[發明專利]抗精神病藥物療效預測相關的甲基化生物標記

有效

• 申請號: 202110565510.3
• 申請日: 2021-05-24
• 公開（公告）號: CN113355406B
• 公開（公告）日: 2022-08-30
• 發明（設計）人: 岳偉華;張岱;郭良坤;蘇怡;閻浩;盧天蘭;陳冬雪;常素華
• 申請（專利權）人: 北京大學第六醫院
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12N15/11
• 代理公司: 北京匯知杰知識產權代理有限公司 11587
• 代理人: 楊巍;柴春玲

本發明屬于生物醫藥技術領域，提供了一種基于甲基化生物標記的抗精神病藥物療效預測模型及其構建方法和應用。所述構建方法包括：1)獲取患者的抗精神病藥物治療病歷數據以及基因甲基化數據；2)基于所述患者的抗精神病藥物治療病歷數據與基因甲基化數據，獲取與患者治療響應相關的特征；3)將所述治療響應相關的特征輸入預測模型進行訓練，建立抗精神病藥物療效預測模型。本發明還公開了一種基于甲基化生物標記的抗精神病藥物療效預測系統。本發明通過提供一種抗精神病藥物療效預測模型，從而更加準確地評估抗精神病藥物的療效，同時提供個體化用藥的決策支持。

技術領域

本發明屬于生物技術領域，更具體而言，本發明涉及基于甲基化生物標記的抗精神病藥物療效預測模型及其構建方法。

背景技術

精神分裂癥(schizophrenia,SCH)是一種常見重性精神障礙，臨床表現復雜、診斷主觀化、治療經驗化等問題突出。長期使用抗精神病藥物(antipsychotic drugs,APDs)是治療SCH的重要方法，但因個體化差異及臨床表型復雜等原因，對于同一種抗精神病藥物，不同患者在使用藥物治療以后，由于個體差異，其精神病性癥狀(陽性癥狀如幻聽、妄想，陰性癥狀如情感淡漠、注意力缺陷等)的改善程度不盡相同(臨床治療響應、臨床痊愈、治療抵抗)，僅1/3的SCH患者療效較好。實際臨床治療過程中，藥物的選擇多基于國內外指南并結合臨床醫生的個人經驗，無法根據患者個體特質優化用藥方案。

目前存在的試劑盒是通過藥物基因檢測，該檢測是基因檢測的一個分支，通過對多個藥效基因，藥代基因以及毒性基因的檢測來進行藥物代謝，藥物療效以及不良反應的預測。其中，藥效基因包括SLC6A4、HTR2A、DRD2；藥代基因包括CYP2D6、CYP2C19、CYP1A2，UGT2B15、UGT2B7；以及獨行基因MC4R、ANKK1、HTR2C、HLA等。

現有的試劑盒大多依靠基因上的多個位點的基因多態性來進行預測，但是這種預測更多是對藥物代謝水平的預測，對于藥物療效的預測較少，并且這種預測沒有將環境因素所導致的改變納入考量，導致精確度較低。

因此，根據傳統的試劑盒獲得的抗精神病藥物的治療效果不夠準確，本領域亟需一種抗精神病藥物療效預測系統。

發明內容

本發明的目的是一種抗精神病藥物療效預測系統，以根據患者的個體特質即特定甲基化位點的水平，精確預測抗精神病藥物對患者的個體療效。

因此，在第一方面，本發明提供了一種構建基于甲基化生物標記的抗精神病藥物療效預測模型的方法，所述方法包括：

1)獲取患者的抗精神病藥物治療病歷數據以及基因甲基化數據；

2)基于所述患者的抗精神病藥物治療病歷數據與基因甲基化數據，獲取與患者治療響應相關的特征；

3)將所述治療響應相關的特征輸入預測模型進行訓練，建立抗精神病藥物療效預測模型。

在一個實施方案中，在2)中，以患者治療開始后的6周末PANSS減分率等于50％為標準，將患者分為響應不良患者和響應良好患者，例如PANSS減分率小于50％的患者為對抗精神病藥物的治療響應不良患者，而PANSS減分率大于50％或等于50％的患者為對抗精神病藥物治療響應良好患者。

在一個實施方案中，所述抗精神病藥物為奧氮平、利培酮或阿立哌唑。

在一個實施方案中，在1)中，所述患者病例數據為處于精神分裂癥急性發作期，開始治療前的PANSS分數符合“在7個陽性癥狀中，分數大于或等于4分的癥狀的數量大于或等于3個”的患者。

在一個實施方案中，在2)中，所述治療響應相關的特征包括：患者PANSS基線評分、患者治療后6周末的PANSS評分、性別、年齡、患者所使用的抗精神病藥物、基因甲基化數據和/或患者的分類(即響應不良患者和響應良好患者)。