[發明專利]全切片病理圖像讀圖系統有效
| 申請號: | 202110578196.2 | 申請日: | 2021-05-26 |
| 公開(公告)號: | CN113470791B | 公開(公告)日: | 2022-04-22 |
| 發明(設計)人: | 王書浩;王朗 | 申請(專利權)人: | 透徹影像(北京)科技有限公司 |
| 主分類號: | G16H30/20 | 分類號: | G16H30/20;G06F9/54 |
| 代理公司: | 北京冠和權律師事務所 11399 | 代理人: | 趙銀萍 |
| 地址: | 100000 北京市大興區北京*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 切片 病理 圖像 讀圖 系統 | ||
1.一種全切片病理圖像讀圖系統,其特征在于,包括:
驅動接口層:用于獲取病理圖像的文件標識符,根據所述文件標識符,確定文件格式,并確定所述文件格式對應的統一文件接口;
緩存層:用于基于所述統一文件接口,存儲對應的病理圖像至預設的內存,生成病理圖像數據,并向RPC層應用或應用程序接口層優先提供病理圖像數據;
RPC層:用于基于預設的RPC框架內的調用機制,獲取并調用病理圖像數據,確定調用結果;其中,
所述調用機制包括本地調用和RPC調用;
所述應用程序接口層用于對所述調用結果進行統一封裝,生成應用程序接口,并向驅動接口層、緩存層和RPC層統一提供。
2.如權利要求1所述的一種全切片病理圖像讀圖系統,其特征在于,所述驅動接口層包括:
圖像存儲模塊:用于獲取病理圖像所在的文件存儲系統,查找所述文件存儲系統的文件標識符,并根據所述文件標識符,將對應的文件存儲系統進行統一的接口封裝,確定文件系統接口;
圖像格式模塊:用于根據所述文件系統接口,讀取并解析對應的文件存儲系統,確定文件格式;其中,
所述文件格式至少包括TIFF、TIF、SVS、KFB、TMAP、MDSX和NDPI;
驅動接口模塊:用于基于預設的格式驗證機制和文件標識符,驗證病理圖像的文件格式,確定篩選病理圖像,并格式解析所述篩選病理圖像的文件格式,生成統一文件接口。
3.如權利要求2所述的一種全切片病理圖像讀圖系統,其特征在于,所述圖像存儲模塊包括:
存儲介質單元:用于獲取病理圖像所在的文件存儲系統,確定所述文件存儲系統的存儲介質;
文件標識符單元:用于根據所述存儲介質,生成文件存儲系統的文件標識符;
應用編程接口單元:用于根據所述文件標識符,為對應的文件存儲系統提供應用編程接口;
優先存儲數據單元:用于基于ALLUXIO內存的層次架構,通過所述應用編程接口,優先存儲病理圖像,確定優先存儲數據;
文件系統接口單元:用于基于所述文件標識符,將優先存儲數據和對應的文件存儲系統進行統一的接口封裝,確定文件系統接口。
4.如權利要求3所述的一種全切片病理圖像讀圖系統,其特征在于,所述優先存儲數據單元包括:
病理數據子單元:用于獲取病理圖像,根據所述病理圖像,生成病理數據;
公共接口子單元:用于基于ALLUXIO內存的層次架構,讀取所述病理數據的存儲層,將所述病理數據從所在的存儲層移動至ALLUXIO緩存,并生成公共接口;
連接子單元:通過所述公共接口,連接ALLUXIO內存的層次架構和文件存儲系統。
5.如權利要求2所述的一種全切片病理圖像讀圖系統,其特征在于,所述驅動接口模塊包括:
解析數據子單元:用于獲取病理圖像的文件標識符,解析所述文件標識符對應的文件系統信息,生成解析數據;
驗證結果子單元:用于基于解析結果,驗證病理圖像的文件系統是否可用,確定驗證結果;
格式化子單元:用于當所述驗證結果顯示病理圖像的文件系統不可用時,格式化所述病理圖像;
文件格式子單元:用于當所述驗證結果顯示病理圖像的文件系統可用時,對所述文件系統進行格式解析,并確定文件格式;
格式解析子單元:用于根據所述文件格式,調用文件格式對應的統一文件接口。
6.如權利要求1所述的一種全切片病理圖像讀圖系統,其特征在于,所述緩存層包括第一層哈希表和第二層哈希表,所述第一層哈希表和第二層哈希表均可配置的,并設有緩存淘汰機制;其中,
所述第一層哈希表以圖像文件標識符為索引;
所述第二層哈希表以圖像塊層級和圖像塊位置的圖像塊組合作為索引;
所述緩存淘汰機制由LRU算法和超時時間組合實現。
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