[發明專利]檢測水稻耐鹽性基因SKC1NB

在審

• 申請號: 202110700405.6
• 申請日: 2021-06-23
• 公開（公告）號: CN113322344A
• 公開（公告）日: 2021-08-31
• 發明（設計）人: 周繼華;儲黃偉;程燦;曹黎明;牛付安;孫濱;涂榮劍;李瑤
• 申請（專利權）人: 上海市農業科學院
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 浙江千克知識產權代理有限公司 33246
• 代理人: 黎雙華

本發明公開了一種檢測水稻耐鹽性基因SKC1^NB的KASP分子標記及其方法，所述分子標記是根據SKC1^NB基因SNP2處發生由G→A的突變而設計的，命名為SKC1^NB?KASP。所述KASP標記引物包括兩條正向特異性引物和一條反向通用引物。根據本發明提供的KASP標記進行基因分型，在PCR擴增后不用酶切和電泳，可以高通量檢測多個樣品，快速檢測SKC1^NB等位基因在水稻分離群體中的分布情況，結果準確性好，與常規分子標記相比具有快捷、簡便和成本較低等優點。本發明對水稻耐鹽性基因SKC1^NB的分子標記輔助選擇育種具有重要意義。

技術領域

本發明涉及一種檢測水稻耐鹽性基因SKC1^NB的KASP分子標記及方法，屬水稻育種技術領域。

背景技術

我國是一個人口眾多，耕地資源相對緊張的國家。近年來，還一直面臨土壤鹽堿化日益加劇的問題，土壤鹽堿化會對水稻產量造成很大的影響(Lei and Tan et al,2011；孟麗君,2012)。目前，我們有內陸鹽堿面積近1億hm2，灘涂面積234萬hm2(王才林與張亞東等,2019)。如何將這些鹽堿地利用起來，種植糧食，預防土壤鹽堿化后無地可種局面的發生，是當前面臨的一個巨大挑戰。鹽堿脅迫對作物生長發育有極大的抑制作用，高離子濃度的鹽堿地對植株形成滲透壓，嚴重影響作物各項生理活動的進行，抑制植株生長發育并最終造成死亡 (梁正偉與楊福等,2004)。耐鹽堿水稻的研究可追溯到1939年的印度，斯里蘭卡等人培育出第一個強耐鹽性水稻品種Pokkali(孫明法與嚴國紅等,2017)，此后，耐鹽堿性水稻品種的育種工作便在世界各地陸續開展。我國曾對全國各地水稻種質資源進行了耐鹽性鑒定，來篩選可用資源。在此期間中國農業科學院組織相關單位協作，篩選出上百份的耐鹽品系，但是這些品種耐鹽性狀較弱，無法在重度鹽堿地成活，且因為農藝性狀較差等原因，并不適合生產推廣(周汝倫與侯家龍等,1983；郭望模與應存山等,1993)。因此，從基因層面出發，挖掘水稻耐鹽堿性位點，通過分子育種將耐鹽堿位點轉入性狀優良的水稻品種中，是培育優質耐鹽堿水稻品種的關鍵。