[發明專利]采用功能化磁珠進行生物正交化學的大分子一步捕獲方法及應用有效
| 申請號: | 202110376388.5 | 申請日: | 2021-04-06 |
| 公開(公告)號: | CN113092784B | 公開(公告)日: | 2023-09-08 |
| 發明(設計)人: | 李楠;王蕾;王維杰;趙文娟 | 申請(專利權)人: | 中國科學院深圳先進技術研究院 |
| 主分類號: | G01N33/68 | 分類號: | G01N33/68;C12N15/10 |
| 代理公司: | 北京華仁聯合知識產權代理有限公司 11588 | 代理人: | 周明新 |
| 地址: | 518051 廣東省深圳市*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 采用 功能 化磁珠 進行 生物 正交 化學 大分子 一步 捕獲 方法 應用 | ||
1.一種生物正交化學的大分子一步捕獲方法,其特征在于,包括:
第一步,配置300-600mmol/L硫酸銅水溶液、0.5mol/L-1.5mol/L抗壞血酸鈉水溶液、50mmol/L-150mmol/L(三(3-羥丙基三氮基甲基)胺)水溶液、0.5%-1.5%十二烷基硫酸鈉水溶液、30-60mmol/L4-羥乙基哌嗪乙磺酸水溶液、6mol/L-10mol/L尿素水溶液、20%-40%乙腈水溶液;
第二步,取磁珠懸液,使用蛋白或核酸緩沖液置換,重懸于蛋白緩沖液中;
第三步,按順序依次加入硫酸銅水溶液、抗壞血酸鈉水溶液、(三(3-羥丙基三氮基甲基)胺)水溶液、待捕獲的蛋白樣品、第二步制備的磁珠懸液和超純水,體積比為0.1-0.3∶1∶0.3-0.5∶1-1.5∶15-25∶20-25;
第四步,配置好反應混合液后,放在恒溫混勻儀上,孵育;溫度為25℃,轉速1200rpm-2000rpm,孵育0.5-1.5小時;
第五步,磁性分離1~3min,去除上清液;
第六步,還原烷基化;向樣品中加入還原烷基化試劑,包括:500mM三(2-羧乙基)膦,1M氯乙酰胺,10%SDS,50mM?4-羥乙基哌嗪乙磺酸,在37℃孵育30min,隨后磁性分離去除上清液;
第七步,洗滌磁珠;依次采用十二烷基硫酸鈉水溶液洗滌3-5次,尿素溶液洗滌3-5次,乙腈洗滌3-5次,4-羥乙基哌嗪乙磺酸水溶液洗滌3-5次;
第八步,磁珠上的蛋白經胰蛋白酶消化,用于LC-MS分析;
生物大分子為進行了炔基化或疊氮化的蛋白質或核酸;
所述磁珠為炔基化磁珠或疊氮化磁珠;
所述炔基化磁珠采用NH2-PEG4-Alkyne與羧基磁珠偶聯合成;制備方法包括:
第一步,羧基磁珠懸液置于離心管中,放在磁力架上等待1-3min,進行磁性分離,用移液器吸走并丟棄上清液;
第二步,在分離產物中加入有機溶劑,每1ml第一步使用的羧基磁珠懸液使用1ml有機溶劑,使用移液器緩慢吹打8-12次,以重懸磁珠,再次磁性分離1-3min,去除上清液,重復洗滌3-5次分離產物,重懸磁珠在有機溶劑中,獲得磁珠懸液;所述有機溶劑為DMF;
第三步,配置第一溶液,第一溶液為N-(3-二甲基氨基丙基)-N′-乙基碳二亞胺鹽酸鹽,濃度為5-15mg/mL;
第四步,配置第二溶液,第二溶液為NH3-PEG4-Alkyne,濃度為150mg/mL-250mg/mL;
第五步,將第三步獲得的第一溶液加入第二步獲得的磁珠懸液中,添加量為1ml磁珠懸液對應5ml第一溶液;
第六步,將第二溶液加入第五步獲得的磁珠懸液中,添加量為1ml磁珠懸液對應10μl第二溶液;
第七步,將第六步獲得的混合液置于37℃搖床中,搖晃孵育1-3小時;
第八步,磁性分離1-3min,去除上清液;
第九步,加入乙醇溶液,進行吹打重懸,磁性分離1-3min,去除上清液,對分離產物重復洗滌4-6次,最后重懸磁珠在乙醇水溶液中;所述乙醇溶液濃度10%-30%;
第十步,該磁珠懸液保存于4℃,避免凍結;
所述疊氮化磁珠采用疊氮基丙胺與羧基磁珠偶聯合成,制備方法包括:
第一步,羧基磁珠懸液置于離心管中,放在磁力架上等待1-3min,進行磁性分離,用移液器吸走并丟棄上清液;
第二步,在分離產物中加入有機溶劑,每1ml第一步使用的羧基磁珠懸液使用1ml有機溶劑,使用移液器緩慢吹打8-12次,以重懸磁珠,再次磁性分離1-3min,去除上清液,重復洗滌3-5次分離產物,重懸磁珠在有機溶劑中,獲得磁珠懸液;所述有機溶劑為DMF;
第三步,配置第一溶液,第一溶液為N-(3-二甲基氨基丙基)-N′-乙基碳二亞胺鹽酸鹽,濃度為5-15mg/mL;
第四步,配置第二溶液,第二溶液為疊氮基丙胺,濃度為150mg/mL-250mg/mL;
第五步,將第三步獲得的第一溶液加入第二步獲得的磁珠懸液中,添加量為1ml磁珠懸液對應5ml第一溶液;
第六步,將第二溶液加入第五步獲得的磁珠懸液中,添加量為1ml磁珠懸液對應10μl第二溶液;
第七步,將第六步獲得的混合液置于37℃搖床中,搖晃孵育1-3小時;
第八步,磁性分離1-3min,去除上清液;
第九步,加入乙醇溶液,進行吹打重懸,磁性分離1-3min,去除上清液,對分離產物重復洗滌4-6次,最后重懸磁珠在乙醇水溶液中;所述乙醇溶液濃度10%-30%;
第十步,該磁珠懸液保存于4℃,避免凍結。
2.如權利要求1所述生物正交化學的大分子一步捕獲方法,其特征在于:點擊化學反應為疊氮炔環加成反應。
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