[發明專利]免疫原性細胞死亡相關基因在頭頸鱗癌生存預后及放療應答性中的應用

有效

• 申請號: 202110962329.6
• 申請日: 2021-08-20
• 公開（公告）號: CN113699235B
• 公開（公告）日: 2023-10-20
• 發明（設計）人: 曲迅;竇宇;南兆棣;王克濤;董召剛
• 申請（專利權）人: 山東大學齊魯醫院
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12N15/11
• 代理公司: 濟南圣達知識產權代理有限公司 37221
• 代理人: 宋海海

1.一種用于頭頸鱗癌生存預后評估和/或放療應答性的標志物，其特征在于，所述標志物包括選自下列基因中的任意一種或多種：

ATF6、BECN1、CSNK2A2、CTTN、FBXO7、NLRP1、PLAA、RFPL1、RUBCNL、SPTLC1、SRPX、STK24、TP53INP1、TRIML2和VPS37C。

2.如權利要求1所述的標志物，其特征在于，所述標志物為ATF6、BECN1、CSNK2A2、CTTN、FBXO7、NLRP1、PLAA、RFPL1、RUBCNL、SPTLC1、SRPX、STK24、TP53INP1、TRIML2和VPS37C組成的組；

優選的，所述預后評估具體包括對頭頸鱗癌患者總生存期的評估。

3.檢測權利要求1或2所述標志物的表達水平的試劑在制備產品中的應用，所述產品用于頭頸鱗癌生存預后評估和/或放療應答性。

4.一種產品，其特征在于，所述產品包含檢測上述用于頭頸鱗癌生存預后評估和/或放療應答性的標志物的物質，所述產品用于頭頸鱗癌生存預后評估和/或放療應答性。

5.如權利要求4所述產品，其特征在于，所述產品包括檢測待測樣本中所述免疫原性細胞死亡相關基因表達水平的引物、探針、芯片、核酸膜條、制劑或試劑盒；

所述待測樣本為人源樣本，優選的，所述待測樣本包括受試者頭頸鱗癌組織和/或細胞。

6.如權利要求4所述產品，其特征在于，所述產品為試劑盒。

7.一種用于頭頸鱗癌生存預后評估和/或放療應答性的系統，其特征在于，所述系統包括：

i)分析模塊，所述分析模塊包含：用于確定受試者的待測樣品中選自免疫原性細胞死亡相關基因表達水平的檢測物質，以及；

ii)評估模塊，所述評估模塊包含：根據i)中確定的所述凋亡相關基因表達水平對所述受試者進行生存預后評估和/或放療應答性判斷。

8.如權利要求7所述的系統，其特征在于，

所述步驟i)分析模塊中，所述免疫原性細胞死亡相關基因包括選自下列基因中的任意一種或多種：

ATF6、BECN1、CSNK2A2、CTTN、FBXO7、NLRP1、PLAA、RFPL1、RUBCNL、SPTLC1、SRPX、STK24、TP53INP1、TRIML2和VPS37C；

優選的，所述免疫原性細胞死亡相關基因為ATF6、BECN1、CSNK2A2、CTTN、FBXO7、NLRP1、PLAA、RFPL1、RUBCNL、SPTLC1、SRPX、STK24、TP53INP1、TRIML2和VPS37C組成的組；

所述步驟ii)評估模塊具體評估流程包括：根據i)中確定的所述免疫原性細胞死亡相關基因表達水平基于免疫原性細胞死亡相關基因預測指數ICDRGPI進行生存預后評估和/或放療應答性判斷；

其中，所述ICDRGPI，其計算公式＝(0.34*ATF6基因表達量)+(0.70*BECN1基因表達量)+(0.32*CSNK2A2基因表達量)+(0.06*CTTN基因表達量)+(0.64*FBXO7基因表達量)-(0.27*NLRP1基因表達量)+(0.26*PLAA基因表達量)-(0.15*RFPL1基因表達量)-(0.11*RUBCNL基因表達量)+(0.27*SPTLC1基因表達量)+(0.09*SRPX基因表達量)+(0.16*STK24基因表達量)–(0.05*TP53INP1基因表達量)+(0.10*TRIML2基因表達量)–(0.38*VPS37C基因表達量)。

9.如權利要求8所述的系統，其特征在于，受試者ICDRGPI指數高于閾值時為高表達，則指示受試者預后較差(總生存期較短)，對放療敏感；受試者ICDRGPI指數低于閾值時為低表達，則指示受試者預后較好(總生存期較長)，對放療不敏感。

10.一種頭頸鱗癌患者預后風險評估和/或放療應答性的方法，其特征在于，所述方法包括使用權利要求1或2所述標志物和/或權利要求7-9任一項所述系統進行評估；

優選的，所述預后風險評估包括對受試者的總生存期進行預測評估。