[發(fā)明專利]一種利用DGKK基因中SV119分子標記區(qū)分大白豬和香豬的檢測技術(shù)

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 202011547777.1
• 申請日: 2020-12-24
• 公開（公告）號: CN112626230A
• 公開（公告）日: 2021-04-09
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 冉雪琴;黃世會;李大鵬;牛熙;王嘉福
• 申請（專利權(quán)）人: 貴州大學
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 貴陽易博皓專利代理事務(wù)所(普通合伙) 52116
• 代理人: 田常娟

1.一種區(qū)分大白豬和香豬的SV119分子標記，其特征在于：分子標記SV119位于豬參考基因組Sscrofa 11.1chrX:4404870644048824，共119bp，包含在DGKK基因的第2內(nèi)含子上，該區(qū)域存在缺失或不缺失兩種類型，SV區(qū)間有I和D兩種等位基因，II、ID和DD型三種基因型，其中II為正常基因型、DD為純合缺失基因型、ID為雜合型。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種區(qū)分大白豬和香豬的SV119分子標記，其特征在于：所述的SV119分子標記的一組引物，上游引物DGKK-F1：5’-CATTTATGCACTGAACAGAGGAGTAAC-3’，下游引物DGKK-R1：5’-CATTTCTTAGTCATTTAATTTGTTGGCA-3’，能特異性擴增出兩種大小不一的目的條帶，對應(yīng)序列分別為SEQ ID No.1和SEQ ID No.2，缺失區(qū)間序列為SEQ ID No.3。

3.如權(quán)利要求1或2之一所述的一種區(qū)分大白豬和香豬的SV119分子標記的檢測方法，其特征在于：包括以下步驟：(1)提取待測大白豬和香豬基因組DNA；(2)以2個待測豬種的基因組DNA為模板，分別利用上游引物DGKK-F1、下游引物DGKK-R1進行PCR擴增；(3)用3.0％含核酸染料的瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物，凝膠成像系統(tǒng)觀察記錄條帶并判斷待測樣品SV119的基因型。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的檢測方法，其特征在于：所述的步驟(2)中進行PCR所使用的擴增體系為20μL，具體如下：

進行PCR采用的反應(yīng)條件：

5.一種利用權(quán)利要求1或2所述的SV119分子標記區(qū)分大白豬和香豬的檢測方法，其特征在于：包括以下步驟：(1)采用普通PCR技術(shù)檢測SV119在大白豬和香豬群體中的基因型分布情況；(2)應(yīng)用SPSS v26.0中的卡方檢驗進行雙側(cè)檢驗，分析大白豬與香豬該SV119區(qū)間等位基因分布頻率的差異；(3)根據(jù)群體中SV119的等位基因頻率不同來區(qū)分大白豬和香豬。