[發(fā)明專利]一種香菇CV105菌株的InDel標(biāo)記指紋圖譜及其構(gòu)建方法

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202011568639.1
• 申請(qǐng)日: 2020-12-25
• 公開（公告）號(hào): CN112626252B
• 公開（公告）日: 2023-02-03
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 沈秀芬;章爐軍;于海龍;譚琦;尚曉冬;翟丹丹;劉建雨;姜寧;董浩然
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院
• 主分類號(hào): C12Q1/6895
• 分類號(hào): C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645
• 代理公司: 上海容慧專利代理事務(wù)所(普通合伙) 31287
• 代理人: 張竹梅

1.一種用于鑒定香菇CV105菌種的方法，其特征在于利用如下7對(duì)InDel標(biāo)記引物組合，對(duì)香菇菌種進(jìn)行擴(kuò)增，將得到的帶型與CV105菌種的帶型對(duì)照，與該帶型一致即為香菇CV105菌種；其中香菇CV105菌種的帶型編號(hào)組合為：1/0/2/1/2/1/2其中引物L(fēng)efp_id001對(duì)應(yīng)的編號(hào)是第一對(duì)帶型1，其中1對(duì)應(yīng)的是203bp；引物L(fēng)efp_id002對(duì)應(yīng)的編號(hào)是第二對(duì)帶型0，其中0對(duì)應(yīng)的是沒有條帶；引物L(fēng)efp_id003對(duì)應(yīng)的編號(hào)是第三對(duì)帶型2，其中2對(duì)應(yīng)的是248bp；引物L(fēng)efp_id004對(duì)應(yīng)的編號(hào)是第四對(duì)帶型1，其中1對(duì)應(yīng)的270bp；引物L(fēng)efp_id005對(duì)應(yīng)的編號(hào)是第五對(duì)帶型2，其中2對(duì)應(yīng)的是346bp；引物L(fēng)efp_id006對(duì)應(yīng)的編號(hào)是第六對(duì)帶型1，其中1對(duì)應(yīng)的是277bp；引物L(fēng)efp_id007對(duì)應(yīng)的編號(hào)是第七對(duì)帶型2，其中2對(duì)應(yīng)的是264bp；

7對(duì)InDel標(biāo)記引物序列5′-3′如下：

Lefp_id001正向引物：ACGGATGGAGAGACACAGGA

反向引物：TGCCCCACTTACTCTCAACC

Lefp_id002正向引物：CCTTTCTCAAAAGCGGACTG

反向引物：GGGAGTGGGTTGTTTGGATA

Lefp_id003正向引物：CGGATGTTATGCACTGGAAG

反向引物：CGTACGGTTGGACATTTGAA

Lefp_id004正向引物：AGCCTTTCACAGTCAGCTCG

反向引物：GTCAACGGAGGGAAACAGAG

Lefp_id005正向引物：GTAGCACTCCTCATACAACC

反向引物：ACCAAATGTCACAGCACAGG

Lefp_id006正向引物：ACATTGGCGAAGGCTGTACG

反向引物：CCCTTTTGCCCTATAAGGCG

Lefp_id007正向引物：AACAGTAACCTGTGCACTGC

反向引物：CATGATCAGATCACACAGCG。