[發明專利]一種通過指尖血評估生育力相關基因的檢測方法及系統

在審

• 申請號: 202011315201.2
• 申請日: 2020-11-20
• 公開（公告）號: CN112375819A
• 公開（公告）日: 2021-02-19
• 發明（設計）人: 龔航;陳家生
• 申請（專利權）人: 和卓生物科技（上海）有限公司
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883
• 代理公司: 上海百一領御專利代理事務所(普通合伙) 31243
• 代理人: 馬育麟

本發明屬于生物醫藥領域，涉及一種通過指尖血評估生育力的基因檢測方法及其應用。所述的檢測方法包括：獲取指尖血樣，采用磁珠法抽提干血斑核酸；構建文庫并質控分析插入片段分布情況；根據生育力相關基因設計探針，測序數據獲得后，對數據進行質控和低質量過濾，與人類參考基因組比對并進行SNP分型；通過常用數據庫和/或工具對變異進行注釋；通過與公共數據庫以及自有數據庫比對，集成LIMS系統從而形成檢測分析報告；使用流程跟蹤模塊跟蹤每一個檢測步驟直至形成檢測報告。本發明還包括相應的檢測系統。本發明的檢測方法和系統檢測全面、結果準確、科學專業，能夠用于查明不孕不育遺傳學病因，指導輔助生殖方案。

技術領域

本發明屬于生物醫藥領域，涉及基因檢測方法，尤其涉及一種通過指尖血評估生育力相關基因的檢測方法、系統及其應用。

背景技術

根據世界衛生組織的規定，育齡的夫婦在有規律的性生活的情況下，沒有采取任何避孕措施，超過1年不懷孕屬于不孕不育癥。

不孕不育的原因多種多樣。因男性原因導致配偶不孕者，稱男性不孕癥或男性不育癥，習慣稱男性不育。男性不育的原因主要有：(1)精子數量不足：正常男子每毫升精液能產生至少2千萬個精子，如果少于2千萬個精子則為數量不足。(2)精子活力不足：快速向前精子少于25％。(3)精子形態不良：畸形精子大于70％。(4)無精子或精子完全缺乏：睪丸功能衰竭、輸精管堵塞及雙側輸精管缺如。(5)性功能障礙：射精障礙或陽痿。(6)死精子癥、逆行射精及血精子癥。(7)內分泌功能異常，等等。女性的原因主要有：(1)輸卵管因素：輸卵管受損或阻塞，阻礙了卵子與精子的遇合。(2)卵巢因素：排卵異常或各種卵巢腫瘤性病變。(3)宮頸因素：子宮頸發育及腺體分泌不良或子宮頸各種炎癥及腫瘤。(4) 子宮因素：先天發育不良、畸形、子宮腫瘤及子宮內膜異位癥。(5)子宮內膜增殖癥、子宮內膜炎癥及粘膜下腫瘤，等等。出現上述癥狀的原因很多。

目前醫院針對不孕不育癥患者的檢測項目很多也很專業，例如通過采集靜脈血來操作必須由專業人員操作完成，且必須去醫療機構進行血樣采集。很多患者礙于情面或者工作繁忙，不愿意去醫療結構參加不孕不育相關的門診，但是所謂“不孝有三，無后為大”，長期處于備孕狀態的育齡夫婦不僅需要面對自我疑惑，更要承受來自長輩、社會的質疑。

但是，到目前為止，尚未有關于幫助育齡夫婦了解不孕不育原因的快捷檢測方法。

發明內容

本發明提供了一種通過指尖血評估生育力相關基因的檢測方法，旨在通過采集受檢者指尖血，用特定采樣盒制作成血斑，從待測樣本中提取遺傳物質DNA，通過探針雜交捕獲的方法，捕獲中國人群常見生育率相關基因的外顯子以及UTR±10bp以內的區域，并進行高通量測序，以檢測相關基因的突變情況。

本發明提供了一種通過指尖血評估生育力相關基因的檢測方法，所述的檢測方法包括：

獲取指尖血樣，所述的指尖血樣包括至少一個由20-50微升血樣形成的干血斑；

采用磁珠法抽提干血斑核酸；

對所抽提DNA進行定量、打斷并構建文庫，對所構建文庫質控分析插入片段分布情況，插入片段成正態分布，峰值在320bp-380bp之間；

使用識別生育力相關基因的探針進行檢測，所述的探針的覆蓋度不小于95％；

測序數據獲得后，對數據進行質控和低質量過濾，與人類參考基因組比對，并進行SNP 分型；

通過常用數據庫和/或工具對變異進行注釋，通過與公共數據庫以及自有數據庫比對，集成公司自有實驗室管理系統(LIMS系統)，形成檢測分析報告。

使用流程跟蹤模塊跟蹤每一個步驟直至形成檢測報告。

較好的，所述的獲取指尖血樣是在非醫療機構，使用采血針自行獲取20-50微升血樣。