[發明專利]一種香菇CV105菌株的InDel標記指紋圖譜及其構建方法

有效

• 申請號: 202011568639.1
• 申請日: 2020-12-25
• 公開（公告）號: CN112626252B
• 公開（公告）日: 2023-02-03
• 發明（設計）人: 沈秀芬;章爐軍;于海龍;譚琦;尚曉冬;翟丹丹;劉建雨;姜寧;董浩然
• 申請（專利權）人: 上海市農業科學院
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645
• 代理公司: 上海容慧專利代理事務所(普通合伙) 31287
• 代理人: 張竹梅

1.一種用于鑒定香菇CV105菌種的方法，其特征在于利用如下7對InDel標記引物組合，對香菇菌種進行擴增，將得到的帶型與CV105菌種的帶型對照，與該帶型一致即為香菇CV105菌種；其中香菇CV105菌種的帶型編號組合為：1/0/2/1/2/1/2其中引物Lefp_id001對應的編號是第一對帶型1，其中1對應的是203bp；引物Lefp_id002對應的編號是第二對帶型0，其中0對應的是沒有條帶；引物Lefp_id003對應的編號是第三對帶型2，其中2對應的是248bp；引物Lefp_id004對應的編號是第四對帶型1，其中1對應的270bp；引物Lefp_id005對應的編號是第五對帶型2，其中2對應的是346bp；引物Lefp_id006對應的編號是第六對帶型1，其中1對應的是277bp；引物Lefp_id007對應的編號是第七對帶型2，其中2對應的是264bp；

7對InDel標記引物序列5′-3′如下：

Lefp_id001正向引物：ACGGATGGAGAGACACAGGA

反向引物：TGCCCCACTTACTCTCAACC

Lefp_id002正向引物：CCTTTCTCAAAAGCGGACTG

反向引物：GGGAGTGGGTTGTTTGGATA

Lefp_id003正向引物：CGGATGTTATGCACTGGAAG

反向引物：CGTACGGTTGGACATTTGAA

Lefp_id004正向引物：AGCCTTTCACAGTCAGCTCG

反向引物：GTCAACGGAGGGAAACAGAG

Lefp_id005正向引物：GTAGCACTCCTCATACAACC

反向引物：ACCAAATGTCACAGCACAGG

Lefp_id006正向引物：ACATTGGCGAAGGCTGTACG

反向引物：CCCTTTTGCCCTATAAGGCG

Lefp_id007正向引物：AACAGTAACCTGTGCACTGC

反向引物：CATGATCAGATCACACAGCG。