[發(fā)明專利]一種與油茶種子油脂中亞油酸含量相關(guān)的DNA片段及其應(yīng)用

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 202110846310.5
• 申請日: 2021-07-26
• 公開（公告）號: CN113604593B
• 公開（公告）日: 2023-08-15
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 常君;林萍;姚小華;王開良
• 申請（專利權(quán)）人: 中國林業(yè)科學(xué)研究院亞熱帶林業(yè)研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11;A01H1/04
• 代理公司: 北京路浩知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11002
• 代理人: 張璐

1.與油茶種子油脂中亞油酸含量位點緊密連鎖的SNP分子標記，其特征在于，包括SNP分子標記Chr11-114235680，所述Chr11-114235680含有如SEQ?ID?NO.1所示序列第203位的多態(tài)性為C/T的核苷酸序列。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的SNP分子標記，其特征在于，由序列如SEQ?ID?NO.2-3所示的引物對以油茶基因組DNA為模板經(jīng)PCR擴增獲得。

3.根據(jù)權(quán)利要求1-2任一項所述的SNP分子標記，其特征在于，所述SNP分子標記Chr11-114235680中，具有所述多態(tài)性的位點的基因型為CC，對應(yīng)高亞油酸含量；基因型為CT，對應(yīng)低亞油酸含量。

4.用于擴增權(quán)利要求1-3任一項所述SNP分子標記的引物，其特征在于，序列如SEQ?IDNO.2-3所示的引物。

5.含有權(quán)利要求4所述的引物的試劑或試劑盒。

6.權(quán)利要求1-3任一項所述的SNP分子標記或權(quán)利要求4所述的引物或權(quán)利要求5所述的試劑或試劑盒的以下任一種應(yīng)用：

(1)在鑒定油茶種子油脂中亞油酸含量表型中的應(yīng)用；

(2)在油茶種子油脂中亞油酸含量改良或油茶種子油脂中亞油酸含量分子標記輔助育種中的應(yīng)用；

(3)在油茶種子油脂中亞油酸含量的早期預(yù)測中的應(yīng)用；

(4)在篩選高亞油酸含量油茶中的應(yīng)用。

7.一種鑒定油茶種子油脂中亞油酸含量或篩選高亞油酸含量油茶種子的方法，其特征在于，包括：

(1)提取待鑒定油茶的基因組DNA；

(2)以基因組DNA為模板，利用如SEQ?ID?NO.2-3所示的引物進行PCR擴增；

(3)分析PCR擴增產(chǎn)物中權(quán)利要求1-3任一項所述的SNP分子標記的基因型，根據(jù)所述基因型判斷待鑒定油茶種子出仁率表型。

8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法，其特征在于，步驟(2)中，所述PCR擴增的反應(yīng)程序為：94-95℃，3-5min；94-95℃，15-30s，65-69℃，40-60s，38-45個循環(huán)；67-70℃，3-6min。

9.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法，其特征在于，步驟(3)中，所述判斷待鑒定油茶種子油脂中亞油酸含量的方法為：

若SNP分子標記Chr11-114235680具有所述多態(tài)性的位點的基因型為CC，則待鑒定油茶種子油脂為高亞油酸含量；若基因型為CT，則待鑒定油茶種子油脂為低亞油酸含量。