[發明專利]與大口黑鱸食欲抑制相關的SNPs位點及應用有效
| 申請號: | 202011488730.2 | 申請日: | 2020-12-16 |
| 公開(公告)號: | CN112626227B | 公開(公告)日: | 2022-08-02 |
| 發明(設計)人: | 胡婕;孫承熙;葉星 | 申請(專利權)人: | 中國水產科學研究院珠江水產研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/6888 | 分類號: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京久維律師事務所 11582 | 代理人: | 邢江峰 |
| 地址: | 510000 廣東*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 大口 食欲 抑制 相關 snps 應用 | ||
本發明提供一種大口黑鱸POMC中的SNPs位點及應用,屬于水產育種和生物基因技術領域。本發明探討了在禁食和復喂條件下大口黑鱸與POMC基因多態性有關的內分泌生理學。從具有SNP位點注解的轉錄組數據集中獲得POMC的單基因序列,克隆POMC cDNA的全長,并分析該基因的結構和同源性。確定了大口黑鱸POMC中SNP的位點和基因型,并計算了以不同食物養殖的群體中不同基因型的頻率分布。禁食和復喂后比較POMC基因型的表達模式。通過配方飼料替代餌料魚來馴化大口黑鱸已經在水產養殖業中得到了很好的發展,這項研究將有利于大口黑鱸食性的分子標記輔助育種,用于獲得具備快速生長、配方飼料高利用率和高馴化效率攝食性狀的大口黑鱸群體。
技術領域
本發明涉及水產育種和生物基因技術領域,涉及一種與大口黑鱸食欲抑制相關的SNPs位點及應用。
背景技術
大口黑鱸(Micropterus salmoides)如今已成為水產養殖中產量最高的物種之一,2019年其年產量為477,808噸(《中國漁業統計年鑒2020》)。野生的大口黑鱸作為肉食性魚,在自然環境中喜歡捕食小魚、小龍蝦、兩棲動物和昆蟲,而商業養殖的大口黑鱸則以冷凍或活的餌料魚為食。餌料魚造成了巨大的生產成本和對海洋資源的過度開發,同時,過量的餌料魚會使水質急劇惡化。為了減輕魚粉的負面影響,不可避免地,在大口黑鱸的生產中使用配方飼料作為替代品是一種趨勢。大口黑鱸已經通過替代飼料馴化了十多年(Portz和Cyrino,2004;Ren等,2018;Tidwell等,2005)。經過選育的攝食配方飼料的大口黑鱸新品種或種群,目前已在中國20多個城市進行養殖(Bai and Li,2019;Ma et al.,2019)。
魚類表現出不同的攝食或飲食習慣,表明在食物攝入方面存在復雜的生物過程和內分泌調節的協調過程。食物攝入調節涉及大腦和周圍組織產生的各種食欲調節因子,這些因子會影響大腦的攝食中樞從而促進或抑制進食(Hoskins and Volkoff,2012;Londonand Volkoff,2019;Volkoff,2016)。一項過去的研究表明,在脂鯉目魚類(Characiformes)中,食欲調節肽對禁食的不同反應與食性和家族分類都有關系(Butt et al.,2019)。
下丘腦包含兩種調節食物攝入和能量代謝的神經元:促進食欲的刺鼠肽相關蛋白(AgRP)神經元和抑制食欲的阿黑皮素原(POMC)神經元(Sun et al.,2016;Xiao et al.,2017)。POMC神經元釋放前體肽,該前體肽經過組織特異性切割后產生數十種肽,包括促腎上腺皮質激素(ACTH)、α-,β-和γ-促黑激素(α-,β-和γ-MSH)、促腎上腺皮質激素樣中間葉肽(CLIP)、以及內源性阿片樣物質β-內啡肽、γ-促脂解素和甲硫氨酸—腦啡肽(Dores andBaron,2011;Vallarino et al.,2012)。POMC的差異切割發生在表達它的各種組織或物種中,從而導致多種生物學功能。α-MSH以及促腎上腺皮質激素樣中間肽(CLIP)構成促腎上腺皮質激素(ACTH),ACTH在硬骨魚如金頭鯛(Sparus aurata)、歐洲海鱸(Dicentrarchuslabrax)應對壓力的神經內分泌反應中,是下丘腦-垂體-腎間組織軸(HPI)的關鍵組成(Rotllant et al.,2000;Tsalafouta et al.,2014)。大腦中表達POMC mRNA的神經元通過形成β-內啡肽來控制哺乳動物的免疫過程或緩解焦慮和抑郁(Ishikawa et al.,2013;Maddila et al.,2017)。
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