[發明專利]染色體分割方法、裝置、設備和存儲介質在審
| 申請號: | 202011375268.5 | 申請日: | 2020-11-30 |
| 公開(公告)號: | CN114581457A | 公開(公告)日: | 2022-06-03 |
| 發明(設計)人: | 許德鵬;劉曉康;王雪峰;陳齊文 | 申請(專利權)人: | 深圳市瑞圖生物技術有限公司 |
| 主分類號: | G06T7/11 | 分類號: | G06T7/11;G06T7/155;G16H30/20 |
| 代理公司: | 華進聯合專利商標代理有限公司 44224 | 代理人: | 黃晶晶 |
| 地址: | 518101 廣東省深圳市寶安區福*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 染色體 分割 方法 裝置 設備 存儲 介質 | ||
1.一種染色體分割方法,其特征在于,所述方法包括:
提取染色體的初步分割圖像中染色體輪廓的骨架線;
根據所述骨架線,確定所述染色體的類型;
若所述類型表征所述染色體屬于重疊的染色體,則
將所述類型所對應的至少一種候選重疊分割方案輸出至交互界面;
獲取基于交互界面從所述候選重疊分割方案中指定的目標重疊分割方案;
執行目標重疊分割方案,以將所述初步分割圖像中重疊的染色體分割為單條染色體。
2.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法還包括:
將初始的染色體圖像轉換為灰度圖;
將所述灰度圖進行自適應直方圖均衡化處理;
對經過自適應直方圖均衡化處理后的圖像進行二值化分割處理,得到染色體的初步分割圖像。
3.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述提取染色體的初步分割圖像中染色體輪廓的骨架線包括:
從染色體的初步分割圖像中提取染色體輪廓;
按照輪廓像素點數量和輪廓圓度中至少一種,對所述染色體輪廓進行篩選;
提取篩選后保留的染色體輪廓的骨架線。
4.根據權利要求3所述的方法,其特征在于,所述方法還包括:
計算所述染色體輪廓上各像素點到區域中心的平均距離;
計算所述染色體輪廓上各像素點分別到所述區域中心的距離與所述平均距離之間的偏差;
根據所述平均距離和所述偏差,確定所述染色體輪廓的輪廓圓度。
5.根據權利要求3所述的方法,其特征在于,所述方法還包括:
確定篩選后保留的染色體輪廓上每個像素點到所述骨架線的平均最短距離;
從篩選后保留的所述染色體輪廓中,移除所述平均距離小于預設距離閾值的染色體輪廓;
根據滑動的均值濾波器,對移除后剩余的染色體輪廓上的各像素點的位置坐標進行平滑處理。
6.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述根據所述骨架線,確定所述染色體的類型包括:
獲取所述骨架線的終點數和交點數;
根據所述終點數和交點數,確定所述染色體的類型。
7.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法還包括:
提取所述染色體輪廓上的凸點和凹點;
所述將所述類型所對應的至少一種候選重疊分割方案輸出至交互界面包括:
根據所述凸點和所述凹點,生成與所述類型相對應的至少一種候選重疊分割方案;
輸出所述候選重疊分割方案至交互界面。
8.根據權利要求1至7中任一項所述的方法,其特征在于,所述方法還包括:
若所述類型為S型,則判定所述染色體屬于單條染色體,并將所述初步分割圖像作為最終的染色體分割結果進行輸出;
若所述類型為T型、X型和H型中的任意一種,則判定所述染色體屬于重疊的染色體;其中,所述T型、X型和H型用于表征染色體的不同重疊類型。
9.一種染色體分割裝置,其特征在于,所述裝置包括:
類型識別模塊,用于提取染色體的初步分割圖像中染色體輪廓的骨架線;根據所述骨架線,確定所述染色體的類型;
交互模塊,用于若所述類型表征所述染色體屬于重疊的染色體,則將所述類型所對應的至少一種候選重疊分割方案輸出至交互界面;獲取基于交互界面從所述候選重疊分割方案中指定的目標重疊分割方案;
分割模塊,用于執行目標重疊分割方案,以將所述初步分割圖像中重疊的染色體分割為單條染色體。
10.一種計算機設備,包括存儲器和處理器,所述存儲器存儲有計算機程序,其特征在于,所述處理器執行所述計算機程序時實現權利要求1至8中任一項所述的方法的步驟。
11.一種計算機可讀存儲介質,其上存儲有計算機程序,其特征在于,所述計算機程序被處理器執行時實現權利要求1至8中任一項所述的方法的步驟。
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