的應(yīng)用。

具體地，所述水稻育種包括：

(1)檢測、預(yù)測水稻的耐旱性；和/或

(2)鑒定水稻耐旱性調(diào)控基因OsNAC6的基因型；

篩選耐旱水稻品種。

具體地，所述篩選耐旱品種的判斷標準為：

基因組DNA核苷酸序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的引物擴增后，電泳顯示329bp的單條帶表示所述樣品含有強耐旱品種珍汕97B等位基因型；電泳顯示550bp的單條帶表示所述樣品含有不耐旱的品種IRAT109等位基因型；電泳顯示329bp和550bp兩條帶表示所述樣品為OsNAC6雜合基因型。

本發(fā)明還提供了一種使用水稻耐旱性調(diào)控基因OsNAC6的分子標記基因型鑒定及水稻育種的方法，包括以下步驟：

提取供試水稻樣品基因組DNA；

利用核苷酸序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的引物對步驟1)中所提取基因組進行PCR擴增，獲得擴增產(chǎn)物；

瓊脂糖凝膠檢測擴增產(chǎn)物。