[發明專利]一種與綿羊剩余采食量相關的分子標記及其應用

在審

• 申請號: 202110206714.8
• 申請日: 2021-02-24
• 公開（公告）號: CN112921101A
• 公開（公告）日: 2021-06-08
• 發明（設計）人: 汪曉娟;張德印;王維民;李發弟;張小雪;李沖;袁律峰;趙利明;張煜坤
• 申請（專利權）人: 甘肅農業大學
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 西安通大專利代理有限責任公司 61200
• 代理人: 范巍

本發明公開了一種與綿羊剩余采食量相關的分子標記及其應用。本發明通過對綿羊ME1基因進行PCR擴增和序列分析，發現在擴增片段的第453位存在一個C/T多態性位點，進一步使用KASPar引物對檢測對應多態性位點和建立最小二乘模型，并通過對507只湖羊的基因型與剩余采食量進行關聯分析，確定了擴增的ME1基因片段中存在與綿羊剩余采食量相關的分子標記。在育種實踐中，可選留TT純合型的綿羊進入核心群，通過降低剩余采食量，有助于減少飼料消耗量和養殖成本。

技術領域

本發明涉及肉羊新品種的分子標記輔助選擇，具體涉及ME1基因的單核苷酸多態性(SNP)位點的分型檢測及作為影響綿羊剩余采食量的分子標記的應用。

背景技術

在肉羊生產實踐中，飼草料成本約占總成本的65％-70％，因此提高飼料效率對經濟和環保具有重要的意義。剩余采食量(residual feed intake，RFI)，是指畜禽實際采食量與預期的根據生產性能(體增重、產奶量和產蛋數等)需要和維持體重需要的標準而計算得出的采食量之差(Koch,R.M.,et al.,Efficiency of feed use in beef cattle.JAnim Sci.1963,22(2):486-494)。RFI反映的是畜禽本身由遺傳背景決定的代謝差異而導致的飼料利用效率的差異，其與畜禽的體型大小及生產性能，甚至是屠宰性能和肉品質等性狀相互獨立，計算過程中既考慮了畜禽的體增重，也校正了其代謝體重。在對RFI進行遺傳改良的同時，不會對生長及生產性狀造成不良影響或影響很小，這也是FCR不可比擬的優勢之一。因此，RFI是一項準確評價飼料利用效率的育種指標。尋找基因的變異位點，通過與性狀間的關聯分析發現基因與性狀間的關系是研究基因功能的一個重要手段，也是進行標記輔助選擇的基礎。

蘋果酸酶1(Malic enzyme 1,ME1)屬于蘋果酸酶(Malic enzyme)家族中的一員，編碼基因為ME1，該基因在機體內源性脂肪酸合成中發揮重要的作用，它的表達與脂肪酸合成效率密切相關。Guan等人研究發現ME1基因可能作為主效基因或與其主效基因連鎖來影響雞的生長性狀(Hong-Ying,GUAN,et al.Correlation Analysis Between Single-Nucleotide Polymorphism of Malate Dehydrogenase Gene 5’-Flanking Region andGrowth and Body Composition Traits in Chicken.Acta Genetica Sinica,2006.)。此外，ME1還參與體內骨骼肌和心肌的能量代謝(Gibala M J,Young M E,TaegtmeyerH.Anaplerosis of the citric acid cycle:role in energy metabolism of heart andskeletal muscle.[J].Acta Physiologica Scandinavica,2010,168(4):657-665.)，而骨骼肌是機體最大的代謝器官。目前有關ME1基因的研究主要集中在脂肪沉積方面，剩余采食量屬于中等遺傳力，受基礎代謝、養分的消化代謝、能量的輸出、機體活動、體溫調節等因素的影響。其他文獻報道還包括中國專利CN104862411A，其公開了與辣椒抗根結線蟲基因Me1緊密連鎖的分子標記、及其SSR引物和應用。

KASP是競爭性等位基因特異性PCR(Kompetitive Allele Specific PCR)的縮寫，KASP檢測技術不需要針對每個SNP位點合成特異的熒光探針，而是基于ARM PCR原理，讓所有的位點檢測最終都使用通用熒光引物擴增。

目前，尚未見到通過對ME1基因進行測序和分析，并探討其不同基因型與綿羊剩余采食量的關聯性的報道。

發明內容