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[發(fā)明專利]基于空頻域混合式重建的超分辨結(jié)構(gòu)光照明顯微成像方法有效

專利信息
申請(qǐng)?zhí)枺?/td> 202110985056.7 申請(qǐng)日: 2021-08-25
公開(公告)號(hào): CN113670878B 公開(公告)日: 2022-09-27
發(fā)明(設(shè)計(jì))人: 汪召軍;雷銘;梁言生 申請(qǐng)(專利權(quán))人: 西安交通大學(xué)
主分類號(hào): G01N21/64 分類號(hào): G01N21/64
代理公司: 北京市誠(chéng)輝律師事務(wù)所 11430 代理人: 岳東升;楊帥峰
地址: 710049 陜西省西*** 國(guó)省代碼: 陜西;61
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摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 基于 空頻域 混合式 重建 分辨 結(jié)構(gòu) 照明 顯微 成像 方法
【權(quán)利要求書】:

1.一種基于空頻域混合式重建的超分辨結(jié)構(gòu)光照明顯微成像方法,其特征在于:所述基于空頻域混合式重建的超分辨結(jié)構(gòu)光照明顯微成像方法包括以下步驟:

1)產(chǎn)生條紋狀照明光場(chǎng),條紋狀照明光場(chǎng)的強(qiáng)度分布表示為公式(1):

其中:

r為二維平面的坐標(biāo);

d為不同的條紋方向,d=1,2,3;

i為不同的相移步數(shù),i=1,2,3;

Id為條紋狀照明光場(chǎng)的平均光強(qiáng);

md為條紋狀照明光場(chǎng)的調(diào)制度;

kd為條紋的波矢量;

為當(dāng)前條紋狀照明光場(chǎng)對(duì)應(yīng)的相位;

2)利用步驟1)得到的條紋狀照明光場(chǎng)分別在不同的條紋方向以及不同的相移步數(shù)的情況下照明并激發(fā)待測(cè)樣品產(chǎn)生熒光信號(hào);

3)采集熒光信號(hào),獲得由不同的條紋狀照明光場(chǎng)激發(fā)的原始熒光圖像,具體是:面陣數(shù)字相機(jī)分別采集由步驟2)產(chǎn)生的熒光信號(hào),獲得由不同的條紋狀照明光場(chǎng)激發(fā)的原始熒光圖像Dd,i(r),其中:r為二維平面的坐標(biāo);d是不同的條紋方向,d=1,2,3;i指示不同的相移步數(shù),i=1,2,3;

4)若原始熒光圖像中的不包括離焦背景,則執(zhí)行步驟5);若原始熒光圖像中包括離焦背景,則執(zhí)行步驟6);

5)利用空頻域混合式重建算法處理不包括離焦背景的原始熒光圖像,獲得超分辨圖像,具體是:

5.1)計(jì)算每幅原始熒光圖像對(duì)應(yīng)的權(quán)重圖像wd,i(r):

根據(jù)每個(gè)條紋狀照明光場(chǎng)的調(diào)制度md、波矢量kd以及各條紋狀照明光場(chǎng)的相位計(jì)算出每幅原始熒光圖像對(duì)應(yīng)的權(quán)重圖像wd,i(r);

5.2)對(duì)原始熒光圖像進(jìn)行濾波:

設(shè)光學(xué)系統(tǒng)的光學(xué)傳遞函數(shù)為H(k);

對(duì)原始熒光圖像分別以光學(xué)系統(tǒng)的光學(xué)傳遞函數(shù)的共軛H*(k)為濾波器進(jìn)行低通濾波,得到濾波圖像;

5.3)點(diǎn)乘:

將濾波圖像分別與權(quán)重圖像wd,i(r)相點(diǎn)乘,并將所有相乘的結(jié)果疊加,得到未去卷積的超分辨圖像ISR_woDeconv(r);

5.4)去卷積:

利用未去卷積的超分辨圖像ISR_woDeconv(r)和擴(kuò)展光學(xué)傳遞函數(shù)的平方完成去卷積運(yùn)算,獲得最終的超分辨圖像;

所述擴(kuò)展光學(xué)傳遞函數(shù)的平方是將|H(k)|2按照不同的波矢量kd進(jìn)行平移、疊加得到的;

其中:

所述步驟5.1)中原始熒光圖像對(duì)應(yīng)的權(quán)重圖像wd,i(r)的表達(dá)式是:

其中:

md為條紋狀照明光場(chǎng)的調(diào)制度;

kd為波矢量;

為條紋狀照明光場(chǎng)的初始相位;

為相移量;

所述步驟5.2)中光學(xué)系統(tǒng)的光學(xué)傳遞函數(shù)為H(k)的表達(dá)式是:

其中:

所述步驟5.2)中進(jìn)行低通濾波的具體實(shí)現(xiàn)方式是:以光學(xué)系統(tǒng)的光學(xué)傳遞函數(shù)H(k)的共軛分布H*(k)為濾波器,對(duì)步驟3)所拍攝的原始熒光圖像分別低通濾波,得到濾波圖像Dfd,i(r);

