[發明專利]用于骨肉瘤分型和評估骨肉瘤預后的基因及其應用

有效

• 申請號: 202110663019.4
• 申請日: 2021-06-15
• 公開（公告）號: CN113549691B
• 公開（公告）日: 2023-03-31
• 發明（設計）人: 肖建如;魏海峰;周旺;張浩;龔海熠;王霆
• 申請（專利權）人: 上海長征醫院;上海理工大學
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;G01N33/574;G01N33/543;C12N15/11
• 代理公司: 上海九澤律師事務所 31337
• 代理人: 辜佳麒

在本發明中，針對腫瘤異質性，我們比較了常規骨肉瘤和正常松質骨之間細胞動力學和分子特征的差異，基于單細胞RNA測序(scRNA?seq)技術或基因檢測試劑盒、基因檢測芯片技術或免疫組化法，檢測了骨肉瘤細胞的明顯分化方向，并研究了腫瘤微環境中每種細胞類型之間可能的相互作用。根據骨肉瘤細胞的分化方向，可將常規骨肉瘤分為三類，描述了每種類型的微環境特征，并根據癌癥基因組圖譜(TCGA)數據驗證了每種類型的預后。

技術領域

本發明屬于生物醫學技術領域，具體涉及用于骨肉瘤分型和評估骨肉瘤預后的基因、檢測試劑盒、檢測芯片及其應用。

背景技術

骨肉瘤(Osteosarcoma,OS)是最常見的原發性骨惡性腫瘤。在1970年代廣泛使用化學療法之前，手術切除是OS患者可用的主要治療方式。輔助化療的實施顯著改善了OS患者的預后，非轉移患者的五年生存率從20％提高到60％以上。但是，具有轉移或復發性疾病的患者的預后并未得到明顯改善，兩組的生存率僅為20％。隨后，在過去的四十年中，OS患者的治療模式和預后沒有發展多少。因此，迫切需要確定可以改善OS管理的分子機制和新療法。

隨著近年來靶向療法的巨大成功，骨肉瘤的治療有了新的希望。已經針對骨肉瘤患者進行了許多靶向藥物的臨床試驗，其中包括酪氨酸激酶抑制劑(TKIs)，這是癌癥治療中最常見的靶向藥物之一。在一系列的TKIs報告中，阿帕替尼在晚期OS患者中獲得了最高的43％的部分緩解(PR)率，而毒性作用導致68％的患者劑量減少或中斷。鑒于靶向治療在未選擇的OS患者中觀察到的臨床益處有限，因此有必要發現OS的分子亞型，因為基于亞型的靶向治療可能在癌癥治療中獲得臨床益處。

現有的臨床分期(TNM)及分級(病理)診斷方法無法很好的解釋患者預后的異質性，也無法很好地指導患者進行化療、靶向治療等個性化治療。

發明內容

基于此，本發明的目的在于提供一種可很好解釋患者預后的異質性，并適用于指導患者進行化療、靶向治療等個性化治療的用于骨肉瘤分型和評估骨肉瘤預后的基因。具體技術方案如下：

一種用于骨肉瘤分型和評估骨肉瘤預后的基因集，所述基因群包括9個基因，如下表所示：