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[發明專利]全切片病理圖像讀圖系統有效

專利信息
申請號: 202110578196.2 申請日: 2021-05-26
公開(公告)號: CN113470791B 公開(公告)日: 2022-04-22
發明(設計)人: 王書浩;王朗 申請(專利權)人: 透徹影像(北京)科技有限公司
主分類號: G16H30/20 分類號: G16H30/20;G06F9/54
代理公司: 北京冠和權律師事務所 11399 代理人: 趙銀萍
地址: 100000 北京市大興區北京*** 國省代碼: 北京;11
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 切片 病理 圖像 讀圖 系統
【說明書】:

發明提供一種全切片病理圖像讀圖系統,包括驅動接口層、緩存層、RPC層以及應用程序接口層;其中,所述驅動接口層用于獲取病理圖像的文件標識符,根據所述文件標識符,確定文件格式,并確定所述文件格式對應的統一文件接口;所述緩存層用于基于所述統一文件接口,存儲對應的病理圖像至預設的內存,生成病理圖像數據,并向RPC層應用和應用程序接口層優先提供病理圖像數據;所述RPC層用于基于預設的RPC框架內的調用機制,獲取并調用病理圖像數據,確定調用結果;其中,所述調用機制包括本地調用和RPC調用;所述應用程序接口層用于對所述調用結果進行統一封裝,生成應用程序接口,并向驅動接口層、緩存層和RPC層統一提供。

技術領域

本發明涉及數字化病理學、分布式存儲系統和RPC技術領域,特別涉及一種全切片病理圖像讀圖系統。

背景技術

近年來,病理學已經進入數字化時代,全切片病理圖像是數字化病理學的基礎,高質量病理圖像為病情診斷、遠程會診、病理數據共享、教學等多方面提供了便利條件;同時,病理圖像數據的積累為機器學習、深度學習等計算機輔助診斷提供了大數據支持,相比于其他圖像,病理圖像具有多層級、高分辨率、大尺寸的特點,安全存儲、快速讀取的優點。但是,病理相關的計算機輔助軟件均已讀圖為基礎,不同掃描儀廠商的病理圖像格式以及應用程序接口各異,給進一步軟件開發增加了難度,因此,為各種不同格式的病理圖像提供統一的讀圖接口十分必要。

發明內容

本發明提供一種全切片病理圖像讀圖系統,以解決上述背景技術出現的問題。

本發明提供一種全切片病理圖像讀圖系統,包括:

驅動接口層:用于獲取病理圖像的文件標識符,根據所述文件標識符,確定文件格式,并確定所述文件格式對應的統一文件接口;

緩存層:用于基于所述統一文件接口,存儲對應的病理圖像至預設的內存,生成病理圖像數據,并向RPC層應用和應用程序接口層優先提供病理圖像數據;

RPC層:用于基于預設的RPC框架內的調用機制,獲取并調用病理圖像數據,確定調用結果;其中,

所述調用機制包括本地調用和RPC調用;

應用程序接口層:用于對所述調用結果進行統一封裝,并向驅動接口層、緩存層和RPC層提供統一的應用程序接口。

優選的,所述驅動接口層包括:

圖像存儲模塊:用于獲取病理圖像所在的文件存儲系統,查找所述文件存儲系統的文件標識符,并根據所述文件標識符,將對應的文件存儲系統進行統一的接口封裝,確定文件系統接口;

圖像格式模塊:用于根據所述文件系統接口,讀取并解析對應的文件存儲系統,確定文件格式;其中,

所述文件格式至少包括:TIFF、TIF、SVS、KFB、TMAP、MDSS、MDSX和NDPI;

驅動接口模塊:用于基于預設的格式驗證機制和文件表識符,驗證病理圖像的文件格式,確定篩選病理圖像,并格式解析所述篩選病理圖像的文件格式,生成統一文件接口。

優選的,所述圖像存儲模塊包括:

存儲介質單元:用于獲取病理圖像所在的文件存儲系統,確定所述文件存儲系統的存儲介質;

文件標識符單元:用于根據所述存儲介質,生成文件存儲系統的文件標識符;

應用編程接口單元:用于根據所述文件標識符,為對應的文件存儲系統提供應用編程接口;

優先存儲數據單元:用于基于ALLUXIO內存的層次化架構,通過所述應用編程接口,優先存儲病理圖像,確定優先存儲數據;

文件系統接口單元:用于基于所述文件標識符,將優先存儲數據和對應的文件存儲系統進行統一的接口封裝,確定文件系統接口。

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