[發明專利]一種用于腫瘤樣本NGS檢測流程的質控系統和方法

有效

• 申請號: 202011291492.6
• 申請日: 2020-11-18
• 公開（公告）號: CN112102882B
• 公開（公告）日: 2021-02-12
• 發明（設計）人: 史善甫;丁首太;嚴志祥;沈偉強;羅鵬;蔡麗君
• 申請（專利權）人: 上海鼎晶生物醫藥科技股份有限公司
• 主分類號: G16B30/00
• 分類號: G16B30/00;G16B25/20;G06N3/00
• 代理公司: 北京哌智科創知識產權代理事務所(普通合伙) 11745
• 代理人: 蔣輝

1.一種用于腫瘤樣本NGS檢測流程的質控系統，包括實驗數據存儲系統、質控數據計算系統、質控數據統計系統和質控結果展示系統，其特征在于：所述實驗數據存儲系統與所述質控數據計算系統信號相連，所述質控數據計算系統與所述質控數據統計系統信號相連，所述質控結果展示系統與所述質控數據統計系統信號相連，其中：

所述實驗數據存儲系統用于以臨床樣本為項目編號，存儲實驗中產生的實驗數據，分析流程產生的數據，以及質控結果信息；所述實驗數據存儲系統包括登錄模塊、數據存儲API接口、數據下載API接口和數據庫管理模塊；所述登錄模塊用于用戶的登錄；所述數據存儲API接口用于獲取數據的上傳；所述數據下載API接口用于數據的下載；所述數據庫管理模塊用于對錄入的數據進行管理；

所述質控數據計算系統用于對腫瘤樣本檢測流程中的實驗數據進行處理，計算歷史樣本實驗過程中不同步驟的細胞數，利用不同步驟的細胞數生成比值，把比值特征與各步驟的細胞數原特征一起合并，并將歷史樣本的質控結果進行量化，生成處理的歷史樣本數據集；

計算待測樣本實驗過程中不同步驟的細胞數，利用不同步驟的細胞數生成比值，把比值特征與各步驟的細胞數原特征一起合并，生成處理的待測樣本數據集；

所述質控數據計算系統包括第一數據讀取模塊、數據整理模塊、數據計算模塊和數據輸出模塊，所述第一數據讀取模塊與所述數據庫管理模塊信號相連，所述數據整理模塊與所述第一數據讀取模塊信號相連，所述數據計算模塊與所述數據整理模塊信號相連，所述數據輸出模塊與所述數據計算模塊信號相連；

所述質控數據統計系統用于利用質控數據計算系統生成的處理的歷史樣本數據集，并基于隨機森林算法對數據集進行分析，生成質控的最佳訓練模型；所述質控數據統計系統包括第二數據讀取模塊、數據預處理模塊、機器學習建模模塊和結果預測模塊，所述第二數據讀取模塊與所述數據輸出模塊信號相連，所述數據預處理模塊與所述第二數據讀取模塊信號相連，所述機器學習建模模塊與所述數據預處理模塊信號相連，所述結果預測模塊與所述機器學習建模模塊信號相連；

所述質控結果展示系統用于將處理的待測樣本數據集與質控的最佳訓練模型相擬合，利用可視化的方式展示待測樣本的全面質控結果，所述質控結果展示系統包括第三數據讀取模塊、結果整理與可視化模塊及結果展示模塊，所述第三數據讀取模塊與所述結果預測模塊信號相連，所述結果整理與可視化模塊同所述第三數據讀取模塊信號相連，所述結果展示模塊同所述結果整理與可視化模塊信號相連。