[發明專利]卡馬西平個體化用藥基因的指導方法及試劑盒

在審

• 申請號: 202011601027.8
• 申請日: 2020-12-29
• 公開（公告）號: CN112501283A
• 公開（公告）日: 2021-03-16
• 發明（設計）人: 陳濤;張靜;葉冠欽;林金飛
• 申請（專利權）人: 廣東南芯醫療科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 上海上谷知識產權代理有限公司 31342
• 代理人: 蔡繼清

本發明提供了卡馬西平個體化用藥基因的指導方法及試劑盒，具體的本發明考慮不同癲癇患者用藥療效的差異性，篩選出與卡馬西平個體化用藥相關基因的SNP位點的組合，利用核酸質譜儀對卡馬西平相關的遺傳學標識進行廣泛(高通量檢測位點、高通量檢測樣本)篩查和檢驗。通過本發明的方法檢出成功率高、技術重現性好、性價比高，可實現單個小樣本多基因的檢測，滿足小樣本最大化使用；本發明的方法具有高準確性、高靈敏性的技術優勢，檢測結果穩定，提高了檢測陽性率。

技術領域

本發明屬于生物技術領域，具體地說，本發明涉及一種用于卡馬西平個體化用藥基因的指導方法及試劑盒。

背景技術

單核苷酸多態性(single nucleotide polymorphism，SNPs)是一種遺傳標記，是指基因組水平上由于單核苷酸的變異，而引起的DNA序列的多態性。在人群中的發生頻率大于1％，包括單堿基的轉換、顛倒以及單堿基的插入或缺失等形式表現，是一種新的遺傳標志，可以為疾病的預測、診斷、治療以及新型藥物的研制提供可靠的有效的科學根據。

SNP發生在編碼區，能夠影響蛋白功能，從而影響人體健康或藥物代謝，主要表現在疾病易感性方面的個體差異、同一藥物治療療效的個體差異、同一藥物的不良反應的個體差異。藥物遺傳學或藥物基因組學方法對于解決藥物療效的個體差異非常重要，尤其是在精密醫學時代。

卡馬西平(Carbamazepine)，化學名為5H-二苯并[b,f]氮雜卓-5-甲酰胺，分子式為C₁₅H₁₂N₂O，是一種治療癲癇病和神經性疼痛的藥物。約10％的用藥者可發生過敏性皮疹，嚴重者可發展成致命的皮膚反應，可導致永久性殘疾甚至死亡。美國FDA已將該藥物基因組學信息列入卡馬西平的藥品說明書。同時有研究表明，患者的基因SNP位點突變將影響卡馬西平的療效，如SCN1A基因中的rs3812718SNP與中國漢族局灶性癲癇患者的CBZ單藥保留率顯著相關，rs2298771與CBZ單一療法在中國漢族癲癇患者中的療效顯著相關等等。因此，研究卡馬西平在臨床用藥中用藥指導方法以及確認其使用安全性具有重要的意義。參考基因檢測的結果，醫生可以在開處方時，在藥品選擇、劑量控制及聯合用藥等方面提出適合每個患者自己的個體化用藥方案，最終達到提高藥物療效、降低藥物毒，讓患者走出用藥盲區，用準藥，用好藥，把握最佳治療時期。目前臨床尚未有十分有效的卡馬西平用藥指導方法，因此亟需建立一種高靈敏，經濟，簡單的分子技術篩查方法，一次性評估患者使用卡馬西平的用藥風險及有效性。

發明內容

本發明的目的在于提供一種卡馬西平個體化用藥基因的指導方法及試劑盒。

本發明的第一方面，提供了一種卡馬西平個體化用藥基因的指導試劑盒，所述試劑盒包括PCR擴增引物對組，所述PCR擴增引物對組包括特異性擴增選自下組的SNP位點的引物對：rs2032582、rs3812718、rs3909184、rs267606617、rs1051740、rs2234922、rs2298771和rs1061235。

在另一優選例中，所述試劑盒基于多重PCR飛行時間質譜檢測卡馬西平個體化用藥基因SNP基因突變位點。

在另一優選例中，所述試劑盒還包括單堿基延伸引物組。

在另一優選例中，所述PCR擴增引物對組中，特異性擴增rs2032582的引物對如SEQID NO.1至SEQ ID NO.2所示。

在另一優選例中，所述PCR擴增引物對組中，特異性擴增rs3812718的引物對如SEQID NO.3至SEQ ID NO.4所示。

在另一優選例中，所述PCR擴增引物對組中，特異性擴增rs3909184的引物對如SEQID NO.5至SEQ ID NO.6所示。

在另一優選例中，所述PCR擴增引物對組中，特異性擴增rs267606617的引物對如SEQ ID NO.7至SEQ ID NO.8所示。