[發(fā)明專利]與芝麻抗旱性狀相關(guān)的KASP分子標(biāo)記及應(yīng)用

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 202011438040.6
• 申請日: 2020-12-10
• 公開（公告）號: CN112501337A
• 公開（公告）日: 2021-03-16
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 黎冬華;張秀榮;山姆;游均;劉愛麗;周瑢
• 申請（專利權(quán)）人: 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院油料作物研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11;A01H1/04
• 代理公司: 武漢智嘉聯(lián)合知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 42231
• 代理人: 丁倩

本發(fā)明涉及與芝麻抗旱性狀相關(guān)的KASP分子標(biāo)記及其應(yīng)用。該KASP分子標(biāo)記命名為C12565472A，其位于芝麻第4條染色體上的第12565472位，所述KASP分子標(biāo)記具有多態(tài)性的核苷酸為C/A。本發(fā)明開發(fā)出與KASP分子標(biāo)記C12565472A，在92個(gè)株系組成的自然群體中與在干旱條件下株高性狀顯著相關(guān)，說明本發(fā)明中開發(fā)的KASP分子標(biāo)記可對干旱條件下芝麻抗旱性實(shí)現(xiàn)輔助選擇作用，為選育抗旱芝麻品種奠定理論基礎(chǔ)且提供分子輔助選擇手段。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及芝麻分子標(biāo)記技術(shù)領(lǐng)域，尤其涉及與芝麻抗旱性狀相關(guān)的KASP分子標(biāo)記及應(yīng)用。

背景技術(shù)

近年來我國芝麻生產(chǎn)旱害發(fā)生不斷加重，造成減產(chǎn)嚴(yán)重。芝麻產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系對我國主產(chǎn)區(qū)7省138個(gè)縣次的調(diào)查結(jié)果發(fā)現(xiàn)，2008-2019年旱害發(fā)生縣頻率逐年上升，近五年高達(dá)60-75％，造成減產(chǎn)13-26％。此外，芝麻干旱危害，在印度、埃塞俄比亞、尼日利亞、泰國、土耳其等非洲和南亞芝麻生產(chǎn)地區(qū)的大多數(shù)國家普遍存在。因此，提高芝麻抗旱能力，促進(jìn)高產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)，對促進(jìn)我國芝麻生產(chǎn)發(fā)展、解決總量自給不足的問題十分必要。

芝麻抗旱性的研究比較薄弱，研究報(bào)道主要集中在干旱對芝麻植株形態(tài)、產(chǎn)量性狀、品質(zhì)性狀及生理生化的影響，分子相關(guān)研究較少。利用傳統(tǒng)育種手段進(jìn)行抗旱芝麻種質(zhì)資源的選育存在選擇率低、周期長等問題。分子標(biāo)記輔助育種是解決這一問題的有效手段。

相較其它作物，芝麻抗旱遺傳和分子機(jī)制的研究報(bào)道相對較少，國內(nèi)尚未有與芝麻抗旱相關(guān)的分子標(biāo)記的報(bào)道。因此，發(fā)掘芝麻抗旱相關(guān)的分子標(biāo)記，并利用該標(biāo)記篩選抗旱性強(qiáng)的芝麻種質(zhì)資源材料，為選育抗旱芝麻品種奠定了理論基礎(chǔ)，并提供了分子輔助選擇手段。

發(fā)明內(nèi)容

有鑒于此，有必要提供一種與芝麻抗旱性狀相關(guān)的KASP分子標(biāo)記，為其抗旱型育種提供分子選育的技術(shù)手段。

本發(fā)明第一方面，提供一種與芝麻抗旱性狀相關(guān)的KASP分子標(biāo)記，所述KASP分子標(biāo)記命名為C12565472A，其位于芝麻第4條染色體上的第12565472位，所述KASP分子標(biāo)記具有多態(tài)性的核苷酸為C/A。

具體的，所述KASP分子標(biāo)記中，具有多態(tài)性位點(diǎn)的基因型為AA，對應(yīng)極端抗旱型芝麻；基因型為CC，對應(yīng)中等抗旱型或干旱敏感型芝麻。

本發(fā)明第二方面，提供一種用于擴(kuò)增所述KASP分子標(biāo)記的引物組。

進(jìn)一步的，所述引用組包括如SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示的引物，如SEQ ID NO.2-3所示的單鏈DNA分子或其衍生物，以及如SEQ ID NO.4所示的單鏈DNA分子。

進(jìn)一步的，如SEQ ID NO.2所示的單鏈DNA分子的衍生物為SEQ ID NO.1所示的單鏈DNA分子的5’端連接一種熒光標(biāo)簽得到的；如SEQ ID NO.3所示的單鏈DNA分子的衍生物為SEQ ID NO.3所示的單鏈DNA分子的5’端連接一種熒光標(biāo)簽得到的。

本發(fā)明第三方面，提供一種含有所述引物組的試劑或試劑盒。

本發(fā)明第四方面，提供所述KASP分子標(biāo)記、所述引物組及所述試劑或試劑盒的以下任一應(yīng)用：

(1)在鑒定芝麻抗旱表型中的應(yīng)用；

(2)在抗旱型芝麻種質(zhì)資源鑒定、改良或分子標(biāo)記輔助育種中的應(yīng)用；

(3)在篩選抗旱芝麻種質(zhì)中的應(yīng)用；

(4)在預(yù)測芝麻抗旱能力中的應(yīng)用。

本發(fā)明第五方面，提供一種抗旱芝麻的育種方法，包括：檢測待測芝麻基因組中所述KASP分子標(biāo)記基因型，選擇待測芝麻基因組中所述KASP分子標(biāo)記基因型為CC的芝麻進(jìn)行育種。