[發明專利]全切片病理圖像讀圖系統有效
| 申請號: | 202110578196.2 | 申請日: | 2021-05-26 |
| 公開(公告)號: | CN113470791B | 公開(公告)日: | 2022-04-22 |
| 發明(設計)人: | 王書浩;王朗 | 申請(專利權)人: | 透徹影像(北京)科技有限公司 |
| 主分類號: | G16H30/20 | 分類號: | G16H30/20;G06F9/54 |
| 代理公司: | 北京冠和權律師事務所 11399 | 代理人: | 趙銀萍 |
| 地址: | 100000 北京市大興區北京*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 切片 病理 圖像 讀圖 系統 | ||
本發明提供一種全切片病理圖像讀圖系統,包括驅動接口層、緩存層、RPC層以及應用程序接口層;其中,所述驅動接口層用于獲取病理圖像的文件標識符,根據所述文件標識符,確定文件格式,并確定所述文件格式對應的統一文件接口;所述緩存層用于基于所述統一文件接口,存儲對應的病理圖像至預設的內存,生成病理圖像數據,并向RPC層應用和應用程序接口層優先提供病理圖像數據;所述RPC層用于基于預設的RPC框架內的調用機制,獲取并調用病理圖像數據,確定調用結果;其中,所述調用機制包括本地調用和RPC調用;所述應用程序接口層用于對所述調用結果進行統一封裝,生成應用程序接口,并向驅動接口層、緩存層和RPC層統一提供。
技術領域
本發明涉及數字化病理學、分布式存儲系統和RPC技術領域,特別涉及一種全切片病理圖像讀圖系統。
背景技術
近年來,病理學已經進入數字化時代,全切片病理圖像是數字化病理學的基礎,高質量病理圖像為病情診斷、遠程會診、病理數據共享、教學等多方面提供了便利條件;同時,病理圖像數據的積累為機器學習、深度學習等計算機輔助診斷提供了大數據支持,相比于其他圖像,病理圖像具有多層級、高分辨率、大尺寸的特點,安全存儲、快速讀取的優點。但是,病理相關的計算機輔助軟件均已讀圖為基礎,不同掃描儀廠商的病理圖像格式以及應用程序接口各異,給進一步軟件開發增加了難度,因此,為各種不同格式的病理圖像提供統一的讀圖接口十分必要。
發明內容
本發明提供一種全切片病理圖像讀圖系統,以解決上述背景技術出現的問題。
本發明提供一種全切片病理圖像讀圖系統,包括:
驅動接口層:用于獲取病理圖像的文件標識符,根據所述文件標識符,確定文件格式,并確定所述文件格式對應的統一文件接口;
緩存層:用于基于所述統一文件接口,存儲對應的病理圖像至預設的內存,生成病理圖像數據,并向RPC層應用和應用程序接口層優先提供病理圖像數據;
RPC層:用于基于預設的RPC框架內的調用機制,獲取并調用病理圖像數據,確定調用結果;其中,
所述調用機制包括本地調用和RPC調用;
應用程序接口層:用于對所述調用結果進行統一封裝,并向驅動接口層、緩存層和RPC層提供統一的應用程序接口。
優選的,所述驅動接口層包括:
圖像存儲模塊:用于獲取病理圖像所在的文件存儲系統,查找所述文件存儲系統的文件標識符,并根據所述文件標識符,將對應的文件存儲系統進行統一的接口封裝,確定文件系統接口;
圖像格式模塊:用于根據所述文件系統接口,讀取并解析對應的文件存儲系統,確定文件格式;其中,
所述文件格式至少包括:TIFF、TIF、SVS、KFB、TMAP、MDSS、MDSX和NDPI;
驅動接口模塊:用于基于預設的格式驗證機制和文件表識符,驗證病理圖像的文件格式,確定篩選病理圖像,并格式解析所述篩選病理圖像的文件格式,生成統一文件接口。
優選的,所述圖像存儲模塊包括:
存儲介質單元:用于獲取病理圖像所在的文件存儲系統,確定所述文件存儲系統的存儲介質;
文件標識符單元:用于根據所述存儲介質,生成文件存儲系統的文件標識符;
應用編程接口單元:用于根據所述文件標識符,為對應的文件存儲系統提供應用編程接口;
優先存儲數據單元:用于基于ALLUXIO內存的層次化架構,通過所述應用編程接口,優先存儲病理圖像,確定優先存儲數據;
文件系統接口單元:用于基于所述文件標識符,將優先存儲數據和對應的文件存儲系統進行統一的接口封裝,確定文件系統接口。
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