[發(fā)明專利]用于骨肉瘤分型和評估骨肉瘤預(yù)后的基因及其應(yīng)用有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 202110663019.4 | 申請日: | 2021-06-15 |
| 公開(公告)號: | CN113549691B | 公開(公告)日: | 2023-03-31 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 肖建如;魏海峰;周旺;張浩;龔海熠;王霆 | 申請(專利權(quán))人: | 上海長征醫(yī)院;上海理工大學(xué) |
| 主分類號: | C12Q1/6886 | 分類號: | C12Q1/6886;G01N33/574;G01N33/543;C12N15/11 |
| 代理公司: | 上海九澤律師事務(wù)所 31337 | 代理人: | 辜佳麒 |
| 地址: | 200003 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 用于 骨肉 瘤分型 評估 預(yù)后 基因 及其 應(yīng)用 | ||
1.一種基因組合在制備用于評估骨肉瘤預(yù)后的試劑盒中的應(yīng)用,其特征在于,所述基因組合包括如下11個基因:
基因名稱AEBP1,基因編號ENSG00000106624;
基因名稱ASPN,基因編號 ENSG00000106819;
基因名稱C1R,基因編號ENSG00000159403;
基因名稱C1S,基因編號ENSG00000182326;
基因名稱COL12A1,基因編號ENSG00000111799;
基因名稱COL5A1,基因編號ENSG00000130635;
基因名稱COL6A3,基因編號ENSG00000163359;
基因名稱OLFML2B,基因編號ENSG00000162745;
基因名稱POSTN,基因編號 ENSG00000133110;
基因名稱SFRP4,基因編號ENSG00000106483;
基因名稱THBS2,基因編號ENSG00000186340。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的應(yīng)用,其特征在于,所述基因組合包括權(quán)利要求1所述的11個基因,以及ABCF1、ADAMTS1、ALDH3A2、ALKBH5、ATPAF2、C19orf12、CENPV、CPNE3、DRG2、EPN2、FLII、FSCN1、GID4、HIST1H2BD、LSM2、MPRIP、MYO15A、PEMT、PI15、PRAME、PRR3、TOM1L2、TTC19、VARS、ATP1B3、CDK4、DNAJC3、GGH、HSPB11、LMO7、PFN2、SGO2和UPF3A中的至少一個基因。
3.如權(quán)利要求1或2所述的基因組合在制備用于評估骨肉瘤預(yù)后的試劑盒中的應(yīng)用,所述試劑盒包括:擴(kuò)增權(quán)利要求1或2所述用于評估預(yù)后的基因組合的基因的引物;和/或
特異性結(jié)合權(quán)利要求1或2所述評估骨肉瘤預(yù)后的基因組合的基因和/或其互補(bǔ)序列的探針;和/或
特異性結(jié)合權(quán)利要求1或2所述評估骨肉瘤預(yù)后的基因組合的基因表達(dá)的蛋白的抗體。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的應(yīng)用,其特征在于,所述引物包括:核苷酸序列如SEQ IDNO.1-SEQ ID NO.22所示的引物。
5.如權(quán)利要求1或2所述的基因組合在制備用于評估骨肉瘤預(yù)后的蛋白檢測芯片中的應(yīng)用,其特征在于,所述蛋白檢測芯片包括固相載體和檢測抗體,在所述固相載體上固定有與權(quán)利要求1或2所述的基因組合的基因特異性結(jié)合的捕獲抗體,所述檢測抗體與抗體標(biāo)記物連接。
6.一種用于評估骨肉瘤預(yù)后的試劑盒,其特征在于,包括
1)擴(kuò)增權(quán)利要求1或2所述用于評估骨肉瘤預(yù)后的基因組合的基因的引物;和/或
2)特異性結(jié)合權(quán)利要求1或2所述評估骨肉瘤預(yù)后的基因組合的基因和/或其互補(bǔ)序列的探針;和/或
3)特異性結(jié)合權(quán)利要求1或2所述用于評估骨肉瘤預(yù)后的基因組合的基因表達(dá)的蛋白的抗體。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的試劑盒,其特征在于,所述檢測試劑盒包括:總RNA抽提試劑、逆轉(zhuǎn)錄試劑和/或測序試劑。
8.根據(jù)權(quán)利要求6所述的試劑盒,其特征在于,所述檢測試劑盒包括:dNTP溶液和 /或RNA逆轉(zhuǎn)錄酶。
9.根據(jù)權(quán)利要求6所述的試劑盒,其特征在于,所述的測序試劑包括二代測序試劑或單細(xì)胞測序試劑。
10.根據(jù)權(quán)利要求6-9任一項所述的試劑盒,其特征在于,所述引物包括:核苷酸序列如SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.22所示的引物。
11.一種用于評估骨肉瘤預(yù)后的基因檢測芯片,其特征在于,所述基因芯片所述基因芯片包括固相載體和檢測抗體,在所述固相載體上固定有與權(quán)利要求1或2所述的基因組合的基因特異性結(jié)合的捕獲抗體,所述檢測抗體與抗體標(biāo)記物連接。
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