[發明專利]一種金櫻子三萜類化合物抗阿爾茨海默癥的方法在審
| 申請號: | 202110311030.4 | 申請日: | 2021-03-24 |
| 公開(公告)號: | CN113178226A | 公開(公告)日: | 2021-07-27 |
| 發明(設計)人: | 高品一;張碩碩;司星星;童娟娟;李新新;劉學貴;李丹琦 | 申請(專利權)人: | 沈陽化工大學 |
| 主分類號: | G16B15/30 | 分類號: | G16B15/30;G16C20/50;G16C10/00;G16C20/90 |
| 代理公司: | 沈陽技聯專利代理有限公司 21205 | 代理人: | 張志剛 |
| 地址: | 110142 遼寧*** | 國省代碼: | 遼寧;21 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 金櫻子 三萜類 化合物 抗阿爾茨海默癥 方法 | ||
1.一種金櫻子三萜類化合物抗阿爾茨海默癥的方法,其特征在于,所述方法包括以下步驟::
S1、金櫻子中三萜類化合物庫的建立
運用在線數據庫(TCMSP和知網)篩選金櫻子中分離得到的三萜類化合物名稱和結構,利用畫圖軟件畫出所有化合物的2D結構,同時將篩選出的所有金櫻子中分離出的三萜類化合物結構轉化為對應的3D結構;
S2、阿爾茨海默癥蛋白的準備
在Drug bank、uniport、RCSB PDB、OMIM數據庫中,以“阿爾茨海默癥”作為關鍵詞檢索查找,確定篩選條件,對蛋白進一步篩選,最后將滿足條件的蛋白下載保存;
S3、分子對接
依次將S2中得到的阿爾茲海默癥蛋白與S1中得到的所有小分子化合物進行對接,打分;將對接活性高的化合物予以保存;
S4、構建成分靶點-疾病靶點網絡及篩選核心靶點
將運用STRING數據庫分析S3中選中的化合物,得到靶點蛋白網絡關系圖(PPI網絡);用軟件分析網絡節點的拓撲結構特征參數,建立金櫻子三萜類化合物-阿爾茨海默癥核心靶點圖,篩選核心靶點并進行后續篩選分析;
S5、對核心靶點富集分析以探討藥物成分作用機制
利用R語言相關包對核心靶點進行GO生物過程和KEGG通路注釋富集分析,輸出相應圖表,對照解析金櫻子三萜類化合物-阿爾茨海默癥的作用機制;
S6、“成分-靶點-疾病通路”網絡構建
根據S5結果構建“藥物-靶點-疾病通路”可視化圖形;具體應用R語言中“pathview”包將KEGG富集通路的相關靶點映射到通路圖,便于進行后續分析;
S7、進行體外活性驗證
將網絡藥理學得到的金櫻子三萜類化合物抗阿爾茨海默癥的核心靶點以及相關化合物進行直接靶標實驗,神經細胞保護活性驗證,分子動力學模擬。
2.根據權利要求1所述的一種金櫻子三萜類化合物抗阿爾茨海默癥的方法,其特征在于,所述S3中分子對接篩選打分為score5。
3.根據權利要求1所述的一種金櫻子三萜類化合物抗阿爾茨海默癥的方法,其特征在于,所述S2中篩選條件為選擇分辨率在3.00 ?以下,阿爾茲海默癥,人源,含有配體。
4.根據權利要求3所述的一種金櫻子三萜類化合物抗阿爾茨海默癥的方法,其特征在于,所述配體不能是離子。
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