[發明專利]捕獲測序探針及其用途有效
| 申請號： | 202110248180.5 | 申請日： | 2021-03-07 |
| 公開（公告）號： | CN113278611B | 公開（公告）日： | 2022-11-25 |
| 發明（設計）人： | 王征;王琳;王國斌;徐魯明;路小歡;雷世俊;劉揚;王星月 | 申請（專利權）人： | 華中科技大學同濟醫學院附屬協和醫院 |
| 主分類號： | C12N15/11 | 分類號： | C12N15/11;C12Q1/6869;C12Q1/6886 |
| 代理公司： | 武漢信合紅谷知識產權代理事務所(特殊普通合伙) 42264 | 代理人： | 蔣明 |
| 地址： | 430022 湖北*** | 國省代碼： | 湖北;42 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 捕獲 探針 及其 用途 | ||
1.捕獲探針的組合物在制備篩查結直腸癌產品中的應用，其中，所述捕獲探針的組合物由序列為SEQ ID NO：1～2909的2909個探針組成。
2.根據權利要求1所述的應用，其特征在于：捕獲探針為結直腸癌基因測序的捕獲測序探針，其Tm值為62~ 76℃。
3.根據權利要求1所述的應用，其特征在于：所述捕獲探針為結直腸癌個體化用藥相關基因突變測序的捕獲測序探針，其工作濃度為10ng/μL~ 90ng/μL；
捕獲測序探針能覆蓋目標基因組80~300Kb的區域。
4.根據權利要求3所述的應用，其特征在于：所述捕獲測序探針為結直腸癌個體化用藥相關基因突變測序的捕獲測序探針，其工作濃度為25ng/μL；
捕獲測序探針能覆蓋目標基因組100~180Kb區域。
5.基因位點檢測探針在制備直腸癌篩查或預后分析產品中的應用，所述基因位點包含下述
AKT1： Chromosome14,NC_000014.9(104769349..104795748)；
ALK： Chromosome 2, NC_000002.12 (29190992..29921589)；
BAP1： Chromosome 3, NC_000003.12 (52401004..52410030)；
BRAF： Chromosome7,NC_000007.14(140713328..140924929)；
BRCA1： Chromosome17, NC_000017.11 (43044295..43125364)；
CSF1R： Chromosome5,NC_000005.10(150053295..150113365)；
EGFR： Chromosome 7, NC_000007.14 (55019017..55211628)；
ERBB2： Chromosome 17, NC_000017.11 (39688094..39728660)；
ERBB4： Chromosome2,NC_000002.12(211375717..212538802)；
HRAS： Chromosome 11, NC_000011.10 (532242..535576)；
KIT： Chromosome 5, NC_000071.7 (75735647..75817382)；
KRAS： Chromosome 12,NC_000012.12 (25205246..25250929)；
MTOR： Chromosome 1, NC_000001.11 (11106535..11273497)；
NRAS： Chromosome1,NC_000001.11(114704469..114716771)；
PDGDRB： Chromosome5,NC_000005.10(150113839..150155845)；
PDGFRA： Chromosome 4, NC_000004.12 (54229127..54298245)；
PIK3CA： Chromosome 3, NC_000003.12 (179148114..179240093)；
PTEN： Chromosome 10, NC_000010.11 (87863625..87971930)；
SMAD4： Chromosome 18, NC_000018.10 (51030213..51085042)；
TP53： Chromosome 17, NC_000017.11 (7668421..7687490)；
NRAS： Chromosome1,NC_000001.11(114704469..114716771)；
APC： Chromosome 5, NC_000005.10 (112707498..112846239)；
NTRK1： Chromosome 1, NC_000001.11 (156815750..156881850)；
NTRK3： Chromosome15, NC_000015.10 (87859749..88256796)；
和HER2： Chromosome 17, NC_000017.11 (39688094..39728660)；
其中，基因位點檢測探針為SEQ ID NO：1～2909。
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