[發明專利]用于前列腺癌復發的預后的基因表達面板

在審

• 申請號: 202011258642.3
• 申請日: 2015-01-16
• 公開（公告）號: CN112322735A
• 公開（公告）日: 2021-02-05
• 發明（設計）人: 瑪麗安娜·卡拉·斯特恩;亞采克·平斯基;范建兵
• 申請（專利權）人: 啟迪公司;南加利福尼亞大學
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886
• 代理公司: 北京連和連知識產權代理有限公司 11278
• 代理人: 楊帆

1.一種用于預測個體中前列腺癌的進展的系統，所述系統包含：

裝置，所述裝置被配置為確定來自從所述個體采取的生物樣品的核酸的表達水平；以及

硬件邏輯，所述硬件邏輯被設計或被配置為執行操作，所述操作包含：

(a)接收來自從所述個體采取的生物樣品的標記基因的集合的表達水平，其中所述標記基因的集合包括CLEC4F、OAS2、PGC、UPK3B、PCBP3、EDARADD、GPR81、GLDC、RAPGEF1、DUOXA2、C2或f43、DUOX1、或NPR3；

(b)將所述表達水平應用到使所述標記基因的集合的表達水平與前列腺癌進展關聯的預測模型；以及

(c)評估所述預測模型的輸出以預測所述個體中前列腺癌的進展。

2.根據權利要求1所述的系統，其中所述標記基因的集合進一步包括從以下組成的組中選擇的至少一個附加基因：NKX2-1、UPK1A、ADRA2C、ABCC11、MMP11、CPVL、ZYG11A、CLEC4F、OAS2、PGC、UPK3B、PCBP3、ABLIM1、EDARADD、GPR81、MYBPC1、F10、KCNA3、GLDC、KCNQ2、RAPGEF1、TUBB2B、MB、DUOXA1、C2或f43、DUOX1、PCA3和NPR3。

3.一種用于預測個體中前列腺癌的進展的系統，所述系統包含：

裝置，所述裝置被配置為確定來自從所述個體采取的生物樣品的核酸的表達水平；以及

硬件邏輯，所述硬件邏輯被設計或被配置為執行操作，其中患者經受根治性前列腺切除術，所述操作包含：

(a)接收來自所述個體的標記基因的集合的表達水平，其中所述標記基因的集合包括CLEC4F、OAS2、PGC、UPK3B、PCBP3、EDARADD、GPR81、GLDC、RAPGEFl、DUOXA2、C2或f43、DUOX1、或NPR3；

(b)將所述表達水平應用到使所述標記基因的集合的表達水平與前列腺癌進展關聯的預測模型；以及

(c)評估所述預測模型的輸出以預測所述個體中前列腺癌的進展。

4.根據權利要求3所述的系統，其中所述標記基因的集合進一步包括從以下組成的組中選擇的至少一個附加基因：NKX2-1、UPK1A、ADRA2C、ABCC11、MMP11、CPVL、ZYG11A、CLEC4F、OAS2、PGC、UPK3B、PCBP3、ABLIM1、EDARADD、GPR81、MYBPC1、F10、KCNA3、GLDC、KCNQ2、RAPGEF1、TUBB2B、MB、DUOXA1、C2或f43、DUOX1、PCA3和NPR3。

5.一種用于預測個體中前列腺癌的進展的系統，所述系統包含：

裝置，所述裝置被配置為確定來自從所述個體采取的生物樣品的核酸的表達水平，其中所述生物樣品包含前列腺組織樣品；以及

硬件邏輯，所述硬件邏輯被設計或被配置為執行操作，所述操作包含：

(a)接收來自所述個體的標記基因的集合的表達水平，其中所述標記基因的集合包括：CLEC4F、OAS2、PGC、UPK3B、PCBP3、EDARADD、GPR81、GLDC、RAPGEF1、DUOXA2、C2或f43、DUOX1、或NPR3；

(b)將所述表達水平應用到使所述標記基因的集合的表達水平與前列腺癌進展關聯的預測模型；以及

(c)評估所述預測模型的輸出以預測所述個體中前列腺癌的進展。

6.根據權利要求5所述的系統，其中所述標記基因的集合進一步包括從以下組成的組中選擇的至少一個附加基因：UPK1A、ADRA2C、MMP11、CPVL、ZYG11A、CLEC4F、OAS2、PGC、UPK3B、PCBP3、ABLIM1、EDARADD、GPR81、MYBPC1、F10、KCNA3、GLDC、KCNQ2、RAPGEF1、TUBB2B、MB、DUOXA1、C2或f43、DUOX1、PCA3和NPR3。