[發明專利]與苦瓜白粉病抗性主效QTL Pm3.1緊密連鎖的InDel分子標記與應用

在審

• 申請號: 202110579872.8
• 申請日: 2021-05-26
• 公開（公告）號: CN113151572A
• 公開（公告）日: 2021-07-23
• 發明（設計）人: 馮誠誠;黃如葵;琚茜茜;梁家作;陳小鳳;黃熊娟;黃玉輝;劉杏連
• 申請（專利權）人: 廣西壯族自治區農業科學院
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 廣西南寧公平知識產權代理有限公司 45104
• 代理人: 黃宗全

本發明公開了一種苦瓜白粉病抗性主效QTL Pm3.1緊密連鎖的InDel分子標記，該分子標記為InDel0362，它具有序列表中SEQ.ID.NO.1的堿基序列。苦瓜白粉病抗性主效QTLPm3.1與InDel分子標記均定位于苦瓜的3號染色體上，苦瓜白粉病抗性主效QTL Pm3.1，遺傳距離14cM，物理距離為2.9Mb。據此，還開發了用于擴增該InDel分子標記的引物對及其試劑盒。利用該InDel分子標記可以實現苦瓜種質白粉病抗性的簡便、快速、高通量檢測，對加快白粉病抗性關鍵基因的挖掘利用，實現苦瓜抗白粉病分子育種有促進作用。研究表明，該分子標記的鑒定結果和田間接種鑒定結果一致，可在苗期白粉病未發病前對苦瓜育種材料進行分子標記輔助選擇。

技術領域

本發明屬于分子生物學領域，尤其涉及一種與苦瓜白粉病抗性主效QTL Pm3.1緊密連鎖的InDel分子標記與應用。

背景技術

苦瓜(Momordica charantia L.)為葫蘆科苦瓜屬一年生攀緣草本植物，具較高的營養價值和食療功效。近年來，苦瓜種植面積不斷增加，已成為“南菜北運”的主要蔬菜品種和特色產業。白粉病是瓜類蔬菜廣泛發生的一種世界性病害，從苗期至收獲期均可發生。近年來，隨著瓜類蔬菜種植面積的增加和規模化發展，白粉病已成為導致減產和果實品質下降，阻礙綠色生產的主要病害之一。如在廣西苦瓜種植基地五塘鎮，年栽培面積近2萬畝，年產量超過4500萬公斤，而白粉病的發病率高達90％以上，因白粉病導致的產量損失近1000萬公斤，經濟收益損失達1500萬元，導致嚴重的經濟損失。

白粉病在苦瓜田間生長的各個時期均可發生，在苗期發病可造成苦瓜生長勢減弱，發育遲緩；在開花期發病可導致苦瓜減產20-40％；在結瓜期發病，會導致植株葉片枯黃，果實生長緩慢，植株早衰，嚴重影響果實的品質和產量。農戶在防治白粉病的過程中耗費了大量的勞動力和農資，過度使用的農藥對產品質量及環境都造成極大的損害，因此，培育出抗病品種是防御白粉病的一條最安全、經濟、有效的途徑。

由于白粉病菌只能采用活體保存，發病程度容易受環境影響等特點，給抗病性鑒定帶來極大不便，傳統抗病育種周期長，需要大量及多代配置雜交組合及接種白粉病觀察，嚴重阻礙了瓜類蔬菜抗白粉病品種選育進程。

隨著分子生物學技術的飛速發展，分子育種技術大大加快了抗病育種的進程，顯著縮短了抗病品種選育的周期。DNA分子標記技術因其具有多態性高、檢測方便、快速、準確等特點，在農作物抗病遺傳育種中發揮了極其重要的作用。

InDel(Insertion-deletion，插入缺失序列)分子標記是指同一物種個體之間或是近緣物種發生堿基序列缺失或插入。在基因組中InDel的密度僅次于SNPs，其數目多且分布廣泛。由于InDel分子標記本身的豐富性，隨著高通量測序的發展使其適用于全基因組，具有以下優點：其多態性分布在種間和種內，具有通用性；其檢測方法便捷且技術要求低等，現在普遍被應用于分子輔助遺傳育種、群體遺傳分析和遺傳圖譜構建等方面。在InDel分子標記技術通常基于聚合酶鏈式反應(PCR)擴增技術，本質上屬于長度多態性標記。InDel分子標記技術具有共顯性、操作簡便和穩定性好等特點，是一種較理想的分子標記技術。

然而，目前有關苦瓜白粉病主效QTL精細定位及其相關分子標記的研究尚不完善

發明內容

本發明要解決的技術問題是提供一種苦瓜白粉病抗性主效QTL Pm3.1緊密連鎖的InDel分子標記與應用。

為解決上述技術問題，本發明采用以下技術方案：

一種苦瓜白粉病抗性主效QTL Pm3.1緊密連鎖的InDel分子標記，該分子標記為InDel0362，它具有序列表中SEQ.ID.NO.1的堿基序列。

該分子標記由引物InDel0362 F和InDel0362 R擴增而得，引物InDel0362 F和InDel0362 R分別具有序列表中SEQ.ID.NO.2和SEQ.ID.NO.3的堿基序列。