[發明專利]基于二代測序技術的肝癌檢測panel、試劑盒及其應用

在審

• 申請號: 202011584722.8
• 申請日: 2020-12-28
• 公開（公告）號: CN112626213A
• 公開（公告）日: 2021-04-09
• 發明（設計）人: 王魯;趙一鳴;朱衛平;毛岸榮;王龍蓉;邵志敏;黃薇;胡欣;施景繡;裴雨晨;王云錦;張國亮;牛珍珍
• 申請（專利權）人: 復旦大學附屬腫瘤醫院
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886
• 代理公司: 上海容慧專利代理事務所(普通合伙) 31287
• 代理人: 于曉菁

1.基于二代測序技術的肝癌檢測panel，其特征在于，所述檢測panel包括用于檢測肝癌預后相關的基因突變及基因拷貝數變異。

2.根據權利要求1所述的檢測panel，其特征在于，所述基因突變包括以下基因：ABCA12、ABCA13、ABCC12、ABL1、ACBD5、ADAM21、ADAMTSL1、ADGRG4、ADPRH、AFF1、AKT1、AKT2、AKT3、ALK、ALOX12B、AMER1、ANK2、ANK3、ANKLE1、APC、APEX2、APOB、APP、AR、ARAF、ARHGAP32、ARID1A、ARRB2、ASTE1、ASXL1、ATM、ATP13A3、ATR、ATRX、AURKA、AURKB、AXIN1、AXL、B2M、BAP1、BARD1、BAX、BCL2、BCL2L1、BCL6、BCL9L、BCLAF1、BCOR、BDKRB1、BEND3、BIRC2、BIRC3、BIRC7、BLM、BMPR1A、BPTF、BRAF、BRCA1、BRCA2、BRD4、BRIP1、BRPF3、BSND、BTK、C1QBP、C1QTNF5、CACNA1A、CACNA1E、CALR、CARD11、CASP8、CBFB、CBL、CCDC150、CCDC168、CCND1、CCND2、CCND3、CCNE1、CD274、CD40、CD79A、CD79B、CD93、CDC73、CDH1、CDH8、CDK1、CDK12、CDK4、CCDK5RAP1、CDK6、CDK8、CDKN1A、CDKN1B、CDKN2A、CDKN2B、CDKN2C、CDS1、CEBPA、CELSR3、CENPJ、CEP290、CFTR、CHEK1、CHEK2、CIC、COBLL1、COL14A1、COL21A1、COL22A1、COPG1、CREBBP、CRKL、CSF1R、CSF3R、CSMD1、CTCF、CTLA4、CTNNB1、CUL3、CXCR4、CYB5A、DAXX、DDR2、DIABLO、DIS3、DLL1、DNAH10、DNAH11、DNAH2、DNAH5、DNAH7、DNAH9、DNAJC3、DNMT1、DNMT3A、DNMT3B、DOCK2、DOCK9、DOT1L、DROSHA、DST、DTD1、DUSP4、EED、EGFR、ELOC、EP300、EPCAM、EPHA3、EPHA4、EPHA5、EPHA7、EPHB1、ERBB2、ERBB2IP、ERBB3、ERBB4、ERCC1、ERCC2、ERCC4、ERG、ERRFI1、ESR1、ETNK1、ETS2、ETV1、EVC2、EZH2、FAM129B、FAM149B1、FAM170B、FAM46C、FANCA、FANCC、FAT1、FAT3、FAT4、FBN2、FBXW7、FCGBP、FGF19、FGF3、FGF4、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、FH、FIP1L1、FKBP9、FLCN、FLG、FLT1、FLT3、FLT4、FOXL2、FOXO1、FOXP1、FREM2、FRG1、FSIP2、FUBP1、FZD10、GALNT12、GATA3、GCNT4、GGT1、GLRB、GLRX、GLRX2、GNA11、GNAQ、GNAS、GOLGA6L2、GPR98、GREM1、GRIN2A、GRM7、GSK3B、GYPB、H3F3A、HADHB、HDAC9、HGF、HIPK2、HIST1H1C、HIVEP3、HMCN1、HMGB1、HNF1A、HOXB13、HRAS、HSPB1、HTRA1、HYDIN、ID3、IDH1、IDH2、IGF