[發(fā)明專利]一種生物標(biāo)志物及其在肝內(nèi)膽管細(xì)胞癌預(yù)后預(yù)測中的應(yīng)用

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 202110798461.8
• 申請日: 2021-07-15
• 公開（公告）號(hào): CN113528664B
• 公開（公告）日: 2023-08-29
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 曾勇;高強(qiáng);孫德強(qiáng);袁克非;陳璐;陳星
• 申請（專利權(quán)）人: 四川大學(xué)華西醫(yī)院
• 主分類號(hào): C12Q1/6886
• 分類號(hào): C12Q1/6886;C12N15/11;G16B20/30;G16B40/00
• 代理公司: 成都云縱知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 51316
• 代理人: 劉沙粒;伍星

1.生物標(biāo)志物在制備用于肝內(nèi)膽管細(xì)胞癌預(yù)后預(yù)測產(chǎn)品中的應(yīng)用，其特征在于，生物標(biāo)志物為LIX1L、LINC01822、TUBA4A、AC023481.1、MFSD1、AC097173.1、FAM153B、STEAP2/STEAP2-AS1、CDKN2B、FAM205BP、GAD2、LETMD1、RASSF3、AC073592.4、GOLGA6B、ORC6、TMEM106A的基因區(qū)域的組合，其中，所述AC097173.1、STEAP2/STEAP2-AS1、RASSF3、AC073592.4、GOLGA6B的基因區(qū)域?yàn)樵鰪?qiáng)子，所述MFSD1、FAM153B、GAD2、ORC6的基因區(qū)域?yàn)閮?nèi)含子，所述LIX1L、TUBA4A的基因區(qū)域?yàn)橥怙@子，所述LINC01822的基因區(qū)域?yàn)閱?dòng)子，所述TMEM106A的基因區(qū)域?yàn)?’非翻譯區(qū)，所述AC023481.1、CDKN2B、FAM205BP的基因區(qū)域?yàn)?’非翻譯區(qū)或外顯子，所述LETMD1的基因區(qū)域?yàn)?’非翻譯區(qū)或外顯子；

檢測所述生物標(biāo)志物的甲基化水平，基于所述甲基化水平計(jì)算基因組甲基化評(píng)分，根據(jù)所述基因組甲基化評(píng)分進(jìn)行肝內(nèi)膽管細(xì)胞癌預(yù)后。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的應(yīng)用，其特征在于，所述LIX1L的基因區(qū)域?yàn)閏hr1:145957635-145958017，LINC01822的基因區(qū)域?yàn)閏hr2:?21710623-21712623，TUBA4A的基因區(qū)域?yàn)閏hr2:?219251586-219251713，AC023481.1的基因區(qū)域?yàn)閏hr3:?8365593-8365799，MFSD1的基因區(qū)域?yàn)閏hr3:?158804371-158805340，AC097173.1的基因區(qū)域?yàn)閏hr4:119872612-119873113，F(xiàn)AM153B的基因區(qū)域?yàn)閏hr5:?176114061-176115592，STEAP2/STEAP2-AS1的基因區(qū)域?yàn)閏hr7:?90178863-90179364，CDKN2B的基因區(qū)域?yàn)閏hr9:22005202-22006271，F(xiàn)AM205BP的基因區(qū)域?yàn)閏hr9:?34838349-34838586，GAD2的基因區(qū)域?yàn)閏hr10:?26223977-26224538，LETMD1的基因區(qū)域?yàn)閏hr12:?51056370-51056502，RASSF3的基因區(qū)域?yàn)閏hr12:?64671189-64671690，AC073592.4的基因區(qū)域?yàn)閏hr12:?124626183-124626684，GOLGA6B的基因區(qū)域?yàn)閏hr15:?72237361-72237862，ORC6的基因區(qū)域?yàn)閏hr16:46689829-46690990，TMEM106A的基因區(qū)域?yàn)閏hr17:?43213020-43213041。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的應(yīng)用，其特征在于，所述基因組甲基化評(píng)分的計(jì)算公式為：GMS=?，其中，N為用于計(jì)算基因組甲基化評(píng)分的基因區(qū)域數(shù)量，為第i個(gè)基因區(qū)域的甲基化水平，為第i個(gè)基因區(qū)域的系數(shù)，i=1,2,…,N；

GMS=(-2.21)*chr1:145957635-145958017+(-0.35)*chr2:21710623-21712623+(-0.47)*chr2:?219251586-219251713+(-0.25)*chr3:8365593-8365799+(-0.23)*chr3:158804371-158805340+0.64*chr4:119872612-119873113+(-0.57)*chr5:176114061-176115592+(-0.62)*chr7:90178863-90179364+(-0.88)*chr9:22005202-22006271+(-0.30)*chr9:34838349-34838586+(-0.48)*chr10:26223977-26224538+(-0.21)*chr12:51056370-51056502+(-0.28)*chr12:64671189-64671690+(-0.11)*chr12:124626183-124626684+(-0.54)*chr15:72237361-72237862+(-15.04)*chr16:46689829-46690990+(-0.73)*chr17:43213020-43213041。