[發明專利]一種真姬菇HM13菌種的SSR標記指紋圖譜及其構建方法與應用有效
| 申請號: | 202110171379.2 | 申請日: | 2021-02-04 |
| 公開(公告)號: | CN112795688B | 公開(公告)日: | 2023-02-28 |
| 發明(設計)人: | 李燕;鮑大鵬;王瑩;吳瑩瑩;萬佳寧;尚俊軍 | 申請(專利權)人: | 上海市農業科學院 |
| 主分類號: | C12Q1/6895 | 分類號: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12Q1/04;C12N15/11 |
| 代理公司: | 南京燦爛知識產權代理有限公司 32356 | 代理人: | 王江南 |
| 地址: | 201106 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 真姬菇 hm13 菌種 ssr 標記 指紋 圖譜 及其 構建 方法 應用 | ||
1.一種真姬菇HM13菌種的SSR標記的指紋圖譜鑒定方法,其特征在于:所述指紋圖譜由6個SSR標記位點組成,其對應的6對引物的具體序列如下:
HMSSR11正向引物:GGAGTTTGAGTTGAGGCAGC;
反向引物:ATGAACCAGACCAAAGACCG;
HMSSR18正向引物:GAGGATTGAAGGGACTGTCG;
反向引物:CCTCATCCTCCGACTCTACG;
HMSSR26正向引物:GTGATTGGGTTCGTGTCGTC;
反向引物:ACCTCGAGCTCAACTTCTGC;
HMSSR32正向引物:AACCTCCAGTCACAACCTGC;
反向引物:CCTTGCTTCTTGTCGGATGT;
HMSSR36正向引物:TCTTCTTGTAGAGCGCCTCG;
反向引物:CTCTCGACGCGTGTTCCT;
HMSSR38正向引物:TCTTCTTGTTCGGCGGTATC;
反向引物:ATCCGGCACAGGTAAAGATG;
相應帶型編號組合為:6/(3+4)/(5+6)/6/(5+7)/4;
其中,引物HMSSR11對應的帶型編號為6,其對應的等位基因片段的條帶大小為286~286.99bp;
引物HMSSR18對應的帶型編號為3+4,其中編號3對應的等位基因片段的條帶大小為257~257.99bp,編號4對應的等位基因片段的條帶大小為262~262.99bp;
引物HMSSR26對應的帶型編號為5+6,其中編號5對應的等位基因片段的條帶大小為132~132.99bp,編號6對應的等位基因片段的條帶大小為135~135.99bp;
引物HMSSR32對應的帶型編號為6,其對應的等位基因片段的條帶大小為235~235.99bp;
引物HMSSR36對應的帶型編號為5+7,其中編號5對應的等位基因片段的條帶大小為162~162.99bp,編號7對應的等位基因片段的條帶大小為170~170.99bp;
引物HMSSR38對應的帶型編號為4,其對應的等位基因片段的條帶大小為177~177.99bp;
所述真姬菇HM13菌種的保藏編號為GDMCCNo:61412。
2.權利要求1所述的真姬菇HM13菌種的SSR標記的指紋圖譜的應用,其特征在于:所述真姬菇HM13菌種的SSR標記的指紋圖譜用于鑒定真姬菇HM13菌種的特異等位變異,和/或鑒定真姬菇HM13菌種的特異性。
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