[發(fā)明專利]一種檢測(cè)病原微生物的方法及試劑盒在審
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 202110550261.0 | 申請(qǐng)日: | 2021-05-20 |
| 公開(公告)號(hào): | CN113136420A | 公開(公告)日: | 2021-07-20 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 郭文滸;薛怡婷;楊露;浦世珺 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 阿吉安(福州)基因醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室有限公司 |
| 主分類號(hào): | C12Q1/686 | 分類號(hào): | C12Q1/686 |
| 代理公司: | 福州市博深專利事務(wù)所(普通合伙) 35214 | 代理人: | 董晗 |
| 地址: | 350108 福建省福州市*** | 國(guó)省代碼: | 福建;35 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 檢測(cè) 病原微生物 方法 試劑盒 | ||
1.一種檢測(cè)病原微生物的試劑盒,其特征在于,包括逆轉(zhuǎn)錄酶和Tn5轉(zhuǎn)座酶;
所述逆轉(zhuǎn)錄酶為突變型逆轉(zhuǎn)錄酶,所述突變型逆轉(zhuǎn)錄酶的突變位點(diǎn)為:P55I、D204E、T334S、E566Q、D587N和L607I;
所述Tn5轉(zhuǎn)座酶為突變型Tn5轉(zhuǎn)座酶,所述突變型Tn5轉(zhuǎn)座酶的突變位點(diǎn)為:K54E、I64Y、K160R、K200R和S303G。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的檢測(cè)病原微生物的試劑盒,其特征在于,所述逆轉(zhuǎn)錄酶的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述逆轉(zhuǎn)錄酶的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的檢測(cè)病原微生物的試劑盒,其特征在于,所述Tn5轉(zhuǎn)座酶的氨基酸序列如SEQ ID NO.3所示,所述Tn5轉(zhuǎn)座酶的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的檢測(cè)病原微生物的試劑盒,其特征在于,還包括逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)液、Tn5轉(zhuǎn)座酶反應(yīng)液、引物、混合引物反應(yīng)液、高保真擴(kuò)增反應(yīng)液和高保真擴(kuò)增酶。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的檢測(cè)病原微生物的試劑盒,其特征在于,還包括高保真擴(kuò)增反應(yīng)液,所述高保真擴(kuò)增反應(yīng)液包括0.1-5mmol/L的5-碘-2'-脫氧尿苷、0.05-10mol/L三羥甲基氨基甲烷鹽酸鹽、0.01-0.05%的二甲基亞砜、0.005-0.01%的聚乙二醇和0.1-50mmol/L的檸檬酸二鈉。
6.一種檢測(cè)病原微生物的方法,其特征在于,包括以下步驟:
步驟1、提取樣本的DNA和RNA,然后加入無核酸酶水進(jìn)行孵育;
步驟2、在步驟1所得孵育后的核酸中加入逆轉(zhuǎn)錄酶,使RNA逆轉(zhuǎn)錄,然后加入Tn5轉(zhuǎn)座酶進(jìn)行片段化,片段化結(jié)束加入終止液停止片段化反應(yīng);
步驟3、對(duì)步驟2所得產(chǎn)物進(jìn)行鏈置換、文庫富集、文庫純化和質(zhì)檢后進(jìn)行測(cè)序;
所述逆轉(zhuǎn)錄酶為突變型逆轉(zhuǎn)錄酶,所述突變型逆轉(zhuǎn)錄酶的突變位點(diǎn)為:P55I、D204E、T334S、E566Q、D587N和L607I;
所述Tn5轉(zhuǎn)座酶為突變型Tn5轉(zhuǎn)座酶,所述突變型Tn5轉(zhuǎn)座酶的突變位點(diǎn)為:K54E、I64Y、K160R、K200R和S303G。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的檢測(cè)病原微生物的方法,其特征在于,所述鏈置換為:在步驟3所得產(chǎn)物中加入引物、高保真擴(kuò)增反應(yīng)液和高保真擴(kuò)增酶進(jìn)行鏈置換,替換RNA鏈。
8.根據(jù)權(quán)利要求6所述的檢測(cè)病原微生物的方法,其特征在于,所述樣本為血漿、腦脊液、骨髓液、房水、胸腹水、關(guān)節(jié)積液、組織、尿液、膿腫抽液、肺泡灌洗液、痰液或鼻咽拭子。
9.根據(jù)權(quán)利要求6所述的檢測(cè)病原微生物的方法,其特征在于,所述步驟2中取1-5ng步驟1所得孵育后的核酸。
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