[發明專利]與芝麻抗旱性狀相關的KASP分子標記及應用

在審

• 申請號: 202011438040.6
• 申請日: 2020-12-10
• 公開（公告）號: CN112501337A
• 公開（公告）日: 2021-03-16
• 發明（設計）人: 黎冬華;張秀榮;山姆;游均;劉愛麗;周瑢
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院油料作物研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11;A01H1/04
• 代理公司: 武漢智嘉聯合知識產權代理事務所(普通合伙) 42231
• 代理人: 丁倩

1.與芝麻抗旱性狀相關的KASP分子標記，其特征在于，所述KASP分子標記命名為C12565472A，其位于芝麻第4條染色體上的第12565472位，所述KASP分子標記具有多態性的核苷酸為C/A。

2.根據權利要求1所述的KASP分子標記，其特征在于，所述KASP分子標記中，具有多態性位點的基因型為AA，對應極端抗旱型芝麻。

3.用于擴增權利要求1或2所述KASP分子標記的引物組。

4.根據權利要求3所述的引用組，其特征在于，包括如SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3和SEQID NO.4所示的引物，如SEQ ID NO.2-3所示的單鏈DNA分子或其衍生物，以及如SEQ IDNO.4所示的單鏈DNA分子。

5.根據權利要求4所述的引物組，其特征在于，如SEQ ID NO.2所示的單鏈DNA分子的衍生物為SEQ ID NO.1所示的單鏈DNA分子的5’端連接一種熒光標簽得到的；如SEQ ID NO.3所示的單鏈DNA分子的衍生物為SEQ ID NO.3所示的單鏈DNA分子的5’端連接一種熒光標簽得到的。

6.含有權利要求3-5任一項所述引物組的試劑或試劑盒。

7.權利要求1或2所述的KASP分子標記、權利要求3-5任一所述的引物組及權利要求6所述的試劑或試劑盒的以下任一應用：

(1)在鑒定芝麻抗旱表型中的應用；

(2)在抗旱型芝麻種質資源鑒定、改良或分子標記輔助育種中的應用；

(3)在篩選抗旱芝麻種質中的應用；

(4)在預測芝麻抗旱能力中的應用。

8.一種抗旱芝麻的育種方法，包括：檢測待測芝麻基因組中如權利要求1所述的KASP分子標記基因型，選擇待測芝麻基因組中所述KASP分子標記基因型為CC的芝麻進行育種。

9.根據權利要求8所述的育種方法，其特征在于：檢測待測所述KASP分子標記C12565472A對應的芝麻基因型的方法為：用權利要求3-5任一所述引物組、權利要求6所述試劑或試劑盒對所述待測芝麻基因組DNA進行PCR擴增獲得產物，對產物進行基因分型。

10.根據權利要求9所述的育種方法，其特征在于：所述基因分型的方法包括檢測產物的熒光信號，根據熒光信號確定基因型：

若所述產物顯示如SEQ ID NO.2所示的單鏈DNA分子的5’端連接的熒光標簽的顏色，則所述待測芝麻KASP分子標記C12565472A的基因型為AA；

若所述產物僅顯示如SEQ ID NO.3所示的單鏈DNA分子的5’端連接的熒光標簽的顏色，則所述待測芝麻KASP分子標記C12565472A的基因型為CC。