[發明專利]與花生出仁率主效QTL位點qSPA07.1和qSPA08.2連鎖的分子標記及應用

有效

• 申請號: 202110389360.5
• 申請日: 2021-04-12
• 公開（公告）號: CN112980996B
• 公開（公告）日: 2022-06-17
• 發明（設計）人: 姜慧芳;劉念;李威濤;羅懷勇;黃莉;周小靜;陳偉剛;雷永;陳玉寧;廖伯壽
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院油料作物研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 北京路浩知識產權代理有限公司 11002
• 代理人: 孫怡

本發明涉及分子標記技術領域，具體涉及與花生出仁率主效QTL位點qSPA07.1和qSPA08.2連鎖的分子標記及應用。本發明的與花生出仁率主效QTL位點連鎖的分子標記為A07.Indel或A08.Indel；分子標記A07.Indel與QTL位點qSPA07.1連鎖，所述分子標記A07.Indel能夠通過如SEQ ID NO.1?2所示的引物對擴增得到；分子標記A08.Indel與QTL位點qSPA08.2連鎖，所述分子標記A08.Indel能夠通過如SEQ ID NO.3?4所示的引物對擴增得到。采用本發明的分子標記能夠在花生育種中輔助選擇高出仁率的材料，有利于提高高出仁率品種的選育效率。

技術領域

本發明涉及分子標記技術領域，具體涉及與花生出仁率主效QTL位點連鎖的分子標記及其應用。

背景技術

花生(Arachis hypogea L.)是世界范圍內重要的油料作物和經濟作物，是重要的食用植物油脂和蛋白質來源。花生種子富含油脂、蛋白質、維生素和其他優異的礦質元素，除了鮮食外還可以加工為食用油、花生醬、堅果、點心等。出仁率是花生籽仁重量占莢果重量的百分比，是影響花生產量的重要因素。因此提高出仁率是花生生產上重要的育種目標之一。如何快速、準確選育高出仁率的花生品種是花生遺傳改良研究的重要方向。

常見花生核心種質中出仁率表型變異在59.9％-81％之間，具有較大的遺傳改良潛力。出仁率與大多數重要的產量性狀一樣是數量性狀，容易受到環境的影響。因此常規育種直接對材料出仁率表型的選擇往往效率不高，周期長。

QTL分析是通過對樣本的表型結果和分子標記基因型進行連鎖分析，在高密度遺傳連鎖圖譜上定位控制某一性狀的多個位點，從而將復雜的數量性狀進行分解為控制數量性狀的多個基因。隨著測序成本的降低，可以通過重測序、簡化基因組測序等開發全基因組高密度的分子標記，以此構建高密度的遺傳連鎖圖譜，結合表型數據，利用連鎖分析方法可以在基因組上精細定位到多個控制目標農藝性狀的QTL位點。通過與QTL緊密連鎖的分子標記對目標表型性狀進行選擇，可以提高目標性狀的育種效率。

目前檢測到的花生出仁率的QTL數目相對較少，效應值偏低，在不同環境表達的穩定性未知，在花生育種中應用有限。

發明內容

本發明針對現有技術的不足，目的在于提供兩個穩定的花生出仁率主效 QTL位點及其連鎖的標記，用于高出仁率的花生材料的分子標記輔助選擇。

具體地，本發明提供如下技術方案：

第一方面，本發明提供與花生出仁率主效QTL位點連鎖的分子標記，所述分子標記為A07.Indel或A08.Indel；

分子標記A07.Indel與QTL位點qSPA07.1連鎖，所述分子標記A07.Indel能夠通過如SEQ ID NO.1-2所示的引物對擴增得到；

分子標記A08.Indel與QTL位點qSPA08.2連鎖，所述分子標記A08.Indel能夠通過如SEQ ID NO.3-4所示的引物對擴增得到。

第二方面，本發明提供與花生出仁率主效QTL位點連鎖的分子標記組合，所述分子標記組合包括A07.Indel和A08.Indel，分子標記A07.Indel和分子標記 A08.Indel如上所述。

第三方面，本發明提供用于擴增上述分子標記或分子標記組合的引物。

所述引物包括如SEQ ID NO.1-2和/或SEQ ID NO.3-4所示的序列。

第四方面，本發明提供含有上述引物的試劑或試劑盒。

第五方面，本發明提供上述分子標記或分子標記組合或引物或試劑或試劑盒的以下任一應用：

(1)在鑒定花生出仁率性狀表型中的應用；