[發明專利]一種金櫻子三萜類化合物抗阿爾茨海默癥的方法在審
| 申請號: | 202110311030.4 | 申請日: | 2021-03-24 |
| 公開(公告)號: | CN113178226A | 公開(公告)日: | 2021-07-27 |
| 發明(設計)人: | 高品一;張碩碩;司星星;童娟娟;李新新;劉學貴;李丹琦 | 申請(專利權)人: | 沈陽化工大學 |
| 主分類號: | G16B15/30 | 分類號: | G16B15/30;G16C20/50;G16C10/00;G16C20/90 |
| 代理公司: | 沈陽技聯專利代理有限公司 21205 | 代理人: | 張志剛 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 金櫻子 三萜類 化合物 抗阿爾茨海默癥 方法 | ||
一種金櫻子三萜類化合物抗阿爾茨海默癥的方法,涉及一種生物化合物抗阿爾茨海默癥的方法,通過在線數據庫或網站分析獲得金櫻子藥理靶點及阿爾茨海默癥病原靶點,隨后利用軟件將所收集到的化合物由2D轉化為對應的3D結構;進行分子對接,篩選對接結果良好的化合物并保存;得到藥物‐疾病交集靶基因靶點并構建相關蛋白互作網絡篩選核心靶點;利用R語言相關包對核心靶點進行基因本體GO生物過程和KEGG通路富集分析;構建藥物‐靶點‐疾病通路圖進行治療機制的深入解析,通過體外活性驗證進一步確認網絡藥理學的真實性。本發明旨在為研究阿爾茨海默癥提供了新思路,同時為金櫻子三萜類化合物用于阿爾茲海默癥的臨床應用提供了前期研究基礎。
技術領域
本發明涉及一種生物醫藥化合物抗阿爾茨海默癥的方法,特別是涉及一種金櫻子三萜類化合物抗阿爾茨海默癥的方法,具體為一種基于網絡藥理學分析金櫻子中三萜類化合物抗阿爾茨海默癥作用機制的方法。
背景技術
阿爾茨海默病(AD),是以進行性認知功能障礙和記憶損害為特征的原發性中樞神經系統退行性疾病,主要發生于老年前期和老年期,嚴重影響老年人的生活質量與獨立性。AD的病理學特征主要為腦內有大量的老年斑(SP)神經元纖維纏結(NFTs)及特定腦區選擇性神經元和突觸丟失。目前,國內外尚無根治AD的藥物,中醫藥通過辨證論治與運用復方,從不同靶點、不同途徑。不同環節進行整體調節,在治療中起到越來越重要的作用。眾多針對單一靶點的抗AD藥物在I期臨床試驗中遭遇失敗,表明藥物研究的思路應向多成分、多靶點、多通路的方向轉變。天然產物多靶點的藥理.學活性特點,使其較西藥而言,具有得天獨厚的優勢。
金櫻子(Rosa laevigata Michx.)是一種經常使用的中草藥材。
具有抗氧化、調節免疫、抗菌、抗炎、降糖降脂等相關的功效。金櫻子酒還能產生一種活性物質,而這些物質是可以幫助我們消除人體自由基,能夠減少老年癡呆癥的發病率,有延緩衰老的作用。
網絡藥理學,突破了傳統“單藥物,單靶點”藥物研發模式的瓶頸,并提供了一種基于“多藥物,多靶點”相互作用關系的藥物研發新模式和新思路,這與中藥的多成分、多靶點、多途徑等特點正好吻合。
因此,借鑒網絡藥理學的理念和方法進行中藥研發,有可能為中藥藥效物質基礎研究和相應靶點發現等帶來前所未有的機遇。
發明內容
本發明的目的在于提供一種金櫻子三萜類化合物抗阿爾茨海默癥的方法,該方法基于網絡藥理學分析金櫻子中三萜類化合物抗阿爾茨海默癥作用機制,通過結合多個網絡藥理學數據庫,進行大數據分析,在阿爾茲海默癥背景下對可能具有潛在治療功能的金櫻子三萜類化合物靶點進行全面篩查,并預測了金櫻子三萜類化合物在阿爾茨海默癥發生發展中具有的調控潛力。
本發明的目的是通過以下技術方案實現的:
一種金櫻子三萜類化合物抗阿爾茨海默癥的方法,所述方法包括以下步驟::
S1、金櫻子中三萜類化合物庫的建立
運用在線數據庫(TCMSP和知網)篩選金櫻子中分離得到的三萜類化合物名稱和結構,利用畫圖軟件畫出所有化合物的2D結構,同時將篩選出的所有金櫻子中分離出的三萜類化合物結構轉化為對應的3D結構;
S2、阿爾茨海默癥蛋白的準備
在Drug bank、uniport、RCSB PDB、OMIM數據庫中,以“阿爾茨海默癥”作為關鍵詞檢索查找,確定篩選條件,對蛋白進一步篩選,最后將滿足條件的蛋白下載保存;
S3、分子對接
依次將S2中得到的阿爾茲海默癥蛋白與S1中得到的所有小分子化合物進行對接,打分;將對接活性高的化合物予以保存;
S4、構建成分靶點-疾病靶點網絡及篩選核心靶點
將運用STRING數據庫分析S3中選中的化合物,得到靶點蛋白網絡關系圖(PPI網絡);用軟件分析網絡節點的拓撲結構特征參數,建立金櫻子三萜類化合物-阿爾茨海默癥核心靶點圖,篩選核心靶點并進行后續篩選分析;
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