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[發明專利]假陽性樣本的排除方法、裝置以及電子設備在審

專利信息
申請號: 202011643816.8 申請日: 2020-12-30
公開(公告)號: CN112669909A 公開(公告)日: 2021-04-16
發明(設計)人: 李冬;楊智;賀賢漢 申請(專利權)人: 杭州博日科技股份有限公司
主分類號: G16B45/00 分類號: G16B45/00;G16B40/30;G16B40/10
代理公司: 北京超凡宏宇專利代理事務所(特殊普通合伙) 11463 代理人: 張萌
地址: 310000 浙江省杭州市*** 國省代碼: 浙江;33
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 陽性 樣本 排除 方法 裝置 以及 電子設備
【說明書】:

本申請提供了一種假陽性樣本的排除方法、裝置以及電子設備,涉及數據檢測技術領域,包括:獲取未知樣本的擴增數據,通過聚類方法從未知樣本的擴增數據中確定明顯擴增樣本,計算明顯擴增樣本的多個循環信號的標準差、明顯擴增樣本的最大擴增高度以及最大擴增高度對應的Ct?max值,基于標準差、最大擴增高度以及Ct?max值,排除未知樣本中的假陽性樣本,緩解了目前排除假陽性樣本的精確度較低的技術問題。

技術領域

本申請涉及數據檢測技術領域,尤其是涉及一種假陽性樣本的排除方法、裝置以及電子設備。

背景技術

目前,診斷傳染病標準的核酸定量方法多采用熒光實時定量PCR,能夠量化樣品模板的初始值,常被用在基因分析表達、轉基因食物檢測和癌癥檢測中。

但是,目前實際的PCR擴增曲線是較為多樣的,即使是同一次擴增實驗,各孔位的擴增曲線也相差很大,而且,現有的方法都無法較為精確的消除不明顯擴增曲線樣本的分析結果差異,目前排除假陽性樣本的精確度較低,難以從總體上對所有擴增孔位進行考察。

發明內容

本發明的目的在于提供一種假陽性樣本的排除方法、裝置以及電子設備,以緩解目前排除假陽性樣本的精確度較低的技術問題。

第一方面,本申請實施例提供了一種假陽性樣本的排除方法,所述方法包括:

獲取未知樣本的擴增數據;

通過聚類方法從所述未知樣本的擴增數據中確定明顯擴增樣本;

計算所述明顯擴增樣本的多個循環信號的標準差、所述明顯擴增樣本的最大擴增高度以及所述最大擴增高度對應的Ct-max值;

基于所述標準差、所述最大擴增高度以及所述Ct-max值,排除所述未知樣本中的假陽性樣本。

結合第一方面,本發明實施例提供了第一方面的第一種可能的實施方式,其中,所述計算所述明顯擴增樣本的多個循環信號的標準差、所述明顯擴增樣本的最大擴增高度以及所述最大擴增高度對應的Ct-max值的步驟,包括:

計算所述明顯擴增樣本的多個循環信號的標準差;

根據多倍所述標準差的位置,得到所述明顯擴增樣本的Ct值,并基于所述Ct值查找所述明顯擴增樣本的最大擴增高度以及所述最大擴增高度對應的Ct-max值。

結合第一方面,本發明實施例提供了第一方面的第二種可能的實施方式,其中,所述基于所述標準差、所述最大擴增高度以及所述Ct-max值,排除所述未知樣本中的假陽性樣本的步驟,包括:

計算所述標準差的平均值;

根據所述平均值排除所述未知樣本中的假陽性樣本,并基于所述最大擴增高度以及所述Ct-max值排除所述未知樣本中的假陽性樣本。

結合第一方面,本發明實施例提供了第一方面的第三種可能的實施方式,其中,多倍所述標準差的位置中的倍數為10倍;

所述根據所述平均值排除所述未知樣本中的假陽性樣本的步驟,包括:

在除所述明顯擴增樣本以外的樣本的最大擴增高度小于10倍平均標準差時,將所述擴增數據中的擴增曲線置為0,以排除所述未知樣本中的假陽性樣本。

結合第一方面,本發明實施例提供了第一方面的第四種可能的實施方式,其中,所述基于所述最大擴增高度以及所述Ct-max值排除所述未知樣本中的假陽性的步驟,包括:

在除所述明顯擴增樣本以外的樣本的最大擴增高度小于所述明顯擴增樣本的最大擴增高度的1/5,且除所述明顯擴增樣本以外的樣本的Ct值小于所述Ct-max值時,將所述擴增數據中的擴增曲線置為0,以排除所述未知樣本中的假陽性樣本。

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