[發(fā)明專利]評估USH2A外顯子13剔除效率的MINI-REP基因及其表達載體和應用在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202110884031.8 | 申請日: | 2021-08-03 |
| 公開(公告)號: | CN115704031A | 公開(公告)日: | 2023-02-17 |
| 發(fā)明(設計)人: | 梁峻彬;歐家裕;徐輝 | 申請(專利權)人: | 廣州瑞風生物科技有限公司 |
| 主分類號: | C12N15/12 | 分類號: | C12N15/12;C12N15/85;C12N15/65;C12N5/10;G01N21/64 |
| 代理公司: | 廣州新諾專利商標事務所有限公司 44100 | 代理人: | 李海恬 |
| 地址: | 510700 廣東省廣州市*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 評估 ush2a 外顯子 13 剔除 效率 mini rep 基因 及其 表達 載體 應用 | ||
1.一種評估USH2A外顯子13剔除效率的MINI-REP基因,其特征在于,包括報告基因和小基因,所述報告基因為行使報告功能的基因,所述小基因包括依次連接的USH2A內含子12、外顯子13和內含子13的基因;所述小基因插入所述報告基因,將所述報告基因分割成斷裂報告基因,所述斷裂報告基因單獨表達均不發(fā)揮報告功能,串聯(lián)完整表達則發(fā)揮報告功能。
2.根據權利要求1所述的MINI-REP基因,其特征在于,所述內含子12的基因由內含子12的5’端長度為50-200bp的基因片段和3’端長度為200bp-1700bp的基因片段按照5’-3’順序串聯(lián)得到,所述內含子13的基因由內含子13的5’端長度為200bp-1700bp的基因片段和3’端長度為50-200bp的基因片段按照5’-3’順序串聯(lián)得到。
3.根據權利要求2所述的MINI-REP基因,其特征在于,所述內含子12的基因5’段片段長度為192-204bp,3’端片段長度為490-1611bp,所述內含子13的基因5’段片段長度為706-1599bp,3’端片段長度為216bp。
4.根據權利要求3所述的MINI-REP基因,其特征在于,所述內含子12的基因包括以下區(qū)域及相似性≥90%的序列:內含子12的剪接沉默子ISS、外顯子13的剪接的分支位點BP、外顯子13的剪接受體SA、外顯子13的剪接供體SD或外顯子13的剪接增強子ESE;
所述內含子13的基因包括以下區(qū)域及相似性≥90%的序列:內含子13的剪接增強子ISE或內含子13的聚嘧啶束。
5.根據權利要求1所述的MINI-REP基因,其特征在于,所述報告基因選自:熒光蛋白基因或酶標記基因。
6.根據權利要求5所述的MINI-REP基因,其特征在于,所述報告基因為綠色熒光基因EGFP。
7.根據權利要求1-6中任一項所述的MINI-REP基因,其特征在于,將所述小基因插入所述報告基因內連續(xù)2個G堿基之間。
8.根據權利要求7所述的MINI-REP基因,其特征在于,將所述小基因插入綠色熒光基因EGFP序列AGGT的2個G堿基之間。
9.根據權利要求1所述的MINI-REP基因,其特征在于,所述外顯子13的基因包括以下致病突變中的至少一種:c.2802TG(p.Cys934Trp)、c.2299delG(p.E767SfsX21)、c.2276GT(p.C759F)、c.2522CA(p.S841Y)、c.2242CT(p.Gln748X)、c.2541CA(C847X)、c.2761delC(Leu921fs)和c.2776CT(p.R926C)、c.2209CT、c.2310delA、c.2391_2392deITG、c.2431AT、c.2431_2432delAA、c.2440CT、c.2525dup、c.2610CA、c.2755CT、c.2176TC、c.2236CG、c.2296TC和c.2332GT。
10.根據權利要求9所述的MINI-REP基因,其特征在于,所述外顯子13的致病突變包括c.2802TG或c.2299delG。
11.根據權利要求10所述的MINI-REP基因,其特征在于,所述外顯子13的致病突變?yōu)閏.2802TG。
12.一種表達權利要求1-11任一項所述MINI-REP基因的表達載體。
13.一種包括權利要求12所述表達載體的報告基因評估細胞,其特征在于,該評估細胞由所述表達載體瞬時轉染和/或穩(wěn)定轉染宿主細胞構建得到。
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