[發(fā)明專利]基于空頻域混合式重建的超分辨結(jié)構(gòu)光照明顯微成像方法有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 202110985056.7 | 申請(qǐng)日: | 2021-08-25 |
| 公開(公告)號(hào): | CN113670878B | 公開(公告)日: | 2022-09-27 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 汪召軍;雷銘;梁言生 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 西安交通大學(xué) |
| 主分類號(hào): | G01N21/64 | 分類號(hào): | G01N21/64 |
| 代理公司: | 北京市誠(chéng)輝律師事務(wù)所 11430 | 代理人: | 岳東升;楊帥峰 |
| 地址: | 710049 陜西省西*** | 國(guó)省代碼: | 陜西;61 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說(shuō)明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 基于 空頻域 混合式 重建 分辨 結(jié)構(gòu) 照明 顯微 成像 方法 | ||
1.一種基于空頻域混合式重建的超分辨結(jié)構(gòu)光照明顯微成像方法,其特征在于:所述基于空頻域混合式重建的超分辨結(jié)構(gòu)光照明顯微成像方法包括以下步驟:
1)產(chǎn)生條紋狀照明光場(chǎng),條紋狀照明光場(chǎng)的強(qiáng)度分布表示為公式(1):
其中:
r為二維平面的坐標(biāo);
d為不同的條紋方向,d=1,2,3;
i為不同的相移步數(shù),i=1,2,3;
Id為條紋狀照明光場(chǎng)的平均光強(qiáng);
md為條紋狀照明光場(chǎng)的調(diào)制度;
kd為條紋的波矢量;
為當(dāng)前條紋狀照明光場(chǎng)對(duì)應(yīng)的相位;
2)利用步驟1)得到的條紋狀照明光場(chǎng)分別在不同的條紋方向以及不同的相移步數(shù)的情況下照明并激發(fā)待測(cè)樣品產(chǎn)生熒光信號(hào);
3)采集熒光信號(hào),獲得由不同的條紋狀照明光場(chǎng)激發(fā)的原始熒光圖像,具體是:面陣數(shù)字相機(jī)分別采集由步驟2)產(chǎn)生的熒光信號(hào),獲得由不同的條紋狀照明光場(chǎng)激發(fā)的原始熒光圖像Dd,i(r),其中:r為二維平面的坐標(biāo);d是不同的條紋方向,d=1,2,3;i指示不同的相移步數(shù),i=1,2,3;
4)若原始熒光圖像中的不包括離焦背景,則執(zhí)行步驟5);若原始熒光圖像中包括離焦背景,則執(zhí)行步驟6);
5)利用空頻域混合式重建算法處理不包括離焦背景的原始熒光圖像,獲得超分辨圖像,具體是:
5.1)計(jì)算每幅原始熒光圖像對(duì)應(yīng)的權(quán)重圖像wd,i(r):
根據(jù)每個(gè)條紋狀照明光場(chǎng)的調(diào)制度md、波矢量kd以及各條紋狀照明光場(chǎng)的相位計(jì)算出每幅原始熒光圖像對(duì)應(yīng)的權(quán)重圖像wd,i(r);
5.2)對(duì)原始熒光圖像進(jìn)行濾波:
設(shè)光學(xué)系統(tǒng)的光學(xué)傳遞函數(shù)為H(k);
對(duì)原始熒光圖像分別以光學(xué)系統(tǒng)的光學(xué)傳遞函數(shù)的共軛H*(k)為濾波器進(jìn)行低通濾波,得到濾波圖像;
5.3)點(diǎn)乘:
將濾波圖像分別與權(quán)重圖像wd,i(r)相點(diǎn)乘,并將所有相乘的結(jié)果疊加,得到未去卷積的超分辨圖像ISR_woDeconv(r);
5.4)去卷積:
利用未去卷積的超分辨圖像ISR_woDeconv(r)和擴(kuò)展光學(xué)傳遞函數(shù)的平方完成去卷積運(yùn)算,獲得最終的超分辨圖像;
所述擴(kuò)展光學(xué)傳遞函數(shù)的平方是將|H(k)|2按照不同的波矢量kd進(jìn)行平移、疊加得到的;
其中:
所述步驟5.1)中原始熒光圖像對(duì)應(yīng)的權(quán)重圖像wd,i(r)的表達(dá)式是:
其中:
md為條紋狀照明光場(chǎng)的調(diào)制度;
kd為波矢量;
為條紋狀照明光場(chǎng)的初始相位;
為相移量;
所述步驟5.2)中光學(xué)系統(tǒng)的光學(xué)傳遞函數(shù)為H(k)的表達(dá)式是:
其中:
所述步驟5.2)中進(jìn)行低通濾波的具體實(shí)現(xiàn)方式是:以光學(xué)系統(tǒng)的光學(xué)傳遞函數(shù)H(k)的共軛分布H*(k)為濾波器,對(duì)步驟3)所拍攝的原始熒光圖像分別低通濾波,得到濾波圖像Dfd,i(r);
Dfd,i(r)=ifft(fft(Dd,i)·H*(k));
