[發明專利]PRDM9轉座子融合作為先天性巨結腸疾病標志物的應用

有效

• 申請號: 202110329812.0
• 申請日: 2021-03-26
• 公開（公告）號: CN112708673B
• 公開（公告）日: 2021-06-25
• 發明（設計）人: 朱云;張彥;夏慧敏
• 申請（專利權）人: 廣州市婦女兒童醫療中心
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12N15/11
• 代理公司: 廣州華進聯合專利商標代理有限公司 44224
• 代理人: 杜寒宇

本發明涉及生物醫學領域，具體而言，涉及一種PRDM9轉座子融合作為先天性巨結腸疾病標志物的應用。所述PRDM9轉座子融合的融合位點選自位于chr5:23299411的PRDM9?type I；位于chr5:23262356的PRDM9?type II?1；以及位于chr5:23245181的PRDM9?type II?2。相對于傳統診斷方法（鋇灌腸等），本方法具有操作簡單快速、無介入、通量高、成本低等眾多綜合優勢。

技術領域

本發明涉及生物醫學領域，具體而言，涉及一種PRDM9轉座子融合作為先天性巨結腸疾病標志物的應用。

背景技術

先天性巨結腸（Hirschsprung disease，HSCR）是一種兒童腸神經發育異常的出生缺陷疾病，病理機制為腸神經嵴細胞遷移和分化成腸神經元發生障礙，導致腸神經缺乏而發生持續性痙攣，是小兒常見的先天性腸道疾病之一。先天性巨結腸的早期表現為嘔吐、腹脹、腹瀉等，臨床上會造成新生兒死亡或手術后反復腸炎、難治性便秘等并發癥，嚴重影響患兒的生長發育和生活質量。

先天性巨結腸的及時診治可以減少先天性巨結腸腸炎發生的危險，獲得良好的預后。該疾病確診需要術后病變組織的病理切片。術前診斷方法主要為鋇劑灌腸，直腸活檢、直腸測壓，以判斷是否要實施“巨結腸根治術”。目前，鋇灌腸為最重要的診斷方法，原理為先天性巨結腸患兒的腸道存在無神經節段的狹窄、近端的擴張，鋇灌腸后可見擴張和狹窄段而診斷為巨結腸，但該方法只能診斷出有典型腸道形態改變的患兒，靈敏度需要提高，診斷的準確度80%左右。直腸活檢是直接取直腸組織，檢測是否有神經節細胞的缺失，準確率高，但取樣部位對結果有影響，但該方法為介入有創型，且價格非常高，一般情況下該方法應用于鋇灌腸不明顯，或不適用的患兒，比如當患兒有壞死性小腸結腸炎（NEC）這種可能的時候，鋇灌腸會導致腸穿孔，這種時候不適合用鋇灌腸去診斷，才考慮用直腸活檢。直腸測壓是通過檢測肛門內括約肌的松弛缺乏判定腸神經的支配異常，僅為輔助診斷方法，假陽性和假陰性都較多，不能用于單獨檢測。

有鑒于此，特提出本發明。

發明內容

為克服上述現有技術的缺點，本發明的目的在于提供一種先天性巨結腸診斷標記物及其應用，為先天性巨結腸的診斷提供了一種新的準確、靈敏的檢測途徑。

為了達到上述目的，本發明采用以下技術方案予以實現：

本發明的第一方面涉及PRDM9轉座子融合的定量檢測劑在制備先天性巨結腸診斷試劑或試劑盒中的應用；

所述PRDM9轉座子融合的融合位點選自：

位于chr5: 23299411的PRDM9-type I；

位于chr5:23262356的PRDM9-type II-1；以及

位于chr5: 23245181的PRDM9-type II-2。

可選的，如上所述的應用，所述定量檢測劑用于執行以下任一種方法：

聚合酶鏈反應、變性梯度凝膠電泳、核酸分型芯片檢測、變性高效液相色譜法、原位雜交、生物質譜法以及HRM法。

可選的，如上所述的應用，所述定量檢測劑為引物。

可選的，如上所述的應用，所述引物包括a~c中的至少一種：

a. 用于檢測PRDM9-type I的SEQ ID NO：1~2；

b. 用于檢測PRDM9-type II-1的SEQ ID NO：3~4；以及

c. 用于檢測PRDM9-type II-2的SEQ ID NO：5~6。