[發明專利]一種篩選特異BCR/TCR的方法及其系統有效
| 申請號： | 202110273631.0 | 申請日： | 2021-03-15 |
| 公開（公告）號： | CN113122617B | 公開（公告）日： | 2023-07-14 |
| 發明（設計）人： | 張志新;卓越;楊鑫 | 申請（專利權）人： | 成都益安博生物技術有限公司 |
| 主分類號： | C12Q1/686 | 分類號： | C12Q1/686;C12Q1/6869;G16B20/30;G16B30/10;G16B40/10 |
| 代理公司： | 成都極緯知識產權代理有限公司 51320 | 代理人： | 梁鑫 |
| 地址： | 610000 四川省成都*** | 國省代碼： | 四川;51 |
| 權利要求書： | 查看更多 | 說明書： | 查看更多 |
| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 一種 篩選 特異 bcr tcr 方法 及其 系統 | ||
1.一種篩選特異性BCR/TCR的方法，其特征在于，包括以下步驟：
(1)分別提取N個免疫后的待測樣本淋巴細胞中的mRNA；
(2)逆轉錄處理步驟(1)所得mRNA后，再對其BCR/TCR可變區基因進行多重PCR擴增，然后進行高通量測序，并確定BCR/TCR可變區的核酸及氨基酸序列；
(3)將測序得到的序列與未經抗原刺激樣本的淋巴細胞BCR/TCR測序結果對比，獲得相應的特異性免疫序列；
其中，包括所述將所有免疫后樣本的BCR/TCR序列歸總去重,再去除所有與未經抗原刺激樣本的BCR/TCR測序結果序列集中所包含序列相重復的序列，建立特征性BCR/TCR序列集的步驟；
所述步驟(3)中特異性免疫序列的具體獲得方式為：
(1)從特征性BCR/TCR序列集中去除只在N×10％個免疫后樣本中出現的序列；
(2)對特征性BCR/TCR序列集中所含有的共M種具有唯一性的BCR/TCR抗原決定簇3CDR3序列分別在N個免疫后樣本測序結果中出現的次數進行統計，計為X1,1、X1,2、X1,3······X1,M,X2,1、X2,2、X2,3······X2,M,······,XN,1、XN,2、XN,3······XN,M；
(3)將特征性序列集中相同BCR/TCR?CDR3序列在N個免疫后樣本測序結果中出現次數求和，第j種CDR3序列出現次數之和為：
(4)將特征性序列集中所含有的共M種BCR/TCR?CDR3序列按Yj值從高至低排序，排序前100個或前M×10％個序列即為與抗原相對應的特異性BCR/TCR?CDR3序列。
2.根據權利要求1所述的篩選特異性BCR/TCR的方法，其特征在于，所述待測樣本為包含淋巴細胞的外周血、脾臟組織、腫瘤組織或體外培養的淋巴細胞。
3.根據權利要求1或2任一項所述的篩選特異性BCR/TCR的方法，其特征在于,所述待測樣本為人源樣本或動物源樣本。
4.一種用于篩選特異性BCR/TCR的系統，其特征在于,所述系統采用權利要求1-3任一項所述的方法對特異性BCR/TCR進行篩選。
該專利技術資料僅供研究查看技術是否侵權等信息，商用須獲得專利權人授權。該專利全部權利屬于成都益安博生物技術有限公司，未經成都益安博生物技術有限公司許可，擅自商用是侵權行為。如果您想購買此專利、獲得商業授權和技術合作，請聯系【客服】
本文鏈接：http://www.szxzyx.cn/pat/books/202110273631.0/1.html，轉載請聲明來源鉆瓜專利網。
- 上一篇：一種鞋類加工用點膠機
- 下一篇：一種通過氣缸控制推銷夾緊刀具的自動換刀裝置
