[發(fā)明專利]一種五香粉中植物源性成分鑒別方法在審
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 202110226411.2 | 申請(qǐng)日: | 2021-03-01 |
| 公開(公告)號(hào): | CN112813149A | 公開(公告)日: | 2021-05-18 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 邢冉冉;陳穎;周夢(mèng)月;張九凱;于寧 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 中國(guó)檢驗(yàn)檢疫科學(xué)研究院 |
| 主分類號(hào): | C12Q1/686 | 分類號(hào): | C12Q1/686 |
| 代理公司: | 北京天盾知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11421 | 代理人: | 宋凌林 |
| 地址: | 100176 *** | 國(guó)省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 香粉 植物 成分 鑒別方法 | ||
1.一種鑒定五香粉中植物源性物種成分的檢測(cè)方法,其特征在于,包括以下步驟:
(a)提供一待測(cè)樣品;
(b)從所述樣品中提取基因組DNA;
(c)用帶有堿基標(biāo)簽的ITS2和psbA-trnH基因通用引物對(duì)(b)中所述基因組DNA進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增,得到PCR擴(kuò)增產(chǎn)物;
(d)對(duì)所述PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行純化、定量檢測(cè);
(e)用上一步驟中檢測(cè)合格的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物構(gòu)建測(cè)序文庫(kù)并進(jìn)行質(zhì)量檢驗(yàn);
(f)對(duì)上一步測(cè)序文庫(kù)進(jìn)行高通量測(cè)序,獲得ITS2和psbA-trnH基因片段序列;
(g)將上一步所得ITS2和psbA-trnH基因片段序列與本地ITS2和psbA-trnH基因序列數(shù)據(jù)庫(kù)和/或公共數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì),根據(jù)測(cè)序序列與數(shù)據(jù)庫(kù)中參考序列的同源性確定五香粉樣品中的物種成分。
其中,在步驟(g)中,若待測(cè)五香粉擴(kuò)增所得ITS2和/或psbA-trnH基因片段某條測(cè)序序列與本地ITS2和psbA-trnH基因序列數(shù)據(jù)庫(kù)和/或公共數(shù)據(jù)庫(kù)中某一植物的某條序列一致性大于等于97%,則所述待測(cè)五香粉中含有該條序列在數(shù)據(jù)庫(kù)中所對(duì)應(yīng)的植物物種;若待測(cè)五香粉擴(kuò)增所得ITS2和/或psbA-trnH基因片段某條測(cè)序序列與本地ITS2和psbA-trnH基因序列數(shù)據(jù)庫(kù)和/或公共數(shù)據(jù)庫(kù)中某一植物的某條序列一致性小于97%,則所述待測(cè)五香粉中不含有或候選不含有該條序列在數(shù)據(jù)庫(kù)中所對(duì)應(yīng)的植物物種。
2.如權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述五香粉樣品為一類將多種香辛料按一定比例混合而成的復(fù)合粉狀調(diào)味料。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,在步驟(c)中所述多重PCR反應(yīng)分1個(gè)或多個(gè)反應(yīng)體系完成。
4.如權(quán)力要求1所述的方法,其特征在于,所述方法設(shè)置陽(yáng)性對(duì)照組。
5.如權(quán)力要求1所述的方法,其特征在于,在步驟(g)中生物信息學(xué)分析中分類學(xué)單元聚類(OTU)的閾值為97%;只有在至少2個(gè)重復(fù)中均檢測(cè)到該物種時(shí),才認(rèn)為該物種存在于樣品中;對(duì)于標(biāo)簽中未標(biāo)注的物種,當(dāng)物種相對(duì)豐度高于0.2%時(shí),才認(rèn)為存在于樣品中。
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