Dfd,i(r)=ifft(fft(Dd,i)·H*(k));

所述步驟5.3)中未去卷積的超分辨圖像ISR_woDeconv(r)的表達(dá)式是:

其中:wd,i(r)為原始熒光圖像對(duì)應(yīng)的權(quán)重圖像;

所述步驟5.3)中的去卷積運(yùn)算是指維納去卷積、Richardson-Lucy去卷積、TotalVariation去卷積或Hessian去卷積;

當(dāng)所述去卷積運(yùn)算為維納去卷積時(shí),所述維納去卷積的表達(dá)式為:

其中:

A(k)為切趾函數(shù);

k代表頻譜空間的二維坐標(biāo);

α為維納去卷積參數(shù);

所述切趾函數(shù)的表達(dá)式為

其中,kd為擴(kuò)展頻譜的最大范圍對(duì)應(yīng)的頻率;

所述步驟5.4)中擴(kuò)展光學(xué)傳遞函數(shù)的平方的表達(dá)式是:

6)利用空頻域混合式重建算法處理包括離焦背景的原始熒光圖像,獲得具有層析效果的超分辨圖像,具體是:

6.1)計(jì)算每幅原始熒光圖像對(duì)應(yīng)的權(quán)重圖像wd,i(r):

根據(jù)每個(gè)條紋狀照明光場(chǎng)的調(diào)制度md、波矢量kd以及各條紋狀照明光場(chǎng)的相位計(jì)算出每幅原始熒光圖像對(duì)應(yīng)的權(quán)重圖像wd,i(r);

6.2)對(duì)原始熒光圖像進(jìn)行濾波:

設(shè)光學(xué)系統(tǒng)的光學(xué)傳遞函數(shù)為H(k),并引入衰減函數(shù)[1-a(k)],其中a(k)是高斯分布;對(duì)步驟3)所拍攝的原始熒光圖像分別以衰減的光學(xué)傳遞函數(shù)的共軛H*(k)[1-a(k)]為濾波器進(jìn)行帶通濾波,得到濾波圖像;

6.3)點(diǎn)乘:

將濾波圖像分別與權(quán)重圖像wd,i(r)相點(diǎn)乘,并將所有相乘的結(jié)果疊加,得到未去卷積的超分辨圖像ISR_woDeconv_att(r);

6.4)去卷積:

利用未去卷積的超分辨圖像ISR_woDeconv_att(r)和擴(kuò)展的衰減的光學(xué)傳遞函數(shù)的平方完成去卷積運(yùn)算,獲得最終的具有層析效果的超分辨圖像;

所述擴(kuò)展的衰減的光學(xué)傳遞函數(shù)的平方是將|H(k)|2[1-a(k)]按照不同的波矢量kd進(jìn)行平移、疊加得到的;

其中,所述步驟6.1)中原始熒光圖像對(duì)應(yīng)的權(quán)重圖像wd,i(r)的表達(dá)式是:

其中:

md為條紋狀照明光場(chǎng)的調(diào)制度;

kd為波矢量;

為條紋狀照明光場(chǎng)的初始相位;

為相移量;

所述步驟6.2)中光學(xué)系統(tǒng)的光學(xué)傳遞函數(shù)為H(k)的表達(dá)式是:

其中:

所述步驟6.2)中的衰減函數(shù)的表達(dá)式是

其中:

aatt為衰減幅度參數(shù),取值范圍為從0~1;

kσ為可調(diào)的經(jīng)驗(yàn)參數(shù);

所述步驟6.2)中進(jìn)行帶通濾波的具體實(shí)現(xiàn)方式是:以光學(xué)系統(tǒng)的衰減的光學(xué)傳遞函數(shù)H(k)[1-a(k)]的共軛分布H*(k)[1-a(k)]為濾波器;對(duì)步驟3)所拍攝的原始熒光圖像分別帶通濾波,得到濾波圖像Dfd,i(r);

Dfd,i(r)=ifff(fft(Dd,i)·H*(k)[1-a(k)]);

所述步驟6.3)中未去卷積的超分辨圖像ISR_woDeconv_att(r)的表達(dá)式是:

所述步驟6.4)中的去卷積運(yùn)算是指維納去卷積、Richardson-Lucy去卷積、TotalVariation去卷積或Hessian去卷積;當(dāng)所述去卷積運(yùn)算為維納去卷積時(shí),所述維納去卷積的表達(dá)式為:

其中:

A(k)為切趾函數(shù);

k代表頻譜空間的二維坐標(biāo);

α為維納去卷積參數(shù);

所述切趾函數(shù)的表達(dá)式為

所述kd為擴(kuò)展頻譜的最大范圍對(duì)應(yīng)的頻率;

所述步驟6.4)中擴(kuò)展的衰減的光學(xué)傳遞函數(shù)的平方的表達(dá)式是:

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