[發明專利]一種腸道內菌群鑒定分析方法在審
| 申請號: | 202011596622.7 | 申請日: | 2020-12-30 |
| 公開(公告)號: | CN112695077A | 公開(公告)日: | 2021-04-23 |
| 發明(設計)人: | 侯明飛;朱月艷;孫子奎 | 申請(專利權)人: | 上海派森諾醫學檢驗所有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/686 | 分類號: | C12Q1/686;C12Q1/689;C12Q1/06;C12Q1/14;C12R1/46;C12R1/145;C12R1/01 |
| 代理公司: | 上海點威知識產權代理有限公司 31326 | 代理人: | 胡志強 |
| 地址: | 201799 上海*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 腸道 內菌群 鑒定 分析 方法 | ||
1.一種腸道內菌群鑒定分析方法,其特征在于,包括下列步驟:
1)進行干糞便隱血檢測,使用大便隱血檢測試劑盒通過膠體金法進行檢測,獲得檢測結果;
2)樣品提取,取糞便樣本裝入管中,糞便樣本中加入緩沖液GA,通過振蕩或吹吸使糞便樣本懸浮,然后加入20~30ulProteinase K,混勻,加入緩沖液GB,振蕩15s,70℃金屬浴放置25~35min,同時震蕩1000/min,溶液變清亮后離心,加入無水乙醇,充分振蕩混勻15s,離心,沉淀絮狀物,將管內溶液加入到吸附柱中,離心,吸附柱放入收集管中,然后向吸附柱加入緩沖液GD,離心,移除廢液,漂洗處理,然后放入收集管中,離心,移除廢液,室溫放置3~6min,隨后將吸附柱轉入離心管中,箱吸附膜的中間部位懸空滴加洗脫緩沖液TE,65℃放置2~5min,離心2min,將其中溶液收集到離心管中,獲得DNA樣本;
3)樣品質控,將步驟2)中所提取的DNA樣本經分光光度計測試其濃度≥20ng/μl,經分光光度計測試OD260/OD280值為1.9±0.2,獲得質檢合格的DNA樣本;
4)qPCR擴增,將質檢合格的DNA樣本使用滅菌水稀釋到指定濃度,然后分別構建qPCR反應體系,然后進行擴增;
5)數據分析,通過軟件,獲得分析結果。
2.如權利要求1所述的一種腸道內菌群鑒定分析方法,其特征在于,所述反應體系如下:
3.如權利要求1所述的一種腸道內菌群鑒定分析方法,其特征在于,所述反應體系如下:
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10.如權利要求1所述的一種腸道內菌群鑒定分析方法,其特征在于,所述擴增反應條件:
循環參數,95℃,30s;95℃,5s至60℃,34s,循環32次;60℃檢測熒光;溶解曲線,95℃,15s;60℃,1min至95℃,0.3℃/sec檢測熒光;
熒光通道檢測選擇,檢測為SYBR通道,根據結果判斷標準判讀結果。
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