[發明專利]一種用于預測肝細胞癌免疫治療療效的模型及其構建方法

有效

• 申請號: 202011573822.0
• 申請日: 2020-12-25
• 公開（公告）號: CN112614546B
• 公開（公告）日: 2022-09-02
• 發明（設計）人: 朱海紅;顧心雨;陳智;管俊
• 申請（專利權）人: 浙江大學
• 主分類號: G16B40/00
• 分類號: G16B40/00;G16B25/00;G16H50/70;G16H50/30;G16H10/20;G01N33/574
• 代理公司: 杭州中成專利事務所有限公司 33212
• 代理人: 朱瑩瑩

1.用于預測肝細胞癌免疫治療療效的模型的構建方法，所述模型 包括5個基因乳酸脫氫酶A（LDHA）、磷脂磷酸磷酰胺異質酶（PPAT）、珠子纖維結構蛋白1（BFSP1）、核受體亞纖維0組B成員1（NR0B1）和6-磷脂-2-激酶/果糖酶-2，6-雙磷酸酶4（PFPFB4），包括如下步驟：

1）篩選與HCC預后相關的免疫相關基因4227 個；

2）在TCGA-LIHC訓練集中，對 4227 個免疫相關基因和生存數據使用R包“coxph”進行單變量Cox回歸分析，鑒定與HCC預后相關的免疫相關性基因，確定245個基因為HCC OS的潛在預后指標；

3）采用LASSO-Cox回歸分析進一步縮小目標基因，基于LASSO-Cox回歸模型系數乘以mRNA表達水平建立預后基因模型；確定5個基因：包括乳酸脫氫酶A（LDHA）、磷脂磷酸磷酰胺異質酶（PPAT）、珠子纖維結構蛋白1（BFSP1）、核受體亞纖維0組B成員1（NR0B1）和6-磷脂-2-激酶/果糖酶-2，6-雙磷酸酶4（PFPFB4）；風險評分是五個基因的加權基因表達水平的總和乘以各自的 LASSO 系數：風險評分 = [0.307 × LDHA 表達水平]+ [0.268 ×PPAT表達水平] + [0.455 × BFSP1表達水平] + [0.234 × NROB1 表達水平] + [0.109 ×PFKFB4表達水平] ；結果分析顯示，5個基因的LASSO系數均為陽性。

2.根據權利要求1所述構建方法，該方法還包括：利用TCGA-LIHC訓練集評價基于五基因模型的預測效率。

3.根據權利要求1所述構建方法，該方法還包括：使用TCGA-LIHC驗證集、TCGA-LIHC全集和GSE14520數據集驗證基于5基因的HCC預后模型。