[發明專利]抗精神病藥物療效預測相關的甲基化生物標記

有效

• 申請號: 202110565510.3
• 申請日: 2021-05-24
• 公開（公告）號: CN113355406B
• 公開（公告）日: 2022-08-30
• 發明（設計）人: 岳偉華;張岱;郭良坤;蘇怡;閻浩;盧天蘭;陳冬雪;常素華
• 申請（專利權）人: 北京大學第六醫院
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12N15/11
• 代理公司: 北京匯知杰知識產權代理有限公司 11587
• 代理人: 楊巍;柴春玲

1.一種構建基于甲基化生物標記的抗精神病藥物療效預測模型的方法，所述方法包括：

1）獲取患者的抗精神病藥物治療病歷數據以及基因甲基化數據；

2）基于所述患者的抗精神病藥物治療病歷數據與基因甲基化數據，獲取與患者PANSS評分改善相關的特征；

3）將所述PANSS評分改善相關的特征輸入預測模型進行訓練，建立抗精神病藥物療效預測模型；

4）使用偏相關分析，將年齡、性別、所使用的抗精神病藥物種類作為控制變量，將患者6周末隨訪點的PANSS減分率作為因變量，預測模型所獲得的靶探針多甲基化評分（tPMS）作為自變量，以擬合患者最終的抗精神病藥物治療響應分數；

其中，所述基因甲基化數據包括：cg00080972、cg01955137、cg02136620、cg05457628、cg06118287、cg08058472、cg09060608、cg14820908、cg19626725、cg20199595、cg21226059、cg22764044、cg25658438和cg26516362；

所述抗精神病藥物為奧氮平、利培酮或阿立哌唑；

所述方法還包括以患者治療開始后的6周末PANSS減分率以50%為標準，將患者分為響應不良患者和響應良好患者，其中PANSS減分率小于50%的患者為對抗精神病藥物的治療響應不良患者，而PANSS減分率大于50%或等于50%的患者為對抗精神病藥物治療響應良好患者。

2.根據權利要求1的方法，所述患者為處于精神分裂癥急性發作期，開始治療前的陽性與陰性癥狀量表分數符合“在7個陽性癥狀中，分數大于或等于4分的癥狀的數量大于或等于3個”的患者。

3.根據權利要求1或2的方法，所述PANSS評分改善相關的特征包括：患者陽性與陰性癥狀量表基線評分、患者治療后6周末的陽性與陰性癥狀量表評分、性別、年齡、患者所使用的抗精神病藥物、基因甲基化數據和/或患者的分類，其中所述患者的分類是指將患者分為響應不良患者和響應良好患者。

4.根據權利要求1或2的方法，在3）中，所述預測模型為隨機森林模型或支持向量機模型。

5.一種基于甲基化生物標記的抗精神病藥物療效預測系統，所述系統包括：

病例數據單元，被配置用于獲取患者病例數據以及基因甲基化數據；

預處理單元，被配置用于根據患者病例數據與基因甲基化數據進行篩選，獲取與患者PANSS評分改善相關的特征；

模型建立單元，被配置用于將篩選后的特征輸入預測模型進行訓練，建立抗精神病藥物療效預測模型；

預測單元，被配置用于使用偏相關分析，將年齡、性別、所使用的抗精神病藥物種類作為控制變量，將患者6周末隨訪點的PANSS減分率作為因變量，預測模型所獲得的靶探針多甲基化評分（tPMS）作為自變量，以擬合患者最終的抗精神病藥物治療響應分數；

其中，所述基因甲基化數據包括：cg00080972、cg01955137、cg02136620、cg05457628、cg06118287、cg08058472、cg09060608、cg14820908、cg19626725、cg20199595、cg21226059、cg22764044、cg25658438和cg26516362；

所述抗精神病藥物為奧氮平、利培酮或阿立哌唑；

所述系統還包括以患者治療開始后的6周末PANSS減分率以50%為標準，將患者分為響應不良患者和響應良好患者，其中PANSS減分率小于50%的患者為對抗精神病藥物的治療響應不良患者，而PANSS減分率大于50%或等于50%的患者為對抗精神病藥物治療響應良好患者。