1、IGF1R、IGF2、IKBKE、IKZF1、IL10、IL12RB2、IL13RA1、IL17FIL7R、INPP4B、INSR、IRF2、IIRF2BP1、IRF4、IRS1、IRS2、IIRX4、ITIH5JAG1、JAK1、JAK2、JAK3、JPH4、JUN、KCND3、KCNJ8、KDM5A、KDM5C、KDM6A、KDR、KEAP1、KIAA1549L、KIAA2018、KIT、KLF15、KLF4、KLK10、KMT2A、KMT2C、KMT2D、KRAS、LACTB2、LAMA1、LAMA2、LATS1、LATS2、LBR、LIG4、LMO1、LPCAT4、LRP1B、LRP2、LRRC58、LSM14A、LTN1、MACF1、MADCAM1、MALT1、MAP1B、MAP2K1、MAP2K2、MAP2K4、MAP3K1、MAP3K13、MAP3K14、MAP4K5、MAPK1、MAPK3、MCL1、MDK、MDM2、MDM4、MDN1、MED12、MEF2B、MEN1、MET、MGLL、MID1、MITF、MLH1、MMP1、MORC4、MPL、MRC2、MRE11A、MSH2、MSH3、MSH6、MST1、MST1R、MTAP、MTMR14、MTOR、MUC1、MUC16、MUC4、MUTYH、MYC、MYCL、MYCN、MYD88、NBEA、NBN、NDUFV2、NEB、NEDD4L、NEGR1NELL2、NEURL1B、NF1、NF2、NFE2L2、NFKBIA、NID1、NKX2-1、NKX3-1、NOL3、NOTCH1、NOTCH2、NOTCH3、NOTCH4、NPM1、NRAS、NSD1、NTRK1、NTRK2、NTRK3、NUP153、NUP93、OBSCN、OLFM1、OR4C5、PAK1、PAK5、PALB2、PALM、PARP1、PAX5、PBRM1、PCDH11Y、PCDH15、PCDH17、PCDHA5、PCED1A、PCLO、PCMTD1、PDCD1、PDE4DIP、PDGFRA、PDGFRB、PDPK1、PGR、PHOX2B、PIK3C2G、PIK3CA、PIK3CB、PIK3R1、PIK3R6、PIM1、PLCG2、PLK1、PLK2、PLS1、PMS1、PMS2、PNRC1、POLD1、POLE、PPARGC1A、PPM1D、PPP2R1A、PPP6C、PRDM1、PREX2、PRG4、PPKAR1A、PRKD1、PRKDC、PRKN、PROP1、PROSER2、PRRC1、PRRT2、PRSS12、PSMG4、PTCH1、PTEN、PTPN11、PTPRD、PTPRS、PTPRT、RAB10、RAB35、RABGGTA、RAC1、RAD21、RAD50RAD51、RAD51B、RAD51C、RAD51D、RAD52、RAD54L、RAF1、RAP2C、RARA、RASA1、RB1、RB1CC1、RBM10、RBMX、RECQL4、REL、RELA、RET、RFC3、RFWD2、RHEB、RHOA、RICTOR、RIMS2、RIOK1、RIT1、RNF43、ROBO1、ROS1、RPTN、RPTOR、RRP7A、RYR1、RYR2、RYR3、SACS、SART3、SCAP、SCN10A、SDHA、SDHB、SDHC、SDHD、SETD2、SF3B1、SKIL、SLC1A4、SLC20A1、SLC22A9、SLC35A1、SMAD2、SMAD4、SMARCA4、SMARCB1、SMO、SMURF1、SNX25、SOCS1、SOX17、SOX2SOX3、SOX9、SPEG、SPEN、SPINK6、SPOP、SRC、SRSF2、STAG2、STARD9、STAT1、STAT3、STK11、SXBP2、SUFU、SUMO1、SUZ12、SYK、SYNE1、SYNE2、TAF1L、TAF9B、TANC1、TBC1D17、TBX3、TCF3、TXNRD2、U2AF1、UBR5、UNC13C、UNC79、UNC93A、USP21、VEGFA、VHL、VWF、WDFY4、WHSC1L1、WNT8A、WT1、XIRP2、XPO1、XRCC1、XRCC2、YAF2、YAP1、YIPF2、YTHDC1、ZAN、ZDHHC11B ZFHX4、ZFP36L2、ZMIZ1、ZMIZ2、ZNF248、ZNF264、ZNF90。