[發明專利]用于前列腺癌復發的預后的基因表達面板

在審

• 申請號: 202011258642.3
• 申請日: 2015-01-16
• 公開（公告）號: CN112322735A
• 公開（公告）日: 2021-02-05
• 發明（設計）人: 瑪麗安娜·卡拉·斯特恩;亞采克·平斯基;范建兵
• 申請（專利權）人: 啟迪公司;南加利福尼亞大學
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886
• 代理公司: 北京連和連知識產權代理有限公司 11278
• 代理人: 楊帆

本發明公開了一種用于預測個體中前列腺癌的進展的系統，該系統包含：裝置，該裝置被配置為確定來自從個體采取的生物樣品的核酸的表達水平；以及硬件邏輯，該硬件邏輯被設計或被配置為執行操作，該操作包含：(a)接收來自從個體采取的生物樣品的標記基因的集合的表達水平，其中標記基因的集合包括CLEC4F、OAS2、PGC、UPK3B、PCBP3、EDARADD、GPR81、GLDC、RAPGEF1、DUOXA2、C2或f43、DUOX1、或NPR3；(b)將表達水平應用到使標記基因的集合的表達水平與前列腺癌進展關聯的預測模型；以及(c)評估預測模型的輸出以預測所述個體中前列腺癌的進展。

本申請是申請人為啟迪公司、南加利福尼亞大學，發明名稱為“用于前列腺癌復發的預后的基因表達面板”，國家申請號為201580004797.5，進入中國國家階段日期為2016年07月15日(國際申請日為2015年01月16日)的發明專利申請的分案申請。

相關申請的交叉引用

本申請要求美國臨時申請號為61/928,361、申請日為2014年1月16日的美國專利申請的益處和優先權，該優先權的內容通過引用以其整體在此并入并且用于所用目的。

背景技術

前列腺癌(PCa)是美國男性中最常見的癌癥并且是癌癥死亡的第二主要原因。治療人類前列腺癌的進展已由于發現組織學上相同的癌癥可以表現出廣泛不同的臨床行為而受到阻礙。例如，在診斷有前列腺癌的一些男性中，疾病隨延長的自然發展過程緩慢地進展，而在其它患者中，疾病進展可以是迅速的并且確定的局部治療可能是無效的。

改進的早期檢測已導致更多的男性被診斷患有局部的前列腺癌(PCa)；然而，在診斷后的臨床病程是多樣化的，觀察到的復發多達患者的三分之一，甚至在根治性前列腺切除術之后。因此，大約60％被診斷為低風險的男性選擇進行RP作為他們的主要治療。然而，如果神經保留外科手術不可能，則RP可能攜帶影響生活質量的潛在副作用，比如尿失禁和陽痿。近距離放射治療法和外部射線束放射治療法也是治療的選項，是約15％的低風險患者的主要治療的選擇。主動監測或觀察等待是被大多數患者最少喜愛的選擇，在美國僅僅約10％的患者選擇主動監測。延遲治療對于可能具有不會進一步進展的腫瘤的低風險疾病的男性是期望的，以便降低與生活質量相關的健康的副作用的負面影響。據報道，選擇根治性前列腺切除術的約30％的患者真實地具有疾病復發的低風險并且如果他們選擇主動監測(AS)則可以受益更多。相反地，歸類為PCa相關的死亡的高風險的男性將因在診斷時對他們的疾病積極地治療而受益，而不是等待疾病復發征兆發生。所有其他患者應該經歷并且保持AS，除非癌癥進展的標志迫使進行確定的局部治療。PIVOT(前列腺癌干預與觀察)試驗，第一次隨機試驗將處在等待觀察的男性與經受根治性前列腺切除術至少12年隨訪的男性比較，表明盡管只有一小群男性可以從RP中受益，但是轉移和PCa相關的死亡的風險在后續7-9年隨訪的人群之間看出沒有差異。盡管臨床變量，比如活檢的格里森評分(Gleason score)、患者年齡、PSA(前列腺特異性抗原)水平、PSA動力學(PSA隨時間上升速度)、腫瘤分級和體積已作為可能預測因素被研究，但是在這點上，還沒有確定PCa進展的決定性預測因素。

甚至在根治性前列腺切除術之后，多達三分之一的患者可以在血清PSA水平再次可檢測時體驗到生化復發(BCR)(也稱為PSA復發)。報告顯示BCR的18％至29％的個體可進展為轉移性疾病，表明BCR是暗示的且不是確定的可能惡性疾病。因此，識別RP之后處在復發危險中的患者是期望的，以便在手術后更積極地治療他們。

總的來說，可以用來確定局部的PCa患者的預后的當前工具限制了預測準確性。這些工具包括目的在于臨床中容易應用的模型和列線圖，其使用比如格里森評分、臨床分期、手術前的PSA水平、和在手術時收集的一些模型數據這樣的臨床變量的組合。

發明內容

本發明公開了一種用于預測個體中前列腺癌的進展的系統，所述系統包含：

裝置，所述裝置被配置為確定來自從所述個體采取的生物樣品的核酸的表達水平；以及