所述步驟5.3)中未去卷積的超分辨圖像ISR_woDeconv(r)的表達(dá)式是:
其中:wd,i(r)為原始熒光圖像對(duì)應(yīng)的權(quán)重圖像;
所述步驟5.3)中的去卷積運(yùn)算是指維納去卷積、Richardson-Lucy去卷積、TotalVariation去卷積或Hessian去卷積;
當(dāng)所述去卷積運(yùn)算為維納去卷積時(shí),所述維納去卷積的表達(dá)式為:
其中:
A(k)為切趾函數(shù);
k代表頻譜空間的二維坐標(biāo);
α為維納去卷積參數(shù);
所述切趾函數(shù)的表達(dá)式為
其中,kd為擴(kuò)展頻譜的最大范圍對(duì)應(yīng)的頻率;
所述步驟5.4)中擴(kuò)展光學(xué)傳遞函數(shù)的平方的表達(dá)式是:
6)利用空頻域混合式重建算法處理包括離焦背景的原始熒光圖像,獲得具有層析效果的超分辨圖像,具體是:
6.1)計(jì)算每幅原始熒光圖像對(duì)應(yīng)的權(quán)重圖像wd,i(r):
根據(jù)每個(gè)條紋狀照明光場(chǎng)的調(diào)制度md、波矢量kd以及各條紋狀照明光場(chǎng)的相位計(jì)算出每幅原始熒光圖像對(duì)應(yīng)的權(quán)重圖像wd,i(r);
6.2)對(duì)原始熒光圖像進(jìn)行濾波:
設(shè)光學(xué)系統(tǒng)的光學(xué)傳遞函數(shù)為H(k),并引入衰減函數(shù)[1-a(k)],其中a(k)是高斯分布;對(duì)步驟3)所拍攝的原始熒光圖像分別以衰減的光學(xué)傳遞函數(shù)的共軛H*(k)[1-a(k)]為濾波器進(jìn)行帶通濾波,得到濾波圖像;
6.3)點(diǎn)乘:
將濾波圖像分別與權(quán)重圖像wd,i(r)相點(diǎn)乘,并將所有相乘的結(jié)果疊加,得到未去卷積的超分辨圖像ISR_woDeconv_att(r);
6.4)去卷積:
利用未去卷積的超分辨圖像ISR_woDeconv_att(r)和擴(kuò)展的衰減的光學(xué)傳遞函數(shù)的平方完成去卷積運(yùn)算,獲得最終的具有層析效果的超分辨圖像;
所述擴(kuò)展的衰減的光學(xué)傳遞函數(shù)的平方是將|H(k)|2[1-a(k)]按照不同的波矢量kd進(jìn)行平移、疊加得到的;
其中,所述步驟6.1)中原始熒光圖像對(duì)應(yīng)的權(quán)重圖像wd,i(r)的表達(dá)式是:
其中:
md為條紋狀照明光場(chǎng)的調(diào)制度;
kd為波矢量;
為條紋狀照明光場(chǎng)的初始相位;
為相移量;
所述步驟6.2)中光學(xué)系統(tǒng)的光學(xué)傳遞函數(shù)為H(k)的表達(dá)式是:
其中:
所述步驟6.2)中的衰減函數(shù)的表達(dá)式是
其中:
aatt為衰減幅度參數(shù),取值范圍為從0~1;
kσ為可調(diào)的經(jīng)驗(yàn)參數(shù);
所述步驟6.2)中進(jìn)行帶通濾波的具體實(shí)現(xiàn)方式是:以光學(xué)系統(tǒng)的衰減的光學(xué)傳遞函數(shù)H(k)[1-a(k)]的共軛分布H*(k)[1-a(k)]為濾波器;對(duì)步驟3)所拍攝的原始熒光圖像分別帶通濾波,得到濾波圖像Dfd,i(r);
Dfd,i(r)=ifff(fft(Dd,i)·H*(k)[1-a(k)]);
所述步驟6.3)中未去卷積的超分辨圖像ISR_woDeconv_att(r)的表達(dá)式是:
所述步驟6.4)中的去卷積運(yùn)算是指維納去卷積、Richardson-Lucy去卷積、TotalVariation去卷積或Hessian去卷積;當(dāng)所述去卷積運(yùn)算為維納去卷積時(shí),所述維納去卷積的表達(dá)式為:
其中:
A(k)為切趾函數(shù);
k代表頻譜空間的二維坐標(biāo);
α為維納去卷積參數(shù);
所述切趾函數(shù)的表達(dá)式為
所述kd為擴(kuò)展頻譜的最大范圍對(duì)應(yīng)的頻率;
所述步驟6.4)中擴(kuò)展的衰減的光學(xué)傳遞函數(shù)的平方的表達(dá)式是:
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G01N 借助于測(cè)定材料的化學(xué)或物理性質(zhì)來(lái)測(cè)試或分析材料
G01N21-00 利用光學(xué)手段,即利用紅外光、可見光或紫外光來(lái)測(cè)試或分析材料
G01N21-01 .便于進(jìn)行光學(xué)測(cè)試的裝置或儀器
G01N21-17 .入射光根據(jù)所測(cè)試的材料性質(zhì)而改變的系統(tǒng)
G01N21-62 .所測(cè)試的材料在其中被激發(fā),因之引起材料發(fā)光或入射光的波長(zhǎng)發(fā)生變化的系統(tǒng)
G01N21-75 .材料在其中經(jīng)受化學(xué)反應(yīng)的系統(tǒng),測(cè)試反應(yīng)的進(jìn)行或結(jié)果
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