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[發明專利]一種重組突變型Tn5轉座酶的制備及應用有效

專利信息
申請號: 202110445159.4 申請日: 2021-04-25
公開(公告)號: CN113136374B 公開(公告)日: 2022-10-21
發明(設計)人: 呂培濤;朱文俊 申請(專利權)人: 福建農林大學
主分類號: C12N9/12 分類號: C12N9/12;C12N15/10;C12N15/62;C07K19/00;C12N15/70;C12Q1/6806
代理公司: 福州元創專利商標代理有限公司 35100 代理人: 劉佳;蔡學俊
地址: 350002 福*** 國省代碼: 福建;35
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 一種 重組 突變型 tn5 轉座酶 制備 應用
【權利要求書】:

1.一種重組突變型Tn5轉座酶,其特征在于,所述重組突變型Tn5轉座酶構建方法包括:

(1)以原突變型Tn5轉座酶基因為模板,進一步改造突變M56A與E345K兩個位點,獲得Tn5m核苷酸片段;

(2)將Tn5m核苷酸片段與EF或TRX1核苷酸片段通過重組反應,獲得EF-Tn5m轉座酶或TRX1-Tn5m轉座酶的核苷酸片段;

(3)所述EF-Tn5m轉座酶的氨基酸序列如SEQ ID NO.4所示,核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示;所述TRX1-Tn5m轉座酶的氨基酸序列如SEQ ID NO.6所示,核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示;

步驟(1)所述改造突變M56A與E345K兩個位點所需要的引物包括:

56A-F:5′-GGCAGCAAAGCCGCCCAGGAAGGCGCGTAT-3′;

56A-R:5′-ATACGCGCCTTCCTGGGCGGCTTTGCTGCC-3′;

345K-F:5′-CAGCGTATGGAAAAACCGGATAACCTG-3′;

345K-R:5′-CAGGTTATCCGGTTTTTCCATACGCTG-3′。

2.一種包含權利要求1所述重組突變型Tn5轉座酶的核苷酸序列的載體,其特征在于,將所述EF-Tn5m轉座酶、TRX1-Tn5m轉座酶的核苷酸片段利用同源重組分別克隆到表達載體pET30a中。

3.一種利用權利要求2所述載體表達制備重組突變型Tn5轉座酶的方法,其特征在于,包括以下步驟:

(1)將表達載體轉入C3013感受態細胞中,放入冰上孵育30 min,再熱激60 s,隨后冰上孵育5 min;加入200 μL LB液體培養基,放入搖床復蘇30 min后,涂布于終濃度50 μg/mL卡那霉素固體培養基上,37℃過夜培養;第二天挑取單菌落進行測序驗證;

(2)將含有正確目的序列的單菌落接種于10 mL LB液體培養基,37℃培養過夜,從中取1 mL 接種于100 mL LB液體培養基,擴大培養至OD600 = 0.5,加入終濃度0.25 mM的IPTG誘導重組突變型Tn5蛋白表達;誘導6 h后,用50 mL離心管收集菌體,用于蛋白純化;

(3)向菌體中加入10 mL 結合緩沖液 ,隨后于超聲波細胞破碎儀中進行菌體破碎,再加入50 μL PEI(Sigma,P3143)沉淀菌液中的DNA分子,在4℃ 12 ,000g條件下離心10 min取上層清液;將上清液加入到已經預先平衡好的親和柱中,待上清液流盡后,分別用結合緩沖液和漂洗緩沖液洗滌一次,然后加入10 mL 洗脫液,待液體流出一個柱體積后,封閉親和柱,放于4℃冰箱過夜,第二天釋放蛋白溶液,獲得重組突變型Tn5蛋白溶液;

(4)重組突變型Tn5轉座酶裝配:分別按摩爾比ME-A:ME-R = 1:1,ME-B:ME-R = 1:1進行混勻并退火形成Tn5 接頭A和接頭B,然后將接頭A與接頭B等體積比混合,得到Tn5接頭AB;將步驟(3)所述重組突變型Tn5蛋白溶液進行超濾濃縮并用儲存緩沖液置換,再按體積比1:0.5;1:1和1:2加入混合的Tn5接頭AB,最后加入終濃度為50%的甘油,混合均勻,20℃孵育40 min;

所述儲存緩沖液配方為:20 mM Tris-HCl pH 8.0;0.15 M NaCl;1 mM EDTA;

結合緩沖液配方為:10 mM Tris-HCl pH 8.0;1 M NaCl;1 mM EDTA;10%甘油;0.1%Triton X-100;

漂洗緩沖液配方為:10 mM Tris-HCl pH 8.0;2 M NaCl;1 mM EDTA;10%甘油;0.1%Triton X-100;

洗脫液配方為:20 mM Tris-HCl pH 8 .0;0.5 M NaCl;1 mM EDTA;50 mM DTT。

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