[發明專利]染色體分割方法、裝置、設備和存儲介質在審
| 申請號: | 202011375268.5 | 申請日: | 2020-11-30 |
| 公開(公告)號: | CN114581457A | 公開(公告)日: | 2022-06-03 |
| 發明(設計)人: | 許德鵬;劉曉康;王雪峰;陳齊文 | 申請(專利權)人: | 深圳市瑞圖生物技術有限公司 |
| 主分類號: | G06T7/11 | 分類號: | G06T7/11;G06T7/155;G16H30/20 |
| 代理公司: | 華進聯合專利商標代理有限公司 44224 | 代理人: | 黃晶晶 |
| 地址: | 518101 廣東省深圳市寶安區福*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 染色體 分割 方法 裝置 設備 存儲 介質 | ||
本申請涉及一種染色體分割方法、裝置、計算機設備和存儲介質。所述方法包括:提取染色體的初步分割圖像中染色體輪廓的骨架線;根據所述骨架線,確定所述染色體的類型;若所述類型表征所述染色體屬于重疊的染色體,則將所述類型所對應的至少一種候選重疊分割方案輸出至交互界面;獲取基于交互界面從所述候選重疊分割方案中指定的目標重疊分割方案;執行目標重疊分割方案,以將初步分割圖像中重疊的染色體分割為單條染色體。本方案能夠提高分割準確性。
技術領域
本申請涉及計算機技術領域以及圖像處理技術領域,特別是涉及一種染色體分割方法、裝置、設備和存儲介質。
背景技術
隨著科學技術的發展,各種先進的分析技術層出不窮。其中,對染色體圖像進行分割在很多領域中(比如,醫學領域或遺傳學研究領域),都起著非常重大的作用。
傳統的圖像分割方法所采用的分割方式比較統一、固定。然而,染色體圖像本身容易出現很多復雜的情況,比如,染色體通常情況下會出現重疊的情況。如果使用傳統的固定、統一的分割方式,根本無法適用于染色體圖像復雜的情況,容易產生誤分割。因此,傳統方法的分割準確性比較低。
發明內容
基于此,有必要針對上述技術問題,提供一種能夠提高分割準確性的染色體分割方法、裝置、計算機設備和存儲介質。
一種染色體分割方法,所述方法包括:
提取染色體的初步分割圖像中染色體輪廓的骨架線;
根據所述骨架線,確定所述染色體的類型;
若所述類型表征所述染色體屬于重疊的染色體,則
將所述類型所對應的至少一種候選重疊分割方案輸出至交互界面;
獲取基于交互界面從所述候選重疊分割方案中指定的目標重疊分割方案;
執行目標重疊分割方案,以將所述初步分割圖像中重疊的染色體分割為單條染色體。
在其中一個實施例中,所述方法還包括:
將初始的染色體圖像轉換為灰度圖;
將所述灰度圖進行自適應直方圖均衡化處理;
對經過自適應直方圖均衡化處理后的圖像進行二值化分割處理,得到染色體的初步分割圖像。
在其中一個實施例中,所述提取染色體的初步分割圖像中染色體輪廓的骨架線包括:
從染色體的初步分割圖像中提取染色體輪廓;
按照輪廓像素點數量和輪廓圓度中至少一種,對所述染色體輪廓進行篩選;
提取篩選后保留的染色體輪廓的骨架線。
在其中一個實施例中,所述方法還包括:
計算所述染色體輪廓上各像素點到區域中心的平均距離;
計算所述染色體輪廓上各像素點分別到所述區域中心的距離與所述平均距離之間的偏差;
根據所述平均距離和所述偏差,確定所述染色體輪廓的輪廓圓度。
在其中一個實施例中,所述方法還包括:
確定篩選后保留的染色體輪廓上每個像素點到所述骨架線的平均最短距離;
從篩選后保留的所述染色體輪廓中,移除所述平均距離小于預設距離閾值的染色體輪廓;
根據滑動的均值濾波器,對移除后剩余的染色體輪廓上的各像素點的位置坐標進行平滑處理。
在其中一個實施例中,所述根據所述骨架線,確定所述染色體的類型包括:
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