[發明專利]融合基因突變的熒光定量PCR檢測方法在審
| 申請號: | 202110642037.4 | 申請日: | 2021-06-09 |
| 公開(公告)號: | CN113136419A | 公開(公告)日: | 2021-07-20 |
| 發明(設計)人: | 謝洪濤;羅偉全;王勇斯;溫韻潔;陳丹;余沁涵 | 申請(專利權)人: | 廣州華銀健康醫療集團股份有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6858 | 分類號: | C12Q1/6858 |
| 代理公司: | 廣州瑞之凡知識產權代理事務所(普通合伙) 44514 | 代理人: | 黃愛君 |
| 地址: | 510663 廣東省廣*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 融合 基因突變 熒光 定量 pcr 檢測 方法 | ||
1.融合基因突變的熒光定量PCR檢測方法,其特征在于:包括如下步驟:
1)融合基因位點查找:查找融合基因信息,查找其外顯子斷裂點,并根據外顯子斷裂點查找其斷裂點到終止點的轉錄本序列;
2)融合突變序列兼并分析:將步驟1)得到的兩段轉錄本序列合并,作為完整的融合結果序列;
3)擴增引物的設計與合成:以步驟2)得到的融合結果序列為序列模板,進行上下游擴增引物的序列設計,合成并純化;
4)反應體系的擴增與驗證:包括如下步驟:4.1準備陰性和陽性RNA樣本,將陽性RNA樣本按照倍數比例稀釋為低突變頻率陽性RNA樣本,稀釋過程使用陰性樣本作為稀釋劑;4.2RNA樣本逆轉錄,使用試劑盒進行RNA逆轉錄成cDNA;4.3反應體系配制和PCR擴增:配制含所述上下游擴增引物的反應體系,進行PCR擴增,每個循環結束后收集熒光信號;4.4結果判斷:根據擴增溶解曲線讀取Tm值,進行檢測結果的判斷。
2.根據權利要求1所述的融合基因突變的熒光定量PCR檢測方法,其特征在于:所述融合基因為EML4-ALK,其外顯子斷裂點包括EML4基因20號外顯子斷裂點和ALK基因20號外顯子斷裂點。
3.根據權利要求2所述的融合基因突變的熒光定量PCR檢測方法,其特征在于:所述上下游擴增引物包括:上游引物TGGTCCCCAGACAACAAGTAT,即SEQ ID NO:1,下游引物TTGGGGTTGTAGTCGGTCAT,即SEQ ID NO:2。
4.根據權利要求2所述的融合基因突變的熒光定量PCR檢測方法,其特征在于:所述反應體系包括所述上下游擴增引物、擴增反應液、cDNA和無核酸酶水;PCR擴增的運行條件包括:95℃30s;95℃10s,60℃30s,40個循環。
5.根據權利要求1或2所述的融合基因突變的熒光定量PCR檢測方法,其特征在于:所述試劑盒為cDNA一鏈合成試劑盒。
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