[發明專利]一種殺鮭氣單胞菌LAMP-HNB快速檢測方法在審
| 申請號: | 202110078904.6 | 申請日: | 2021-01-23 |
| 公開(公告)號: | CN112779345A | 公開(公告)日: | 2021-05-11 |
| 發明(設計)人: | 周順;于明明;修云吉;黃晴;李影 | 申請(專利權)人: | 青島農業大學 |
| 主分類號: | C12Q1/689 | 分類號: | C12Q1/689;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/01 |
| 代理公司: | 鄭州歐凱專利代理事務所(普通合伙) 41166 | 代理人: | 王林華 |
| 地址: | 266000 山*** | 國省代碼: | 山東;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 殺鮭氣單胞菌 lamp hnb 快速 檢測 方法 | ||
1.一種殺鮭氣單胞菌LAMP-HNB快速檢測方法,所述方法包括以下步驟:
S1、引物的設計與合成:根據GenBank中已知殺鮭氣單胞菌毒力列陣蛋白基因(vapA)序列,通過引物設計軟件Primer Explore V4設計六條特異性引物;
S2、模板制備:從實驗室取出貯備的樣品菌株,將菌株接種于TSB培養基中,在28℃的溫度下過夜培養,培養完成后用OMEGA Tissue DNA kit試劑盒提取DNA;
S3、LAMP擴增體系:25μL體系為BstDNAPolymerase(8U/μL)、10×IsothermoBuffer(Mg2+free)、MgSO4(100mM)、dNTPMixture(10mM)、10×Primers(FIP/BIP分別為16μM、LoopF/LooB分別為8μM、F3/B3分別為2μM)、滅菌雙蒸水、羥基萘酚藍染料(HNB)、細菌模板1μL;
S4、LAMP擴增條件:在63℃溫度下反應60min,85℃溫度反應10min后終止反應,此反應條件的擴增產物顯色結果最明顯;
S5、LAMP結果檢測:
反應前加入顯色劑:LAMP擴增結束后,陽性呈藍色;陰性呈紫羅蘭色;
電泳驗證:將擴增產物在2%瓊脂糖凝膠電泳中電泳可顯現出條帶。
2.根據權利要求1所述的一種殺鮭氣單胞菌LAMP-HNB快速檢測方法,其特征在于:所述S2步驟中實驗室貯備的細菌由發病魚體內分離得到,所述菌株種類有大菱鲆弧菌、嗜水氣單胞菌、創傷弧菌、遲緩愛德華氏菌、副溶血弧菌、蠟樣芽孢桿菌、枯草芽孢桿菌、美人魚發光桿菌。
3.根據權利要求1所述的一種殺鮭氣單胞菌LAMP-HNB快速檢測方法,其特征在于:所述S2步驟中實驗室貯備樣品菌株的溫度為零下80℃。
4.根據權利要求1所述的一種殺鮭氣單胞菌LAMP-HNB快速檢測方法,其特征在于:所述S3步驟中對酶量、Mg2+濃度、dNTP濃度及引物量可做一定程度的優化,且可選取最佳用量。
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