[發明專利]一種智力障礙疾病相關的ATRX基因的突變位點及檢測試劑盒

有效

• 申請號: 202110437546.3
• 申請日: 2021-04-22
• 公開（公告）號: CN113151445B
• 公開（公告）日: 2022-07-15
• 發明（設計）人: 吳軻;叢研
• 申請（專利權）人: 義烏市婦幼保健院
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12N15/11
• 代理公司: 北京祺和祺知識產權代理有限公司 11501
• 代理人: 張業放

本發明提供了一種智力障礙疾病相關的ATRX基因的突變位點，所述突變位點位于所述ATRX基因的24號內含子，所述突變位點的突變信息為：c.5786+4(IVS24)AG(NM_000489.6)；同時，本發明還分別提供了用于輔助診斷智力障礙疾病DNA檢測試劑盒與mRNA檢測試劑盒，所述DNA檢測試劑盒用于對上述所述的突變位點進行檢測，所述mRNA檢測試劑盒用于對上述所述突變的ATRX基因轉錄的mRNA進行檢測，可以直接通過一代測序，檢測第一方面中所述的突變位點及ATRX基因轉錄所得的mRNA，明確了該突變致病性，揭示了該突變引起智力障礙的發病機制，亦可用于ATRX基因相關智力障礙疾病的精準診斷。

技術領域

本發明涉及生物技術領域，更具體地，本發明涉及一種智力障礙疾病相關的ATRX基因的突變位點及檢測試劑盒。

背景技術

智力障礙(intellectual disability，ID)疾病是指患者在18歲之前，認知功能和社會適應能力明顯缺陷，表現為智力測試IQ值小于70。ID患者臨床表型多樣，既有表現為智力障礙，也可能伴發先天性畸形或其他神經系統異常如自閉癥譜系障礙(autism spectrumdisorder，ASD)、癲癇等。在全球范圍內，ID發病率約為1～3％。據相關研究報道，一位智力障礙患者終身的醫療花費可達100萬美元。ID主要分為遺傳因素和非遺傳因素，遺傳因素約占ID病因2/3，可見，ID的臨床表型復雜且存在顯著的遺傳異質性。所以如果能及早地對疾病精準診斷，并及時地進行治療康復干預，盡可能地減少智力障礙的發生。

現有研究已經發現700個以上與ID相關的基因，其中包括ATRX基因，但總體上看，目前關于ATRX基因突變的ID患者報道數量仍比較少，且主要以外顯子突變為主，尚無ATRX基因內含子突變的相關報道。

發明內容

本發明針對現有技術存在的不足，提供了一種智力障礙疾病相關的ATRX基因的突變位點及檢測試劑盒，有利于推動開展該類疾病的分子診斷。

第一方面，提供了如下技術方案，包括一種突ATRX基因的突變位點，所述ATRX基因的突變位點導致智力障礙疾病發生，所述突變位點位于所述ATRX基因的24號內含子，所述突變位點的突變信息為：c.5786+4(IVS24)AG(NM_000489.6)。

其他優化的技術方案中，所述突變位點的基因組核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。

第二方面，提供了一種用于輔助診斷智力障礙疾病DNA檢測試劑盒，所述DNA檢測試劑盒用于對上述第一方面中任一方案中所述的突變位點進行檢測。

在其他優化的技術方案中，所述DNA檢測試劑盒包括所述突變位點的擴增引物，所述突變位點的擴增引物包括上游引物和下游引物，所述上游引物的核苷酸序列如SEQ IDNO:2所示，所述下游引物的核苷酸序列為SEQ ID NO:3所示。

第三方面，提供了一種用于輔助診斷智力障礙疾病的mRNA檢測試劑盒，所述mRNA檢測試劑盒用于對上述第一方面中任一方案中所述的ATRX基因轉錄的mRNA進行檢測。

在其他優化的技術方案中，所述mRNA檢測試劑盒包括所述突變ATRX基因的外顯子的擴增引物，所述外顯子包括Exon 23～25，所述Exon 23～25的擴增引物均包括上游引物和下游引物。

在其他優化的技術方案中，所所述mRNA檢測試劑盒用于檢測Exon24的是否缺失。

在其他優化的技術方案中，所述mRNA檢測試劑盒用于檢測Exon24是否整體缺失。

在其他優化的技術方案中，所述Exon23～25的上游引物的核苷酸序列如SEQ IDNO:18所示，所述下游引物的核苷酸序列為SEQ ID NO:19所示。