[發明專利]一種與花生百仁重主效QTL位點連鎖的分子標記及其應用

有效

• 申請號: 202110053275.1
• 申請日: 2021-01-15
• 公開（公告）號: CN112626260B
• 公開（公告）日: 2022-06-17
• 發明（設計）人: 王志慧;廖伯壽;雷永;晏立英;陳玉寧;淮東欣;王欣;康彥平
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院油料作物研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 北京路浩知識產權代理有限公司 11002
• 代理人: 商秀玲

本發明涉及分子遺傳學和作物分子育種技術領域，尤其涉及一種與花生百仁重主效QTL位點連鎖的分子標記及其應用。所述分子標記包括分子標記Ah011476，和/或，分子標記Ah011478；所述分子標記Ah011476為花生B06染色體上第14206230位，多態性為G或T；所述分子標記Ah011478為花生B06染色體上第17650027位，多態性為C或A。本發明篩選得到和花生百仁重主效QTL位點連鎖的分子標記，使用這些分子標記可以有效地對花生的百仁重進行鑒定，并用于花生遺傳改良，獲得高百仁重的花生品種。

技術領域

本發明涉及分子遺傳學和作物分子育種技術領域，尤其涉及一種與花生百仁重主效QTL位點連鎖的分子標記及其應用。

背景技術

花生(Arachis hypogaea L.)是現有重要的油料作物和經濟作物之一，種植面積大，產量高，可用于榨油，是目前重要的食用油來源之一。花生同時也是重要的食品加工原料，食品消費占總產的35％以上。目前，提高單位面積產量是進一步增加花生原料供給的有效途徑之一。研究表明，花生百仁重對產量影響最大，是花生最重要的花生產量構成因子。因此，開展花生百仁重QTL定位研究，鑒定百仁重相關的QTL并開發成分子標記，對于揭示花生籽仁大小形成的機理、開展百仁重的分子標記輔助選擇育種和培育高產品種具有重要的意義。

分子標記輔助育種技術是現階段創造優異性狀材料和培育優良品種的重要手段和技術，其應用可以大大加速育種的進程和速度，具體通過在雜交和回交過程中使用性狀連鎖分子標記對雜交群體中的重組個體進行精確篩選，將篩選到攜帶優異等位基因的個體繼續用于后續雜交和回交過程，實現優異性狀遺傳位點的精準導入和轉育，從而快速實現作物品種的性狀改良。應用分子標記開展輔助育種的基礎是鑒定到與性狀緊密連鎖且高度相關的分子標記，分子標記在育種中的效率與標記與性狀的連鎖緊密程度、表型貢獻率密切相關，質量性狀和數量性狀主效QTL分子標記在輔助選擇育種中的效果較好。花生的百仁重屬于數量性狀，其遺傳機理非常復雜，受多基因控制且與環境存在互作，充分發掘花生百仁重相關的主效QTL位點緊密連鎖的分子標記，有助于聚合多個百仁重主效QTL位點，加快高產品種選育進程。目前，國內外學者對花生百仁重QTL定位有一些報道(Wang et al.,2019；Huang et al.,2015；Fonceka et al.,2012；Li et al.,2011；Ravi et al.,2011)，但這些研究鑒定的QTL通常由于標記密度過于稀疏，導致鑒定到的QTL區間較大，連鎖的分子標記的表型貢獻率通常較低，其鑒定的百仁重連鎖標記應用于分子育種的效果一般。

發明內容

為了解決現有技術的問題，本發明提供一種與花生百仁重主效QTL位點連鎖的分子標記及其應用。

第一方面，本發明提供一種與花生百仁重主效QTL位點連鎖的分子標記，所述分子標記包括分子標記Ah011476，和/或，分子標記Ah011478；

所述分子標記Ah011476為花生B06染色體上第14206230位，多態性為G或T；

所述分子標記Ah011478為花生B06染色體上第17650027位，多態性為C或A。

進一步地，所述分子標記Ah011476位于如SEQ ID NO.7所示核苷酸序列的第22位；SEQ ID NO.7所示序列為用Allele-specific-VIC-F和Common-primer-R擴增得到的序列，而Allele-specific-FAM-F和Common-primer-R的擴增得到的片段，分子標記Ah011476位于第19位。

所述分子標記Ah011478位于如SEQ ID NO.8所示核苷酸序列的第24位；SEQ IDNO.8所示序列為用Allele-specific-VIC-F和Common-primer-R擴增得到的序列，而Allele-specific-FAM-F和Common-primer-R的擴增得到的片段，分子標記Ah011476位于第21位。