[發明專利]一種基于滾環擴增產物自組裝DNA水凝膠的適配體傳感器及其應用有效
| 申請號: | 202110564302.1 | 申請日: | 2021-05-24 |
| 公開(公告)號: | CN113189323B | 公開(公告)日: | 2023-09-15 |
| 發明(設計)人: | 徐斐;郝麗玲;劉馨娜;彭開敏 | 申請(專利權)人: | 上海理工大學 |
| 主分類號: | C12N15/115 | 分類號: | C12N15/115;G01N33/53;G01N33/68 |
| 代理公司: | 無錫華源專利商標事務所(普通合伙) 32228 | 代理人: | 聶啟新 |
| 地址: | 200093 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基于 擴增 產物 組裝 dna 凝膠 適配體 傳感器 及其 應用 | ||
1.一種基于滾環擴增產物自組裝DNA水凝膠的適配體傳感器,其特征在于,所述適配體傳感器包括OTA適配體、目標物、SH-PEG功能化納米金、引物、核酸外切酶Ⅰ、鎖式探針、T4DNA連接酶和Phi29?DNA聚合酶;
所述OTA適配體序列如SEQ?No.1所示;
所述引物序列如SEQ?No.2所示;
所述鎖式探針序列如SEQ?No.3所示;
所述適配體傳感器的制備方法,包括以下步驟:
(1)制備SH-PEG功能化納米金;
(2)制備DNA水凝膠;
(3)將制備的SH-PEG功能化納米金加入到DNA水凝膠中得到AuNPs/DNA水凝膠;在90℃孵育30min,然后冷卻至室溫;
SH-PEG功能化納米金與DNA水凝膠的用量比例為:5mL?SH-PEG功能化納米金加入30μLDNA水凝膠體系中;
(4)將AuNPs/DNA水凝膠在2000rpm條件下離心10min,用UV-1800紫外分光光度計測定其在530nm處的吸光度。
2.根據權利要求1所述的適配體傳感器,其特征在于,所述SH-PEG功能化納米金的制備方法為:
(1)將0.5mL?1%的HAuCl4·4H2O水溶液加入50mL純水中,在攪拌下加熱至沸騰;
(2)向其中加入0.4mL?5%的檸檬酸鈉水溶液,保持沸騰30min,將制備得到的酒紅色溶液冷卻至室溫,避光保存于4℃備用;
(3)取5mL步驟(2)制備得到的酒紅色溶液,向其中加入0.25mL濃度為5×10-5M的SH-PEG,在37℃下孵育12h,然后以10000rpm離心10min,棄去上清液,制得沉淀即為SH-PEG功能化納米金,將沉淀分散在30μL純水中備用。
3.根據權利要求2所述的適配體傳感器,其特征在于,步驟(1)中,1%HAuCl4·4H2O水溶液的配制方法為:將1gHAuCl4·4H2O溶解并定容于100mL純水中。
4.根據權利要求1所述的適配體傳感器,其特征在于,所述DNA水凝膠的制備方法為:
(1)將20μL?10-5M?OTA適配體和20μL?10-5M引物混合并在95℃下退火10min,后采用梯度降溫法進行雜交以獲得適配體-引物雜交復合物;
(2)向其中加入5μL核酸外切酶Ⅰ以酶解未結合的DNA單鏈,制備得到純化后的適配體-引物雜交復合物;
(3)取10.5μL步驟(2)所得純化后的適配體-引物雜交復合物,加入待測OTA濃度的目標物,再向其中加入10.5μL?10-5M鎖式探針及1.0μL?T4?DNA連接酶混合均勻并在37℃下孵育45min;T4?DNA連接酶的酶活為5.0U/mL;
(4)隨后向其中加入6.4μL?10mM?dNTPs、2.0μL?10u/mL?Phi29DNA聚合酶,混合均勻后于37℃孵育2.5h,此后置于4℃孵育12h,對所得產物用純水洗滌2次后得到DNA水凝膠。
5.根據權利要求4所述的適配體傳感器,其特征在于,步驟(1)中,梯度降溫法進行雜交的條件為95℃反應10min,然后自然降溫至25℃;步驟(2)中,酶解的條件為37℃反應30min后,于80℃反應15min。
6.一種權利要求1所述基于滾環擴增產物自組裝DNA水凝膠的適配體傳感器的應用,其特征在于,所述適配體傳感器用于檢測赭曲霉毒素A。
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